124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0369 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  100 
 
 		 283 aa  575  1.0000000000000001e-163  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.10851  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1783  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  62.63 
 
 		 286 aa  365  1e-100  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.529991  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2132  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  62.77 
 
 		 286 aa  354  8.999999999999999e-97  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1369  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  59.27 
 
 		 282 aa  338  5.9999999999999996e-92  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1928  tRNA synthetase class II (G H P and S)  51.43 
 
 		 284 aa  295  8e-79  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0074  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  49.29 
 
 		 282 aa  266  2e-70  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0999  histidine--tRNA ligase  26.6 
 
 		 380 aa  68.9  0.00000000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.357666  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  25.73 
 
 		 421 aa  67  0.0000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0030  histidyl-tRNA synthetase  28.12 
 
 		 418 aa  66.6  0.0000000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.289573  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0659  histidyl-tRNA synthetase  26.76 
 
 		 431 aa  65.9  0.0000000007  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2359  histidine--tRNA ligase  25.62 
 
 		 401 aa  64.3  0.000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1288  histidyl-tRNA synthetase  23.94 
 
 		 402 aa  64.3  0.000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.373559  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1055  histidyl-tRNA synthetase  25.1 
 
 		 418 aa  63.2  0.000000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3452  histidyl-tRNA synthetase  24.84 
 
 		 409 aa  62.4  0.000000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.192864 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0749  histidyl-tRNA synthetase 2  30.16 
 
 		 389 aa  61.2  0.00000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0862  histidyl-tRNA synthetase  24.47 
 
 		 418 aa  59.7  0.00000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.393397  hitchhiker  0.0052458 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1794  histidyl-tRNA synthetase  24.69 
 
 		 418 aa  58.9  0.00000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1734  histidyl-tRNA synthetase  23.25 
 
 		 410 aa  58.9  0.0000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2348  histidyl-tRNA synthetase  22.94 
 
 		 377 aa  57.8  0.0000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.901013  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0924  histidyl-tRNA synthetase  26.88 
 
 		 418 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0748  histidyl-tRNA synthetase  24.32 
 
 		 415 aa  57.4  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1770  histidine--tRNA ligase  25.13 
 
 		 387 aa  57.4  0.0000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0828194  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  30.47 
 
 		 421 aa  57.4  0.0000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2918  histidyl-tRNA synthetase  23.4 
 
 		 408 aa  55.8  0.0000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.377078 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0324  histidyl-tRNA synthetase  24.68 
 
 		 414 aa  55.5  0.000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.272027  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf392  histidyl-tRNA synthetase  24.36 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  0.438879  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  30.7 
 
 		 419 aa  55.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1255  histidyl-tRNA synthetase  25.63 
 
 		 426 aa  53.9  0.000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.505298  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1900  histidyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 415 aa  53.5  0.000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2189  histidyl-tRNA synthetase  24.17 
 
 		 415 aa  53.5  0.000004  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 423 aa  53.5  0.000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1272  histidyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 408 aa  53.1  0.000004  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0694221  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  24.26 
 
 		 419 aa  53.1  0.000005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1621  histidyl-tRNA synthetase  22.95 
 
 		 421 aa  52.8  0.000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0415  histidyl-tRNA synthetase  21.18 
 
 		 410 aa  52.8  0.000007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.11603  hitchhiker  0.00165896 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02180  histidyl-tRNA synthetase  25.2 
 
 		 418 aa  52.4  0.000008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000127032  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  25.85 
 
 		 415 aa  52.4  0.000008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  27.1 
 
 		 423 aa  52.4  0.000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1950  histidyl-tRNA synthetase  29.68 
 
 		 426 aa  52.4  0.00001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1761  histidyl-tRNA synthetase  26.53 
 
 		 419 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.210094  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  27.59 
 
 		 411 aa  51.6  0.00001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 423 aa  51.6  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2880  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  27.78 
 
 		 418 aa  51.2  0.00002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.164097  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0765  histidine--tRNA ligase  23.15 
 
 		 412 aa  51.2  0.00002  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0564  histidyl-tRNA synthetase  26.99 
 
