88 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0285 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009802  CCC13826_0747  saccharopine dehydrogenase  87.47 
 
 		 403 aa  741    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000418334  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0415  saccharopine dehydrogenase  85.04 
 
 		 405 aa  723    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0061  saccharopine dehydrogenase  80.2 
 
 		 403 aa  679    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0165  saccharopine dehydrogenase  76.88 
 
 		 401 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0186  saccharopine dehydrogenase  76.38 
 
 		 401 aa  655    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0208  saccharopine dehydrogenase  76.63 
 
 		 401 aa  657    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.69447  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0285  saccharopine dehydrogenase  100 
 
 		 404 aa  841    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0458  saccharopine dehydrogenase  78.14 
 
 		 401 aa  670    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2142  Saccharopine dehydrogenase  73.76 
 
 		 404 aa  633  1e-180  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1181  saccharopine dehydrogenase  66.75 
 
 		 394 aa  563  1.0000000000000001e-159  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.886294  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2516  saccharopine dehydrogenase  63.8 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.558897  normal  0.297438 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1535  Saccharopine dehydrogenase  62.78 
 
 		 396 aa  535  1e-151  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.82797 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0572  saccharopine dehydrogenase  61.71 
 
 		 398 aa  537  1e-151  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2320  Saccharopine dehydrogenase  61.87 
 
 		 396 aa  534  1e-150  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3052  saccharopine dehydrogenase  62.66 
 
 		 399 aa  515  1.0000000000000001e-145  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1790  saccharopine dehydrogenase  60 
 
 		 401 aa  511  1e-144  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0677  saccharopine dehydrogenase  60.26 
 
 		 397 aa  511  1e-144  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.10466 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1128  Saccharopine dehydrogenase  59.34 
 
 		 399 aa  509  1e-143  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.785881  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0148  Saccharopine dehydrogenase  57.53 
 
 		 409 aa  501  1e-140  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6504  Saccharopine dehydrogenase  58.48 
 
 		 395 aa  499  1e-140  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.752719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1597  Acyl carrier protein (ACP)  59.09 
 
 		 399 aa  495  1e-139  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.30891  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3519  Saccharopine dehydrogenase  59.13 
 
 		 405 aa  497  1e-139  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.368548  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2888  Saccharopine dehydrogenase  59.59 
 
 		 403 aa  493  9.999999999999999e-139  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.120454 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1201  saccharopine dehydrogenase  58.59 
 
 		 402 aa  491  1e-137  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.150944  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1922  saccharopine dehydrogenase  56.92 
 
 		 392 aa  489  1e-137  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00339893 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1555  Saccharopine dehydrogenase  57.51 
 
 		 401 aa  489  1e-137  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000142738  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2607  saccharopine dehydrogenase  57.47 
 
 		 398 aa  485  1e-136  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0125  Saccharopine dehydrogenase  59.65 
 
 		 403 aa  486  1e-136  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2539  saccharopine dehydrogenase  58.73 
 
 		 398 aa  483  1e-135  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2095  saccharopine dehydrogenase-like protein  58.48 
 
 		 399 aa  483  1e-135  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0902  saccharopine dehydrogenase  57.97 
 
 		 397 aa  475  1e-133  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000168136 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0748  saccharopine dehydrogenase  56.71 
 
 		 400 aa  476  1e-133  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4440  saccharopine dehydrogenase  57.22 
 
 		 401 aa  471  1e-132  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03351  Carboxynorspermidine dehydrogenase  56.2 
 
 		 400 aa  471  1e-132  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  decreased coverage  0.00142848  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1081  saccharopine dehydrogenase  55.3 
 
 		 399 aa  469  1.0000000000000001e-131  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.706576  normal  0.0928318 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1676  Saccharopine dehydrogenase  56.71 
 
 		 398 aa  467  9.999999999999999e-131  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0203222  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1307  Saccharopine dehydrogenase  56.46 
 
 		 399 aa  463  1e-129  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000784986 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2918  Saccharopine dehydrogenase  56.71 
 
 		 398 aa  457  1e-127  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0999  saccharopine dehydrogenase  53.94 
 
 		 405 aa  450  1e-125  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0445398  hitchhiker  0.00533099 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0981  saccharopine dehydrogenase  55.95 
 
 		 398 aa  449  1e-125  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0620633  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003102  carboxynorspermidine dehydrogenase putative  39.42 
 
 		 414 aa  328  1.0000000000000001e-88  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.185885  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1231  hypothetical protein  39.47 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00001292  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2137  saccharopine dehydrogenase  38.98 
 
