181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0588 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0588  hypothetical protein  100 
 
 		 78 aa  161  3e-39  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.456844  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1849  hypothetical protein  71.62 
 
 		 75 aa  122  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1674  hypothetical protein  71.62 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1493  hypothetical protein  71.62 
 
 		 75 aa  122  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0365  hypothetical protein  68.49 
 
 		 75 aa  117  6e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1716  SirA family protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.762252  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1277  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.203301  normal  0.625411 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2705  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.280893 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2123  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.574865  normal  0.265989 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1154  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00380389  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1251  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.525922  normal  0.40175 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2030  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2181  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.325504  normal  0.0531342 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2165  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2128  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  6e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.845963  hitchhiker  0.00000520309 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1709  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0828513 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0109  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0110  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0105  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0110  hypothetical protein  59.74 
 
 		 77 aa  107  8.000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2271  hypothetical protein  61.04 
 
 		 77 aa  106  1e-22  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0112419 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0112  hypothetical protein  58.44 
 
 		 77 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1060  hypothetical protein  58.44 
 
 		 77 aa  104  3e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000235779  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0108  hypothetical protein  58.44 
 
 		 77 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0113  hypothetical protein  58.44 
 
 		 77 aa  105  3e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0497  hypothetical protein  60 
 
 		 79 aa  102  2e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3897  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0642  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0393171 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3809  hypothetical protein  60 
 
 		 89 aa  101  4e-21  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0446  hypothetical protein  58.57 
 
 		 78 aa  93.2  9e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0828  hypothetical protein  43.66 
 
 		 81 aa  84  6e-16  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17350  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1507  hypothetical protein  50 
 
 		 82 aa  80.5  0.000000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1543  hypothetical protein  52.5 
 
 		 76 aa  77.8  0.00000000000005  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_19740  hypothetical protein  42.31 
 
 		 88 aa  75.5  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0337318  normal  0.0110123 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1812  SirA family protein  47.14 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.000000207986  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1758  SirA family protein  47.14 
 
 		 79 aa  69.3  0.00000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000708198  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0510  SirA family protein  48.61 
 
 		 78 aa  67.8  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000586624  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4504  hypothetical protein  38.89 
 
 		 76 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000117975 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0674  hypothetical protein  37.5 
 
 		 76 aa  57.8  0.00000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.384362  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0940  hypothetical protein  38.89 
 
 		 75 aa  57  0.00000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000596514  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0939  hypothetical protein  41.18 
 
 		 75 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000269274  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0740  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0137112  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0688  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.301237  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0778  hypothetical protein  36.11 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0872  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000063042 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2100  hypothetical protein  43.33 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000005  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1293  SirA family protein  37.18 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0832  hypothetical protein  36.11 
 
 		 76 aa  53.9  0.0000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00406829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1817  ArsR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 184 aa  52.8  0.000001  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0130872  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1466  SirA family protein  41.43 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0688  SirA family protein  36.11 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1548  SirA family protein  34.25 
 
 		 80 aa  52.8  0.000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.0325283 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0868  hypothetical protein  36.11 
 
 		 75 aa  52  0.000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2894  SirA family protein  36.11 
 
 		 75 aa  51.6  0.000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0033  hypothetical protein  35.29 
 
 		 78 aa  50.8  0.000006  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.00000671264  normal  0.064173 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1860  SirA family protein  36.76 
 
 		 78 aa  50.8  0.000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000771633  normal  0.0684437 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4174  SirA family protein  38.24 
 
 		 85 aa  50.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.197617  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_04360  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  29.85 
 
 		 73 aa  49.7  0.00001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00145857 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1209  SirA family protein  36.62 
 
 		 82 aa  50.1  0.00001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2642  SirA family protein  38.67 
 
 		 201 aa  49.3  0.00002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.140879  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1763  SirA family protein  34.72 
 
 		 181 aa  48.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000144222  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0584  SirA family protein  35.21 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.255131  hitchhiker  0.00753187 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2098  SirA family protein  31.58 
 
 		 80 aa  48.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2572  SirA family protein  31.58 
 
 		 80 aa  48.1  0.00003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.410608  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  30.67 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0950  SirA family protein  33.78 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000954852  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2429  SirA-like  38.03 
 
 		 91 aa  48.1  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00560  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  34.72 
 
 		 76 aa  48.1  0.00004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0561  SirA family protein  33.33 
 
 		 75 aa  48.1  0.00004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00147914  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4317  SirA family protein  32 
 
 		 81 aa  47.4  0.00006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.602123  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1968  SirA-like  34.67 
 
 		 82 aa  47.4  0.00006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000028775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0373  SirA family protein  42.03 
 
 		 84 aa  47.4  0.00006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1982  hypothetical protein  29.87 
 
 		 79 aa  47.4  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.948606  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0089  SirA-like protein  33.82 
 
 		 73 aa  47.4  0.00007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.741748  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0643  SirA family protein  32.35 
 
 		 70 aa  47.4  0.00007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  38.57 
 
 		 75 aa  47  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1366  SirA family protein  32.35 
 
 		 70 aa  47  0.00009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0894  SirA family protein  41.18 
 
 		 89 aa  47  0.00009  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0631  SirA family protein  28.57 
 
 		 76 aa  47  0.0001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.161479 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0810  hypothetical protein  32.88 
 
 		 75 aa  46.2  0.0001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.566586 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  32.35 
 
 		 76 aa  46.6  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1310  SirA family protein  32.35 
 
 		 70 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0903  SirA family protein  35.21 
 
 		 94 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0179319  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0166  SirA family protein  32.43 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.766434  normal  0.899413 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  34.25 
 
 		 78 aa  45.4  0.0002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1937  SirA family protein  30.14 
 
 		 76 aa  45.8  0.0002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.559837  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  33.33 
 
 		 77 aa  45.4  0.0002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0379  SirA family protein  46.81 
 
 		 325 aa  45.8  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3385  SirA family protein  33.33 
 
 		 81 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.719543  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0866  rhodanese domain-containing protein  30.14 
 
 		 186 aa  45.1  0.0003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0046  SirA family protein  37.14 
 
 		 75 aa  45.1  0.0003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1873  SirA-like  33.8 
 
 		 82 aa  45.4  0.0003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.265759  normal  0.477358 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1475  SirA family protein  36.21 
 
 		 82 aa  45.1  0.0003  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2217  hypothetical protein  27.27 
 
 		 76 aa  45.1  0.0004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.403117  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  30.99 
 
 		 77 aa  44.7  0.0004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0038  SirA family protein  26.92 
 
 		 78 aa  44.7  0.0004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  unclonable  0.00000000000000689982  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3728  SirA family protein  30.67 
 
 		 81 aa  45.1  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.288657  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  33.33 
 
 		 72 aa  44.7  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04730  predicted redox protein, regulator of disulfide bond formation  33.87 
 
 		 76 aa  44.7  0.0005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>