15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0372 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0372  pdp protein  100 
 
 
177 aa  345  2e-94  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0184343  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1786  MTA/SAH nucleosidase  46.24 
 
 
188 aa  152  2e-36  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000723674  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2129  ATPase, AAA family protein  50.33 
 
 
187 aa  150  1e-35  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1925  hypothetical protein  45.29 
 
 
175 aa  139  1.9999999999999998e-32  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1844  hypothetical protein  42.29 
 
 
172 aa  112  4.0000000000000004e-24  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0077  PDP protein  44.91 
 
 
170 aa  111  5e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.390146  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1669  hypothetical protein  41.9 
 
 
172 aa  110  9e-24  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1488  hypothetical protein  41.9 
 
 
172 aa  110  9e-24  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0370  hypothetical protein  40.37 
 
 
171 aa  110  1.0000000000000001e-23  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0030  hypothetical protein  29.46 
 
 
177 aa  48.9  0.00003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2646  hypothetical protein  30.1 
 
 
180 aa  48.9  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.549676  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2706  hypothetical protein  31.86 
 
 
208 aa  47  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.5213  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1331  hypothetical protein  29.41 
 
 
229 aa  45.8  0.0003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0746592  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2510  MgtE intracellular region  33.87 
 
 
427 aa  42  0.004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000104929 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1187  hypothetical protein  28.05 
 
 
169 aa  41.6  0.006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>