15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0461 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0461  surface layer protein SapB9  100 
 
 
941 aa  1798    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0481  surface array protein  60.52 
 
 
921 aa  964    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.18804  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0484  hypothetical protein  58.09 
 
 
939 aa  897    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0960554  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0456  surface array protein  83 
 
 
1164 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.182741  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0462  surface array protein  83.86 
 
 
1106 aa  398  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0464  surface array protein  85.37 
 
 
1257 aa  397  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.143582  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0478  surface layer protein SapA12  83.86 
 
 
1109 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0486  surface array protein  83.86 
 
 
1106 aa  398  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0490  surface array protein  83 
 
 
1292 aa  399  1e-109  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.799434  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3963  hypothetical protein  37.59 
 
 
1083 aa  67.8  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1716  hemolysin-type calcium-binding region  29.09 
 
 
929 aa  62.4  0.00000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.852019  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0037  hemolysin-type calcium-binding region  32.24 
 
 
830 aa  52.8  0.00003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.475959  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1726  hemolysin-type calcium-binding region  41.33 
 
 
1144 aa  49.3  0.0003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.57086  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1227  hypothetical protein  26.67 
 
 
1037 aa  47.4  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008042  TM1040_3847  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  24.64 
 
 
862 aa  44.7  0.008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0267301  normal  0.766221 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>