More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0271 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0271  diaminopimelate decarboxylase  100 
 
 
403 aa  815    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.760215  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1301  diaminopimelate decarboxylase  68.35 
 
 
412 aa  583  1.0000000000000001e-165  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1665  diaminopimelate decarboxylase  70.05 
 
 
399 aa  576  1.0000000000000001e-163  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1588  diaminopimelate decarboxylase  68.23 
 
 
407 aa  562  1.0000000000000001e-159  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0214  diaminopimelate decarboxylase  67.25 
 
 
401 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1651  diaminopimelate decarboxylase  62.72 
 
 
402 aa  515  1.0000000000000001e-145  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000231454  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0359  diaminopimelate decarboxylase  62.72 
 
 
402 aa  512  1e-144  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.604138  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0336  diaminopimelate decarboxylase  62.72 
 
 
402 aa  514  1e-144  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0468  diaminopimelate decarboxylase  60 
 
 
403 aa  506  9.999999999999999e-143  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1362  diaminopimelate decarboxylase  61.88 
 
 
401 aa  488  1e-137  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.884156  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0353  diaminopimelate decarboxylase  48.74 
 
 
416 aa  389  1e-107  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00862567 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0353  diaminopimelate decarboxylase  48.76 
 
 
422 aa  386  1e-106  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.336132  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4193  diaminopimelate decarboxylase  48.24 
 
 
427 aa  385  1e-106  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1468  diaminopimelate decarboxylase  48.99 
 
 
423 aa  382  1e-105  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1439  diaminopimelate decarboxylase  47.98 
 
 
412 aa  382  1e-105  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4070  diaminopimelate decarboxylase  48.49 
 
 
427 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4218  diaminopimelate decarboxylase  47.74 
 
 
427 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.15741  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1337  diaminopimelate decarboxylase  45.16 
 
 
418 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0058  diaminopimelate decarboxylase  47.98 
 
 
434 aa  369  1e-101  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.586159  normal  0.874852 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0444  diaminopimelate decarboxylase  47.25 
 
 
414 aa  367  1e-100  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.249159  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0390  diaminopimelate decarboxylase  45.59 
 
 
414 aa  363  2e-99  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.584204  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0391  diaminopimelate decarboxylase  47.1 
 
 
414 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3634  diaminopimelate decarboxylase  47.1 
 
 
414 aa  363  4e-99  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.239025  normal  0.49264 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0233  diaminopimelate decarboxylase  45.84 
 
 
417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.601671  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2394  diaminopimelate decarboxylase  48.35 
 
 
417 aa  362  5.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.362349  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0390  diaminopimelate decarboxylase  47.1 
 
 
414 aa  362  6e-99  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1847  diaminopimelate decarboxylase  46.23 
 
 
418 aa  362  7.0000000000000005e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2420  diaminopimelate decarboxylase  46.35 
 
 
417 aa  361  2e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.04804e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2443  diaminopimelate decarboxylase  47.12 
 
 
445 aa  359  6e-98  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000493249  normal  0.450296 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0377  diaminopimelate decarboxylase  47.36 
 
 
414 aa  358  7e-98  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0314  diaminopimelate decarboxylase  46.35 
 
 
417 aa  358  8e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0209  diaminopimelate decarboxylase  45.84 
 
 
415 aa  358  9.999999999999999e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1978  diaminopimelate decarboxylase  45.84 
 
 
415 aa  357  1.9999999999999998e-97  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00280212  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0125  diaminopimelate decarboxylase  45.34 
 
 
417 aa  357  1.9999999999999998e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.788285  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4130  diaminopimelate decarboxylase  46.85 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.638139 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4309  diaminopimelate decarboxylase  46.35 
 
 
414 aa  357  2.9999999999999997e-97  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002110  diaminopimelate decarboxylase  46.23 
 
 
417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00310  diaminopimelate decarboxylase  46.23 
 
 
417 aa  357  2.9999999999999997e-97  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0834  diaminopimelate decarboxylase  46.35 
 
