183 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0453 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0453  nickel-dependent hydrogenases B-type cytochrome subunit family protein  100 
 
 		 365 aa  746    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1301  Diheme cytochrome c  35.05 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0744  cytochrome B561  28.57 
 
 		 387 aa  194  2e-48  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0597147  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0733  cytochrome B561  23.35 
 
 		 363 aa  125  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.104984  normal  0.400495 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2022  cytochrome b/diheme cytochrome c hybrid protein  23.08 
 
 		 363 aa  124  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2200  cytochrome c' family protein  31.92 
 
 		 239 aa  102  1e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0137  diheme cytochrome c  30.08 
 
 		 177 aa  102  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.510343  normal  0.997447 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3009  hypothetical protein  35.07 
 
 		 173 aa  95.5  1e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1924  diheme cytochrome c  37.61 
 
 		 163 aa  95.5  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.175348  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6333  diheme cytochrome c  32.39 
 
 		 162 aa  94.7  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.869886 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0502  cytochrome B561  26.09 
 
 		 237 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.677446  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3779  diheme cytochrome c  30.05 
 
 		 187 aa  92.4  1e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0454  putative diheme cytochrome c  37.4 
 
 		 168 aa  92.4  1e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2813  hypothetical protein  33.61 
 
 		 153 aa  90.9  3e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.386224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0242  diheme cytochrome c  30.05 
 
 		 187 aa  90.9  3e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000305217 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0241  diheme cytochrome c  35.07 
 
 		 187 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0573  multihaem cytochrome  34.71 
 
 		 168 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.27465  normal  0.381184 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0243  diheme cytochrome c  35.07 
 
 		 187 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000161676 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0241  diheme cytochrome c  35.07 
 
 		 187 aa  90.5  4e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0247  diheme cytochrome c  35.07 
 
 		 183 aa  90.1  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000425385 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0731  DHC, diheme cytochrome c  36.21 
 
 		 170 aa  89.7  7e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.100254  normal  0.364933 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0359  diheme cytochrome c  31.15 
 
 		 187 aa  89.7  7e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2020  DHC, diheme cytochrome c  37.07 
 
 		 161 aa  89.4  9e-17  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0244  diheme cytochrome c  34.33 
 
 		 183 aa  88.6  2e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0745  diheme cytochrome c  30.34 
 
 		 160 aa  85.5  0.000000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0304883  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3204  cytochrome B561  27.13 
 
 		 192 aa  85.9  0.000000000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4485  diheme cytochrome c  32.84 
 
 		 187 aa  84.3  0.000000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2814  cytochrome B561  30.28 
 
 		 201 aa  84.3  0.000000000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.395552  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2494  cytochrome b561  28.04 
 
 		 214 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3424  cytochrome B561  28.71 
 
 		 218 aa  81.3  0.00000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1765  diheme cytochrome c  37.5 
 
 		 129 aa  80.5  0.00000000000004  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.230573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0067  CybP  24.17 
 
 		 349 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1533  diheme cytochrome c  28.79 
 
 		 160 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3183  diheme cytochrome c  29.41 
 
 		 162 aa  78.2  0.0000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3094  putative lipoprotein  27.13 
 
 		 191 aa  78.2  0.0000000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.946628  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6224  multihaem cytochrome  28.93 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1764  cytochrome B561  30.73 
 
 		 212 aa  77  0.0000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.432878  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02246  cytochrome b561 family protein  27.98 
 
 		 231 aa  76.3  0.0000000000009  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.516708  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0574  cytochrome B561  25.27 
 
 		 243 aa  76.3  0.0000000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.599646  normal  0.211296 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1896  putative lipoprotein  28.69 
 
 		 188 aa  75.1  0.000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000950884  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5868  multihaem cytochrome  29.75 
 
 		 148 aa  74.3  0.000000000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1243  cytochrome B561  23.58 
 
 		 222 aa  74.7  0.000000000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.822746  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5867  cytochrome B561  23.83 
 
 		 245 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6225  cytochrome B561  24.3 
 
 		 245 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.414079  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2422  cytochrome B561  27.62 
 
 		 204 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.308564  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2805  putative lipoprotein  27.12 
 
 		 186 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3716  cytochrome B561  24.88 
 
 		 229 aa  68.2  0.0000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.254842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0244  cytochrome B561  23.63 
 
 		 198 aa  67.4  0.0000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000989788 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3134  cytochrome B561  29.39 
 
 		 265 aa  67.8  0.0000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1324  cytochrome B561  25.14 
 
