More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0386 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_0910  putative recombination protein RecB  40.32 
 
 		 933 aa  669    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.646697  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0386  putative recombination protein RecB  100 
 
 		 921 aa  1842    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.717067  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0736  putative recombination protein RecB  38.86 
 
 		 939 aa  588  1e-166  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1474  putative recombination protein RecB  38.73 
 
 		 921 aa  561  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.000740501  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1654  putative recombination protein RecB  38.41 
 
 		 921 aa  555  1e-156  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1828  putative recombination protein RecB  38.47 
 
 		 921 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00117116  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1391  putative recombination protein RecB  36.94 
 
 		 923 aa  510  1e-143  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0382  putative recombination protein RecB  36.75 
 
 		 915 aa  501  1e-140  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.309071  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1910  UvrD/REP helicase  34.61 
 
 		 907 aa  459  1e-127  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0090  putative recombination protein RecB  34.88 
 
 		 903 aa  426  1e-118  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0086  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.27 
 
 		 1183 aa  147  1e-33  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3578  UvrD/REP helicase  25.66 
 
 		 995 aa  144  7e-33  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0138  double-strand break repair helicase AddA  22.36 
 
 		 1156 aa  140  7.999999999999999e-32  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.727377 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04140  UvrD/REP helicase  24.02 
 
 		 1036 aa  138  5e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2794  UvrD-like DNA helicase domain-containing protein  21.71 
 
 		 1124 aa  133  1.0000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.370193 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1714  UvrD/REP helicase  22.62 
 
 		 948 aa  132  2.0000000000000002e-29  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03180  putative helicase  25.98 
 
 		 1054 aa  127  8.000000000000001e-28  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.927265  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0699  UvrD/REP helicase  24.76 
 
 		 1052 aa  127  1e-27  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0178  UvrD-like DNA helicase, C terminal  27.39 
 
 		 1106 aa  126  1e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.124424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1527  UvrD/Rep family helicase  27.14 
 
 		 1106 aa  126  2e-27  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.529663  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1921  UvrD/REP helicase  21.74 
 
 		 959 aa  126  2e-27  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1190  hypothetical protein  26.69 
 
 		 1177 aa  123  1.9999999999999998e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4180  Exodeoxyribonuclease V  23.87 
 
 		 1073 aa  122  3e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.0648836 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2951  UvrD-like DNA helicase, C terminal  24.74 
 
 		 1119 aa  122  3.9999999999999996e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0785704  normal  0.12863 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2846  UvrD/REP helicase  26.24 
 
 		 1121 aa  120  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.347056 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2641  UvrD/REP helicase  24.75 
 
 		 1168 aa  120  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0136938 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4286  double-strand break repair helicase AddA  21.67 
 
 		 1183 aa  119  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.564831 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0495  UvrD/REP helicase  25.17 
 
 		 981 aa  115  3e-24  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5412  UvrD/REP helicase  23.79 
 
 		 1117 aa  114  7.000000000000001e-24  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0648  UvrD/REP helicase  25.68 
 
 		 1140 aa  114  9e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.464664  normal  0.326348 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3438  double-strand break repair helicase AddA  24.56 
 
 		 1125 aa  112  3e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3959  double-strand break repair helicase AddA  25.42 
 
 		 1183 aa  112  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_12091  UvrD/REP helicase subunit B  26.08 
 
 		 1208 aa  110  1e-22  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2325  UvrD/REP helicase  26.85 
 
 		 1087 aa  107  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.293004  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1503  UvrD/REP helicase  25.31 
 
 		 1101 aa  105  3e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699543  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2355  UvrD/REP helicase  26.14 
 
 		 1101 aa  105  3e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.112594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1561  UvrD/REP helicase  23.55 
 
 		 1054 aa  105  5e-21  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1708  ATP-dependent exoDNAse (exonuclease V) beta subunit  23.77 
 
 		 1118 aa  103  2e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3581  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  25.26 
 
 		 1177 aa  103  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2731  ATP-dependent DNA helicase Rep  29.39 
 
 		 665 aa  101  6e-20  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1377  Exodeoxyribonuclease V  25.57 
 
 		 1226 aa  100  1e-19  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.246845  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2124  UvrD/REP helicase  28.88 
 
 		 1147 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2254  UvrD/REP helicase  29.79 
 
 		 685 aa  100  2e-19  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.816502  normal  0.58095 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1315  ATP-dependent nuclease subunit A  41.98 
 
 		 1110 aa  99.4  3e-19  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1375  UvrD/REP helicase family protein  41.98 
 
 		 1110 aa  98.6  5e-19  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.134048  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0359  UvrD/Rep/AddA family helicase  26.43 
 
 		 1089 aa  97.8  8e-19  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0551  UvrD/REP helicase  25.57 
 
 		 1149 aa  97.8  9e-19  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0345301  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2868  ATP-dependent DNA helicase Rep  30.38 
 
 		 665 aa  97.4  1e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1697  UvrD/REP helicase  36.31 
 
 		 1182 aa  96.7  2e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0252  UvrD/REP helicase  25.83 
 
 		 1060 aa  96.7  2e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0085  UvrD/REP helicase  25 
 
