59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0485 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0485  ATPase  100 
 
 		 454 aa  930    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4501  ATPase  39.34 
 
 		 462 aa  320  3e-86  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2362  ATPase  36.66 
 
 		 464 aa  297  2e-79  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2684  ATPase  38 
 
 		 463 aa  293  5e-78  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0175  ATPase  36.18 
 
 		 469 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.231845 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2649  ATPase  35.48 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2063  ATPase  31.92 
 
 		 464 aa  238  2e-61  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2641  ATPase  33.1 
 
 		 458 aa  237  4e-61  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.337326  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2436  ATPase  31.18 
 
 		 460 aa  231  3e-59  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1193  ATPase  32.43 
 
 		 457 aa  231  3e-59  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.460644  normal  0.228765 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0874  ATPase  31.88 
 
 		 456 aa  231  3e-59  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0559719  n/a   
 
 
-
 
NC_013746  Htur_4809  ATPase  32.71 
 
 		 460 aa  225  1e-57  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2804  ATPase  32.48 
 
 		 463 aa  224  2e-57  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4044  ATPase  31.57 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2218  ATPase  32.48 
 
 		 463 aa  223  4e-57  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.747327 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1429  putative AAA+ superfamily ATPase  31.8 
 
 		 473 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.541066  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1821  ATPase  32.87 
 
 		 450 aa  221  1.9999999999999999e-56  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1537  ATPase  32.49 
 
 		 464 aa  219  1e-55  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.479678  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2821  ATPase  29.42 
 
 		 474 aa  216  5e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.000929757  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0133  DUF234 DEXX-box ATPase  30.54 
 
 		 462 aa  208  2e-52  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0812652  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1512  putative AAA+ superfamily ATPase  29.84 
 
 		 470 aa  207  2e-52  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.406409  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2275  ATPase  29.62 
 
 		 496 aa  204  2e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4199  ATPase  30.79 
 
 		 471 aa  202  9.999999999999999e-51  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.593601  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1093  ATPase  32.35 
 
 		 457 aa  197  3e-49  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1051  ATPase  32.43 
 
 		 431 aa  196  9e-49  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.709814  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0533  ATPase  30.59 
 
 		 439 aa  187  4e-46  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.543241  normal  0.111274 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0736  ATPase  28.14 
 
 		 443 aa  184  2.0000000000000003e-45  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.299447  normal  0.251724 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2719  ATPase  32.57 
 
 		 420 aa  181  2.9999999999999997e-44  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0484066  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1767  ATPase  30.28 
 
 		 456 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.53247  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2667  DUF234 DEXX-box ATPase  31.05 
 
 		 478 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.578936 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1083  ATPase  28.79 
 
 		 469 aa  176  5e-43  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1446  ATPase  30.31 
 
 		 439 aa  171  2e-41  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.239907 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2620  ATPase  26.47 
 
 		 487 aa  170  6e-41  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.186456 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1683  ATPase  29.65 
 
 		 456 aa  160  5e-38  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0421559  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0415  ATPase  28.44 
 
 		 476 aa  141  1.9999999999999998e-32  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.336627  normal  0.189156 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1345  ATPase  29.13 
 
 		 456 aa  133  7.999999999999999e-30  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2329  hypothetical protein  27.12 
 
 		 472 aa  129  1.0000000000000001e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_10540  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  22.6 
 
 		 509 aa  120  3.9999999999999996e-26  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.0000147633  hitchhiker  0.0000000237286 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1424  ATPase  26.48 
 
 		 472 aa  120  6e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.846928  normal  0.285417 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2879  ATPase  24.81 
 
 		 470 aa  118  3e-25  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1281  hypothetical protein  26.46 
 
 		 475 aa  115  2.0000000000000002e-24  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1025  ATPase  22.51 
 
 		 454 aa  102  2e-20  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.656086  normal  0.0180232 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0310  ATPase  25.99 
 
 		 472 aa  99.4  1e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.568965  hitchhiker  0.000284685 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4522  ATPase  22.86 
 
 		 480 aa  97.8  4e-19  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1177  ATPase  25.52 
 
 		 407 aa  90.5  6e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.0919322 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02740  predicted ATPase (AAA+ superfamily)  23.48 
 
 		 474 aa  85.5  0.000000000000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2557  ATPase  24.1 
 
 		 485 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.928709  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3408  ATPase  24.37 
 
 		 498 aa  76.3  0.000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0498  hypothetical protein  48.33 
 
 		 105 aa  56.2  0.000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0081  ATPase  28.32 
 
 		 307 aa  52.8  0.00001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00107547  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1841  DUF234 DEXX-box ATPase  25.39 
 
 		 313 aa  52  0.00002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1794  ATPase  30.41 
 
 		 365 aa  48.5  0.0002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0171546  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0594  conserved hypothetical protein (DUF234 domain protein)  27.92 
 
 		 283 aa  48.5  0.0003  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000231419  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0503  ATPase  25.12 
 
 		 377 aa  48.1  0.0004  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.241974 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2354  ATPase (AAA+ superfamily)-like protein  23.55 
 
 		 506 aa  47.4  0.0006  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0945785 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0433  ATPase  32.14 
 
 		 359 aa  46.2  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.520428  hitchhiker  0.00910824 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0150  ATPase  23.83 
 
 		 360 aa  46.2  0.001  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1739  ATPase  30.77 
 
 		 383 aa  44.3  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1237  ATPase  29.41 
 
 		 261 aa  44.3  0.005  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>