 		 414 aa  323  3e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0299628  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02740  hypothetical protein  38.54 
 
 		 417 aa  318  9e-86  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2289  saccharopine dehydrogenase  41.54 
 
 		 405 aa  318  1e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.772575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0914  putative saccharopine dehydrogenase family protein  39.6 
 
 		 424 aa  307  2.0000000000000002e-82  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.867111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1380  saccharopine dehydrogenase  37.84 
 
 		 412 aa  306  4.0000000000000004e-82  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.000104449  normal  0.291708 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1501  saccharopine dehydrogenase  39.1 
 
 		 424 aa  305  1.0000000000000001e-81  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0028  saccharopine dehydrogenase  39.41 
 
 		 412 aa  304  2.0000000000000002e-81  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4157  saccharopine dehydrogenase  38.1 
 
 		 413 aa  300  2e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.152115  normal  0.83779 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2764  saccharopine dehydrogenase  37.47 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.114818  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2928  saccharopine dehydrogenase  37.47 
 
 		 414 aa  300  4e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0335  hypothetical protein  37.84 
 
 		 413 aa  298  1e-79  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0988  saccharopine dehydrogenase  37.59 
 
 		 413 aa  297  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000577497 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1715  saccharopine dehydrogenase  40 
 
 		 422 aa  296  3e-79  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.000000000659439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0352  hypothetical protein  37.84 
 
 		 413 aa  296  3e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2884  saccharopine dehydrogenase  37.34 
 
 		 412 aa  296  4e-79  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5844  hypothetical protein  37.84 
 
 		 413 aa  295  9e-79  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2955  saccharopine dehydrogenase  38.94 
 
 		 407 aa  295  1e-78  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0438  saccharopine dehydrogenase  37.84 
 
 		 426 aa  293  5e-78  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0417875  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1475  saccharopine dehydrogenase family protein  37.84 
 
 		 412 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0126  saccharopine dehydrogenase  37.84 
 
 		 412 aa  285  8e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.281282 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2844  saccharopine dehydrogenase  36.95 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.241943 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2125  saccharopine dehydrogenase  36.95 
 
 		 399 aa  285  1.0000000000000001e-75  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.530272  normal  0.238501 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1950  hypothetical protein  32.75 
 
 		 408 aa  204  3e-51  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.275408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3295  Saccharopine dehydrogenase  29.29 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.886794  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5327  saccharopine dehydrogenase  28.5 
 
 		 407 aa  170  4e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0356987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5034  saccharopine dehydrogenase  28.26 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4946  saccharopine dehydrogenase  28.26 
 
 		 407 aa  168  1e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3221  saccharopine dehydrogenase  29.95 
 
 		 407 aa  168  2e-40  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4677  Saccharopine dehydrogenase  30.37 
 
 		 401 aa  167  2.9999999999999998e-40  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1835  Saccharopine dehydrogenase  23.76 
 
 		 398 aa  91.7  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.257501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2976  saccharopine dehydrogenase  22.56 
 
 		 415 aa  69.3  0.0000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.809568  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3651  Saccharopine dehydrogenase  22.52 
 
 		 367 aa  53.1  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1416  hypothetical protein  22.56 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.572078 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1441  hypothetical protein  23.84 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1241  hypothetical protein  22.56 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1217  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  22.56 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1342  hypothetical protein  22.56 
 
 		 394 aa  52.8  0.00001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1219  saccharopine dehydrogenase, NADP+, L-lysine forming; L-lysine dehydrogenase  23.83 
 
 		 394 aa  51.2  0.00003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.182404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1242  saccharopine dehydrogenase  23.24 
 
 		 394 aa  51.6  0.00003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1495  Saccharopine dehydrogenase  22.53 
 
 		 376 aa  50.1  0.00007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  hitchhiker  0.0000691069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3399  Saccharopine dehydrogenase  21.53 
 
 		 350 aa  50.1  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00148167  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1254  Saccharopine dehydrogenase  22.98 
 
 		 385 aa  49.7  0.00008  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1941  Saccharopine dehydrogenase  23.15 
 
 		 446 aa  47.8  0.0003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3965  hypothetical protein  21.43 
 
 		 394 aa  47  0.0007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006692  CNG01150  spermidine synthase, putative  20.63 
 
 		 748 aa  46.6  0.0009  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4315  saccharopine dehydrogenase  23.88 
 
 		 378 aa  46.2  0.0009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.224112  normal  0.228939 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>