 		 406 aa  50.8  0.00002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0846  histidyl-tRNA synthetase, putative  22.64 
 
 		 412 aa  50.8  0.00003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.0000126725  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2108  histidyl-tRNA synthetase  28.39 
 
 		 426 aa  50.4  0.00003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  23.91 
 
 		 423 aa  50.4  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0856  histidyl-tRNA synthetase  25.97 
 
 		 408 aa  49.7  0.00005  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0658  histidyl-tRNA synthetase  28.44 
 
 		 419 aa  50.1  0.00005  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2267  histidyl-tRNA synthetase  29.14 
 
 		 430 aa  50.1  0.00005  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.921097  normal  0.960691 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1340  histidyl-tRNA synthetase  26.32 
 
 		 424 aa  49.3  0.00006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.667499  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0745  histidyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 408 aa  49.3  0.00007  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.139666  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1068  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 414 aa  49.3  0.00007  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1136  histidyl-tRNA synthetase  25.56 
 
 		 414 aa  49.3  0.00007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.850642  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0380  histidyl-tRNA synthetase 2  30.89 
 
 		 419 aa  49.3  0.00007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  22.7 
 
 		 424 aa  49.3  0.00008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2855  histidyl-tRNA synthetase  23.08 
 
 		 428 aa  48.9  0.00009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.983012  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 413 aa  48.5  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  24.1 
 
 		 417 aa  48.5  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  23.81 
 
 		 419 aa  48.1  0.0001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2736  histidyl-tRNA synthetase  23.62 
 
 		 424 aa  47.8  0.0002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0528  histidyl-tRNA synthetase  27.52 
 
 		 421 aa  47.4  0.0002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1247  histidyl-tRNA synthetase  26.47 
 
 		 408 aa  47.8  0.0002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0392037  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0646  histidyl-tRNA synthetase  27.78 
 
 		 417 aa  48.1  0.0002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.234157  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_750  histidyl-tRNA synthetase  21.62 
 
 		 412 aa  47.8  0.0002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.878399  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3900  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.01 
 
 		 401 aa  47.8  0.0002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.971472  normal  1 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0786  histidyl-tRNA synthetase  26.06 
 
 		 408 aa  47.4  0.0003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00313764  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0830  histidyl-tRNA synthetase  27.46 
 
 		 428 aa  47  0.0004  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl366  histidyl-tRNA synthetase  24.34 
 
 		 457 aa  47  0.0004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000113949  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0813  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.65 
 
 		 420 aa  47  0.0004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.493486  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  22.97 
 
 		 419 aa  46.2  0.0006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1848  histidyl-tRNA synthetase  23.93 
 
 		 425 aa  46.2  0.0006  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  27.48 
 
 		 418 aa  46.2  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  24.82 
 
 		 430 aa  45.8  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1310  histidyl-tRNA synthetase  29.2 
 
 		 433 aa  45.8  0.0008  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  26.77 
 
 		 420 aa  45.8  0.0008  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1015  ATP phosphoribosyltransferase, regulatory subunit  27.05 
 
 		 261 aa  45.8  0.0009  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1946  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  24.92 
 
 		 370 aa  45.1  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  25.4 
 
 		 445 aa  45.4  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1830  histidyl-tRNA synthetase  26.87 
 
 		 433 aa  45.4  0.001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2002  Histidine--tRNA ligase  23.48 
 
 		 409 aa  45.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1261  histidyl-tRNA synthetase  26.45 
 
 		 410 aa  45.4  0.001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.848478  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  25.81 
 
 		 416 aa  45.4  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3158  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  25.22 
 
 		 394 aa  45.4  0.001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  24.49 
 
 		 423 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2037  ATP phosphoribosyltransferase regulatory subunit  23.26 
 
 		 389 aa  44.7  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0933  histidyl-tRNA synthetase  19.51 
 
 		 470 aa  44.7  0.002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.638014  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3590  histidyl-tRNA synthetase  25.5 
 
 		 400 aa  44.3  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3608  histidyl-tRNA synthetase  25.17 
 
 		 424 aa  44.3  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.602511 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  26.4 
 
 		 420 aa  44.3  0.002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>