 		 219 aa  67.8  0.0000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3010  cytochrome B561  25.51 
 
 		 236 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4483  cytochrome b, putative  23.08 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3777  cytochrome B561  24.73 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0245  cytochrome B561  24.73 
 
 		 198 aa  65.9  0.000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000164919 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6192  cytochrome B561  25.41 
 
 		 195 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1882  cytochrome B561  24.31 
 
 		 182 aa  65.1  0.000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2219  cytochrome B561  25.41 
 
 		 229 aa  64.7  0.000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.916384  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6334  cytochrome B561  25.28 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.741666 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0691  cytochrome B561  25.63 
 
 		 202 aa  64.7  0.000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.731454  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0215  cytochrome B561  26.91 
 
 		 228 aa  64.3  0.000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.243646 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1860  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  27.95 
 
 		 227 aa  64.3  0.000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2796  cytochrome b561 family protein  26.84 
 
 		 228 aa  63.9  0.000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.255284  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0314  hypothetical protein  27.87 
 
 		 192 aa  63.5  0.000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0246  cytochrome B561  26.23 
 
 		 195 aa  63.2  0.000000006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0586  cytochrome B561  26.18 
 
 		 203 aa  63.2  0.000000008  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0249  cytochrome B561  25.68 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000458311 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0243  cytochrome B561  25.68 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2042  cytochrome B561  25.56 
 
 		 236 aa  62  0.00000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0005809  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0243  cytochrome B561  25.68 
 
 		 195 aa  62.4  0.00000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1134  cytochrome B561  26.42 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1299  cytochrome B561  28.06 
 
 		 230 aa  61.2  0.00000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000118155  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2054  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  25.24 
 
 		 236 aa  61.2  0.00000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3509  cytochrome B561  24.34 
 
 		 181 aa  60.5  0.00000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.722049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1133  cytochrome B561  26.42 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000000490304  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1222  cytochrome B561  28.06 
 
 		 230 aa  60.5  0.00000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000994109  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0316  cytochrome B561  28.76 
 
 		 191 aa  60.5  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3286  cytochrome B561  22.73 
 
 		 210 aa  60.5  0.00000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.0957495 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0361  cytochrome B561  25.14 
 
 		 195 aa  60.1  0.00000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.471527  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5695  putative cytochrome b561 family protein  22.16 
 
 		 193 aa  59.7  0.00000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.101845  normal  0.510651 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3091  cytochrome B561  28.06 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000179659  normal  0.0155451 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_2075  putative nickel-dependent hydrogenase cytochrome b-type subunit  24.06 
 
 		 202 aa  59.3  0.0000001  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  decreased coverage  0.00002288  normal  0.934611 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2388  cytochrome b561  34.94 
 
 		 255 aa  59.3  0.0000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2911  cytochrome B561  25.23 
 
 		 221 aa  59.3  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1266  cytochrome B561  28.06 
 
 		 230 aa  58.9  0.0000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000000046168  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1304  putative cytochrome b561 family protein  22.99 
 
 		 255 aa  58.9  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2214  cytochrome B561  31.34 
 
 		 247 aa  58.5  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.312058  hitchhiker  0.00138122 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1204  cytochrome B561  25.94 
 
 		 229 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000144641  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1341  cytochrome B561  25.14 
 
 		 226 aa  57.8  0.0000003  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000605388 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4949  cytochrome B561  25.81 
 
 		 207 aa  57.8  0.0000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4935  cytochrome B561  22.83 
 
 		 187 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.43888 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1164  nickel-dependent hydrogenase b-type cytochrome subunit  26.71 
 
 		 242 aa  56.6  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.210413  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4699  cytochrome B561  24.84 
 
 		 200 aa  56.6  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.399998  normal  0.327083 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0857  Ni/Fe-hydrogenase, b-type cytochrome subunit  26.06 
 
 		 227 aa  56.2  0.0000008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1491  cytochrome B561  25.37 
 
 		 182 aa  56.2  0.0000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.268011 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1896  cytochrome b561 family protein  23.63 
 
 		 181 aa  56.2  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.832729  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0109  cytochrome B561  23.23 
 
 		 226 aa  55.1  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3536  cytochrome B561  23.42 
 
 		 219 aa  54.7  0.000002  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0164152 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2739  cytochrome B561  25.94 
 
 		 230 aa  54.3  0.000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00196146  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2807  putative cytochrome b  24.81 
 
 		 212 aa  53.9  0.000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2387  cytochrome B561  31.4 
 
 		 248 aa  53.9  0.000005  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.549561  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>