27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0891 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0891  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  100 
 
 
258 aa  508  1e-143  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.101452  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1095  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  40.62 
 
 
268 aa  161  1e-38  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1268  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  36.27 
 
 
268 aa  132  5e-30  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.286326  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0741  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.43 
 
 
228 aa  86.3  5e-16  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.156441  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0790  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.18 
 
 
220 aa  85.9  6e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0134315  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0860  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  30.18 
 
 
220 aa  85.1  0.000000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.869697  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1243  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  29.28 
 
 
220 aa  82  0.000000000000009  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.209748  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1123  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  27 
 
 
289 aa  56.2  0.0000005  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  unclonable  0.0000000000220607  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0923  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.18 
 
 
244 aa  53.5  0.000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0332  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30 
 
 
310 aa  53.5  0.000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0294  flagellar protein FlgA  29.82 
 
 
157 aa  50.8  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3099  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  30 
 
 
236 aa  50.1  0.00004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0845  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  26.61 
 
 
319 aa  50.1  0.00004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0118295  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0595  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  22.77 
 
 
326 aa  48.5  0.0001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0396  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein-like protein  33.33 
 
 
233 aa  47  0.0003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0678517  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01281  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.83 
 
 
248 aa  47  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4670  flagella basal body P-ring formation protein FlgA  23.78 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0417207 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16560  Flagellar basal body P-ring biosynthesis protein  26.67 
 
 
336 aa  44.3  0.002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0109519  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3735  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.43 
 
 
250 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.410468  normal  0.976708 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3090  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  26.76 
 
 
259 aa  43.1  0.004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1780  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.64 
 
 
232 aa  42.7  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.498263  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2683  flageller protein FlgA  23.83 
 
 
235 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4105  SAF domain-containing protein  21.17 
 
 
238 aa  42.4  0.007  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2844  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  22.92 
 
 
360 aa  42  0.009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4394  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.29 
 
 
225 aa  42  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1460  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  24.29 
 
 
250 aa  42  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20740  flagellar basal body P-ring biosynthesis protein FlgA  25.36 
 
 
232 aa  42  0.01  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>