 		 1016 aa  95.9  3e-18  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.60174  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16340  DNA/RNA helicase, superfamily I  30.17 
 
 		 772 aa  95.1  6e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.0144318 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1101  UvrD/REP helicase  29.63 
 
 		 1065 aa  94.4  9e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0056  ATP-dependant DNA helicase  23.32 
 
 		 1182 aa  94.4  9e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0723  UvrD/REP helicase  35.9 
 
 		 1196 aa  94  1e-17  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0841  UvrD/REP helicase  26.08 
 
 		 1161 aa  93.6  1e-17  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.94071  normal  0.0247795 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0629  UvrD/REP helicase  31.17 
 
 		 854 aa  93.2  2e-17  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2076  UvrD/REP helicase  24.64 
 
 		 1240 aa  92.8  2e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.692604  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2629  ATP-dependent DNA helicase UvrD  29.17 
 
 		 787 aa  92.4  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0417333  normal  0.559326 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_09040  ATP-dependent DNA helicase PcrA  28.24 
 
 		 932 aa  92.4  3e-17  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0519  UvrD/REP helicase  27.19 
 
 		 1130 aa  92  4e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0004  DNA helicase/exodeoxyribonuclease V, subunit A  26.74 
 
 		 1203 aa  92  5e-17  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1873  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 786 aa  91.3  7e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.340872  normal  0.0203553 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0930  ATP-dependent DNA helicase PcrA  25.54 
 
 		 837 aa  91.3  7e-17  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0489  double-strand break repair helicase AddA  36.49 
 
 		 1157 aa  90.9  9e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.127792  hitchhiker  0.00205602 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3035  UvrD/REP helicase  29.24 
 
 		 814 aa  90.9  9e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3026  ATP-dependent DNA helicase PcrA  23.52 
 
 		 829 aa  90.5  1e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.499575  hitchhiker  0.000248027 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3327  ATP-dependent DNA helicase PcrA  27.04 
 
 		 802 aa  90.9  1e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0222  UvrD/REP helicase  31.25 
 
 		 666 aa  90.9  1e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.00000045018  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0776  UvrD/REP helicase  30.04 
 
 		 1143 aa  90.5  1e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.240899 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1775  hypothetical protein  38.93 
 
 		 1076 aa  90.1  2e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0644  UvrD/REP helicase  24.08 
 
 		 1109 aa  89.7  2e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4586  ATP-dependent DNA helicase UvrD  30.42 
 
 		 787 aa  89.7  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.721141 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0387  ATP-dependent DNA helicase UvrD  35.71 
 
 		 860 aa  89.7  2e-16  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1420  UvrD/REP helicase  30.42 
 
 		 787 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0732039  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0960  UvrD/REP helicase  32.26 
 
 		 846 aa  89.7  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1610  double-strand break repair helicase AddA  36.03 
 
 		 1157 aa  89.7  2e-16  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1442  UvrD/REP helicase  30.42 
 
 		 787 aa  90.1  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1357  double-strand break repair helicase AddA  24.62 
 
 		 1155 aa  90.1  2e-16  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1363  UvrD/REP helicase  30.42 
 
 		 787 aa  89.4  3e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.485952 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1776  hypothetical protein  37.4 
 
 		 1076 aa  89.4  3e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0166  ATP-dependent DNA helicase Rep  27.92 
 
 		 660 aa  89.4  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.119958 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0089  ATP-dependent DNA helicase PcrA  29.81 
 
 		 742 aa  89.4  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0413312  decreased coverage  0.000000100763 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1797  Exodeoxyribonuclease V  24.63 
 
 		 1120 aa  89.4  3e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.00119316  normal  0.701381 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2632  DNA helicase II  31.48 
 
 		 787 aa  89  4e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4330  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 785 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.82343  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1571  UvrD/REP helicase  23.91 
 
 		 1110 aa  89  4e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1322  UvrD/REP helicase  30.42 
 
 		 840 aa  89  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4416  ATP-dependent DNA helicase PcrA  26.32 
 
 		 785 aa  89  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.464468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1723  ATP-dependent DNA helicase UvrD  28.99 
 
 		 825 aa  88.6  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.410033 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0959  UvrD/REP helicase  27.27 
 
 		 705 aa  88.6  5e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1975  UvrD/REP helicase  30.23 
 
 		 1132 aa  88.2  6e-16  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.109081  normal  0.151355 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0868  UvrD/REP helicase  23.84 
 
 		 741 aa  88.6  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1136  UvrD/REP helicase  27.16 
 
 		 1112 aa  88.2  7e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.0229402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1696  UvrD/REP helicase  30.87 
 
 		 793 aa  88.2  7e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.99054 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2021  UvrD/REP helicase  23.85 
 
 		 745 aa  87.8  8e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.581041 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1433  UvrD/REP helicase  30.3 
 
 		 788 aa  87.8  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  0.189419 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0043  DNA-dependent helicase II  24.81 
 
 		 723 aa  87.8  9e-16  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.779926  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0928  DNA helicase II  30.25 
 
 		 787 aa  87.4  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0006  UvrD/REP helicase  23.76 
 
 		 945 aa  87.8  0.000000000000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.416534  hitchhiker  0.0000067994 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>