More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0562 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0562  putative methyl-accepting chemotaxis protein  100 
 
 		 530 aa  1053    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.191806  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1434  chemotaxis sensory transducer  42.16 
 
 		 530 aa  410  1e-113  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0544  MCP-domain signal transduction protein  40 
 
 		 530 aa  390  1e-107  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0975  membrane protein, putative, degenerate  38.59 
 
 		 530 aa  337  3.9999999999999995e-91  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1178  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.91 
 
 		 530 aa  229  7e-59  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1931  chemotaxis sensory transducer  34.12 
 
 		 621 aa  172  2e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1205  chemotaxis sensory transducer  33.15 
 
 		 713 aa  167  5.9999999999999996e-40  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1073  chemotaxis sensory transducer  33.78 
 
 		 633 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00919731  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1826  chemotaxis sensory transducer  30.84 
 
 		 650 aa  162  1e-38  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0106  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.95 
 
 		 540 aa  159  1e-37  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2141  chemotaxis sensory transducer  31.86 
 
 		 708 aa  159  1e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1937  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 541 aa  158  2e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.158854  normal  0.960341 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0582  methyl-accepting chemotaxis protein  26.34 
 
 		 696 aa  155  2e-36  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1930  chemotaxis sensory transducer  32.6 
 
 		 625 aa  153  8.999999999999999e-36  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1286  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.45 
 
 		 538 aa  152  1e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0819  chemotaxis sensory transducer  32.87 
 
 		 627 aa  152  2e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.113637  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0631  chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 		 656 aa  150  5e-35  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00821954  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0935  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  25.19 
 
 		 528 aa  150  8e-35  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.220244  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.43 
 
 		 538 aa  148  2.0000000000000003e-34  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0926  histidine kinase, HAMP region: chemotaxis sensory transducer  25.93 
 
 		 539 aa  147  4.0000000000000006e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0046  methyl-accepting chemotaxis protein  32.03 
 
 		 584 aa  147  5e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0019  methyl-accepting chemotaxis protein  32.03 
 
 		 593 aa  146  9e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.314472  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0377  Nitrate and nitrite sensing domain protein  30.9 
 
 		 661 aa  145  2e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000413313  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0840  cache domain-contain protein  31.28 
 
 		 566 aa  145  2e-33  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.287851  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000971  methyl-accepting chemotaxis protein  27.81 
 
 		 553 aa  143  8e-33  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.370017  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1331  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.01 
 
 		 563 aa  142  1.9999999999999998e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.158014  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001822  methyl-accepting chemotaxis protein  36.92 
 
 		 557 aa  142  1.9999999999999998e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000124429  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2035  putative transducer  31.28 
 
 		 626 aa  141  3e-32  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0113  chemotaxis sensory transducer  28.89 
 
 		 563 aa  141  3e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1023  methyl-accepting chemotaxis protein  30.55 
 
 		 578 aa  140  3.9999999999999997e-32  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003896  methyl-accepting chemotaxis protein  37.75 
 
 		 545 aa  139  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000288698  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003151  methyl-accepting chemotaxis protein  26.33 
 
 		 541 aa  138  2e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00103096  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0443  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.32 
 
 		 541 aa  137  4e-31  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0112  chemotaxis sensory transducer  29.75 
 
 		 563 aa  137  4e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3600  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.15 
 
 		 546 aa  137  6.0000000000000005e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0087  MCP-domain signal transduction protein  32.09 
 
 		 600 aa  137  6.0000000000000005e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0385  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.06 
 
 		 698 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0817491  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3709  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.96 
 
 		 546 aa  136  9.999999999999999e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2316  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 548 aa  135  1.9999999999999998e-30  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.0208981 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2596  methyl-accepting chemotaxis protein  31.44 
 
 		 564 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  unclonable  0.00000000000057467  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0103  methyl-accepting chemotaxis protein  33.33 
 
 		 521 aa  134  3e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4401  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.51 
 
 		 695 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.896591  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2955  chemotaxis sensory transducer  37.35 
 
 		 497 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0808  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.35 
 
 		 554 aa  133  6e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2346  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.1 
 
