13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0396 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0396  major outer membrane protein  100 
 
 
406 aa  819    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0397  major outer membrane protein  75.12 
 
 
406 aa  600  1e-170  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0195  major outer membrane protein  47.53 
 
 
414 aa  341  1e-92  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.672535  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1459  hydrogenase-4 component I  45.41 
 
 
402 aa  323  3e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.133792  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0123  major outer membrane protein  45.41 
 
 
405 aa  303  4.0000000000000003e-81  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1708  major outer membrane protein  43.48 
 
 
421 aa  301  1e-80  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.0000000945947  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2060  outer membrane protein  41.55 
 
 
420 aa  276  5e-73  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000846705  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0434  major outer membrane protein  40 
 
 
425 aa  239  8e-62  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000503105  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1108  major outer membrane protein  39.77 
 
 
425 aa  237  3e-61  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1395  major outer membrane protein  36.42 
 
 
431 aa  198  1.0000000000000001e-49  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.37942  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1275  major outer membrane protein  37.3 
 
 
424 aa  185  1.0000000000000001e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000233206  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0466  major outer membrane protein  34.21 
 
 
440 aa  174  1.9999999999999998e-42  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000000223812  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0469  outer membrane porin  25.74 
 
 
432 aa  48.5  0.0002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000534788  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>