153 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0423 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0423  serine transporter  100 
 
 		 413 aa  836    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0882  serine transporter  69.36 
 
 		 413 aa  579  1e-164  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0084  L-serine transporter  51.72 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1985  serine transporter  51.26 
 
 		 440 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0863  aromatic amino acid permease  48.28 
 
 		 423 aa  395  1e-109  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0858  aromatic amino acid permease  47.68 
 
 		 423 aa  392  1e-108  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0739  aromatic amino acid permease  47.2 
 
 		 423 aa  390  1e-107  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2772  amino acid transporter, transmembrane  47.67 
 
 		 438 aa  386  1e-106  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1242  serine transporter  45.69 
 
 		 427 aa  383  1e-105  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0363509  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2939  serine transporter  45.56 
 
 		 429 aa  382  1e-105  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.557142  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3483  aromatic amino acid permease  46.72 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0919  serine transporter, putative  46.68 
 
 		 430 aa  378  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0765  aromatic amino acid permease  46.72 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3552  aromatic amino acid permease  46.72 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3674  aromatic amino acid permease  46.72 
 
 		 431 aa  380  1e-104  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.13608 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2666  serine transporter  45.67 
 
 		 427 aa  379  1e-104  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.973532  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0761  amino acid transporter, transmembrane  45.45 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3262  amino acid transporter, transmembrane  45.7 
 
 		 430 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3365  serine transporter, putative  46.19 
 
 		 430 aa  376  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1339  serine transporter  44.84 
 
 		 429 aa  377  1e-103  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0771  aromatic amino acid permease  48.02 
 
 		 428 aa  377  1e-103  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.630004  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2127  serine transporter, putative  46.19 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0861  aromatic amino acid permease  46.57 
 
 		 431 aa  374  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1630  serine transporter  43.37 
 
 		 431 aa  372  1e-102  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.80045  hitchhiker  0.00253041 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3396  aromatic amino acid permease  44.31 
 
 		 426 aa  369  1e-101  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.252294  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2656  serine transporter  43.72 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05580  hypothetical protein  42.79 
 
 		 418 aa  365  1e-100  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1550  serine transporter  43.72 
 
 		 440 aa  365  1e-100  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2739  serine transporter  43.72 
 
 		 433 aa  365  1e-100  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2269  hypothetical protein  43.1 
 
 		 431 aa  360  3e-98  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001600  serine transporter  43.14 
 
 		 418 aa  359  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2241  hypothetical protein  43.1 
 
 		 431 aa  359  6e-98  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3178  serine transporter family protein  44.71 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.509174 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3130  serine transporter family protein  44.71 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.805755  normal  0.595643 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3293  serine transporter family protein  44.71 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.412902  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3113  serine transporter family protein  44.71 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.109135  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3193  serine transporter family protein  44.71 
 
 		 429 aa  358  7e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.472945  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3633  threonine/serine transporter  44.15 
 
 		 425 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.04757 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02641  predicted serine transporter  45.91 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.581837  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0892  serine transporter  45.91 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0202457  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2940  serine transporter family protein  45.91 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.271081  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3101  serine transporter family protein  45.91 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.41481  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02603  hypothetical protein  45.91 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.649204  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4060  serine transporter family protein  45.91 
 
 		 429 aa  356  5e-97  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0533017  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3076  serine transporter family protein  45.91 
 
 		 429 aa  355  7.999999999999999e-97  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.119779  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0916  serine transporter  45.91 
 
 		 429 aa  355  8.999999999999999e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2936  serine transporter family protein  45.67 
 
 		 429 aa  354  2e-96  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0834253  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2804  amino acid transporter transmembrane  44.16 
 
 		 425 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.733608  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2397  putative serine transporter  42.48 
 
 		 430 aa  348  1e-94  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2183  aromatic amino acid permease  43.7 
 
 		 426 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3589  aromatic amino acid ABC transporter permease  43.7 
 
 		 426 aa  343  4e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3249  serine transporter  44.95 
 
 		 429 aa  341  1e-92  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.416009  normal  0.367748 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2327  aromatic amino acid permease  42.89 
 