 		 564 aa  133  7.999999999999999e-30  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0916  methyl-accepting chemotaxis protein  28.74 
 
 		 543 aa  133  7.999999999999999e-30  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000029497  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1963  chemotaxis sensory transducer  28.42 
 
 		 535 aa  133  9e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0525  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  27.63 
 
 		 632 aa  132  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0549  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.33 
 
 		 640 aa  131  3e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.43692  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0391  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.01 
 
 		 499 aa  131  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0811848  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2544  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.84 
 
 		 633 aa  131  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00517521  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0470  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.82 
 
 		 668 aa  130  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0821  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.5 
 
 		 545 aa  130  6e-29  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000877148  hitchhiker  0.00000558474 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01753  hypothetical protein  37.34 
 
 		 545 aa  130  7.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3063  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.69 
 
 		 533 aa  130  7.000000000000001e-29  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.378908  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0908  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.43 
 
 		 543 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.073872  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1142  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0413666  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1176  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00652986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1082  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.6 
 
 		 495 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000101058  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.41 
 
 		 549 aa  129  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000597879  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2116  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.81 
 
 		 545 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3455  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0121993  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0837  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.33 
 
 		 554 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001073  N-acetylglucosamine regulated methyl-accepting chemotaxis protein  30.31 
 
 		 628 aa  128  2.0000000000000002e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1022  methyl-accepting chemotaxis protein  31.02 
 
 		 628 aa  129  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.771007  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2650  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.46 
 
 		 568 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0924  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3579  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 543 aa  129  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0986947 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03718  putative chemotaxis sensory protein  31.21 
 
 		 540 aa  129  2.0000000000000002e-28  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3382  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.12 
 
 		 543 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0942  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.99 
 
 		 495 aa  128  3e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  decreased coverage  0.000202207  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0959  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.06 
 
 		 543 aa  128  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.656726  normal  0.666936 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0237  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.21 
 
 		 632 aa  128  3e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  0.997473 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2254  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.72 
 
 		 545 aa  127  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.492 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06314  histidine kinase  29.43 
 
 		 623 aa  127  4.0000000000000003e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1139  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer, Cache sensor  29.25 
 
 		 630 aa  127  4.0000000000000003e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.584827 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_1102  methyl-accepting chemotaxis protein  29.9 
 
 		 638 aa  127  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3311  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.61 
 
 		 547 aa  127  5e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.691655  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3213  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  34.26 
 
 		 495 aa  127  6e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.023485  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_56010  chemotactic transducer PctB  29.97 
 
 		 629 aa  127  6e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2193  methyl-accepting chemotaxis protein  34.6 
 
 		 697 aa  127  7e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55960  chemotactic transducer PctC  27.96 
 
 		 632 aa  127  7e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.289325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1310  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  32.76 
 
 		 497 aa  126  8.000000000000001e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.615607  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4877  chemotactic transducer PctB  29.97 
 
 		 629 aa  126  9e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.164155  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0923  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.78 
 
 		 543 aa  126  9e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2240  methyl-accepting chemotaxis protein  30.08 
 
 		 545 aa  125  1e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4874  chemotactic transducer PctC  27.96 
 
 		 632 aa  125  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.153332  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1586  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.39 
 
 		 626 aa  126  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2364  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.23 
 
 		 622 aa  126  1e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.493821  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0809  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.55 
 
 		 532 aa  125  2e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.826751  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0209  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.42 
 
 		 658 aa  125  2e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.603066  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1767  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.381763  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1845  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.53 
 
 		 545 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1770  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.8 
 
 		 538 aa  125  2e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2880  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.14 
 
 		 558 aa  125  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0400  methyl-accepting chemotaxis protein  25.73 
 
 		 549 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.431065  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0401  methyl-accepting chemotaxis protein, putative  28.69 
 
 		 539 aa  124  3e-27  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.395676  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1880  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer with Cache sensor  30.57 
 
 		 628 aa  124  3e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.454316  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3309  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.97 
 
 		 625 aa  124  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.776822 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05150  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.88 
 
 		 650 aa  124  3e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>