 		 426 aa  340  4e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.904494  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0919  serine transporter  40.98 
 
 		 433 aa  335  7e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1760  threonine/serine transporter  41.71 
 
 		 425 aa  334  2e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0688  aromatic amino acid permease  44.15 
 
 		 419 aa  331  2e-89  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1262  serine transporter  42.48 
 
 		 417 aa  330  3e-89  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.040396  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0919  serine transporter  42.79 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000110337  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003156  serine transporter  43.98 
 
 		 417 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.524012  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01909  hypothetical protein  42.86 
 
 		 422 aa  325  1e-87  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1344  serine transporter  43.52 
 
 		 416 aa  324  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3149  putative serine transporter  42.64 
 
 		 430 aa  323  5e-87  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_19520  amino acid permease  40.69 
 
 		 428 aa  319  3.9999999999999996e-86  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.349906  normal  0.0310661 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02983  L-threonine/L-serine transporter  40.92 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4429  threonine/serine transporter TdcC  40.92 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0929595 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0587  serine transporter  40.92 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3304  threonine/serine transporter TdcC  40.92 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.078969  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3590  threonine/serine transporter TdcC  40.92 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02934  hypothetical protein  40.92 
 
 		 443 aa  315  9.999999999999999e-85  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3241  threonine/serine transporter TdcC  40.69 
 
 		 443 aa  314  1.9999999999999998e-84  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0582  threonine/serine transporter TdcC  40.46 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.090832  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3412  threonine/serine transporter TdcC  40.46 
 
 		 443 aa  313  2.9999999999999996e-84  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3601  threonine/serine transporter TdcC  40.69 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3538  threonine/serine transporter TdcC  40.69 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.457036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3431  threonine/serine transporter TdcC  40.69 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3434  threonine/serine transporter TdcC  40.69 
 
 		 443 aa  311  1e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3505  threonine/serine transporter TdcC  40.46 
 
 		 443 aa  310  2e-83  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3066  serine/threonine transporter family protein  41.11 
 
 		 439 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.619234  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3306  serine/threonine transporter family protein  41.11 
 
 		 439 aa  304  1.0000000000000001e-81  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.243696  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5569  aromatic amino acid permease  41.06 
 
 		 439 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  normal  0.179015 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2484  serine/threonine transporter family protein  40.58 
 
 		 439 aa  303  4.0000000000000003e-81  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3286  serine/threonine transporter family protein  40.87 
 
 		 439 aa  303  5.000000000000001e-81  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3563  threonine/serine transporter TdcC  40.83 
 
 		 443 aa  301  1e-80  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3207  serine/threonine transporter family protein  40 
 
 		 439 aa  299  5e-80  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3146  aromatic amino acid permease  40.58 
 
 		 439 aa  296  6e-79  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0568777  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3177  serine transporter  40.05 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00205118  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3415  serine/threonine transporter family protein  40.05 
 
 		 439 aa  294  2e-78  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3416  serine transporter  39.81 
 
 		 439 aa  291  1e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.365375  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3427  serine/threonine transporter family protein  40.05 
 
 		 439 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1840  serine/threonine transporter family protein  39.81 
 
 		 439 aa  290  2e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.781271 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3106  serine transporter  40.05 
 
 		 439 aa  290  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3407  serine/threonine transporter family protein  39.81 
 
 		 439 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.368535  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3198  serine/threonine transporter family protein  40.05 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0885914  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3451  serine/threonine transporter family protein  40.05 
 
 		 439 aa  289  6e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.305913  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1797  serine transporter  40.49 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1616  serine transporter  40.99 
 
 		 416 aa  288  1e-76  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.973383  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2139  serine transporter  38.31 
 
 		 427 aa  287  2e-76  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.41295  normal  0.95428 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3302  spore germination protein  35.57 
 
 		 409 aa  242  7e-63  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3191  inner membrane transport protein YqeG  34.79 
 
 		 409 aa  229  6e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3175  inner membrane transport protein YqeG  34.79 
 
 		 409 aa  229  7e-59  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>