 
418 aa  356  3.9999999999999996e-97  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4055  diaminopimelate decarboxylase  47.19 
 
 
417 aa  355  5.999999999999999e-97  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0486  diaminopimelate decarboxylase  47.61 
 
 
414 aa  354  2e-96  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.012167  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3588  diaminopimelate decarboxylase  46.5 
 
 
417 aa  354  2e-96  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.776676  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0041  diaminopimelate decarboxylase  46.88 
 
 
421 aa  352  7e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.437243  hitchhiker  0.00781145 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3139  diaminopimelate decarboxylase  46.5 
 
 
419 aa  352  8e-96  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167339  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0322  diaminopimelate decarboxylase  45.59 
 
 
414 aa  352  8.999999999999999e-96  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.475449  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2877  diaminopimelate decarboxylase  47.36 
 
 
419 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.926631  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3279  diaminopimelate decarboxylase  47.36 
 
 
419 aa  351  1e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3250  diaminopimelate decarboxylase  47.63 
 
 
414 aa  351  1e-95  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.773654 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0158  diaminopimelate decarboxylase  43.32 
 
 
417 aa  350  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.193099  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0522  diaminopimelate decarboxylase  47.42 
 
 
420 aa  350  2e-95  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000495897  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4145  diaminopimelate decarboxylase  45.66 
 
 
417 aa  350  2e-95  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3257  diaminopimelate decarboxylase  45.77 
 
 
423 aa  350  2e-95  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.314031  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6020  diaminopimelate decarboxylase  44.97 
 
 
415 aa  350  3e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.422247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0225  diaminopimelate decarboxylase  44.86 
 
 
415 aa  350  4e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.895635  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2910  diaminopimelate decarboxylase  45.52 
 
 
423 aa  349  4e-95  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00334908 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3740  diaminopimelate decarboxylase  44.14 
 
 
419 aa  349  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000793006 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_69670  diaminopimelate decarboxylase  44.72 
 
 
415 aa  349  6e-95  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0182  diaminopimelate decarboxylase  44.61 
 
 
415 aa  346  4e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0226  diaminopimelate decarboxylase  47.61 
 
 
414 aa  346  4e-94  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.148169 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0541  diaminopimelate decarboxylase  46.73 
 
 
418 aa  346  4e-94  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0858  diaminopimelate decarboxylase  45.5 
 
 
415 aa  345  6e-94  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.168666  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0238  diaminopimelate decarboxylase  45.71 
 
 
414 aa  345  7e-94  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.24058  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3974  diaminopimelate decarboxylase  46.62 
 
 
414 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3897  diaminopimelate decarboxylase  46.85 
 
 
414 aa  344  2e-93  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.024639 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0554  diaminopimelate decarboxylase  46.9 
 
 
419 aa  343  2e-93  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47700  diaminopimelate decarboxylase  44.11 
 
 
415 aa  343  2e-93  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0041  diaminopimelate decarboxylase  45.48 
 
 
414 aa  343  2.9999999999999997e-93  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5513  diaminopimelate decarboxylase  43.07 
 
 
425 aa  343  4e-93  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.568849 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4090  diaminopimelate decarboxylase  46.85 
 
 
414 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0466551 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3996  diaminopimelate decarboxylase  46.85 
 
 
414 aa  342  5e-93  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.950752  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0830  diaminopimelate decarboxylase  44.33 
 
 
423 aa  342  7e-93  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5227  diaminopimelate decarboxylase  43.36 
 
 
415 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5136  diaminopimelate decarboxylase  43.36 
 
 
415 aa  342  8e-93  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.206313  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1136  diaminopimelate decarboxylase  45 
 
 
427 aa  342  8e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.451004  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2979  diaminopimelate decarboxylase protein  44.5 
 
 
451 aa  342  9e-93  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.492096  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1240  diaminopimelate decarboxylase  44.19 
 
 
420 aa  340  2e-92  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0121  diaminopimelate decarboxylase  43.22 
 
 
434 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5288  diaminopimelate decarboxylase  43.36 
 
 
415 aa  341  2e-92  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0075  diaminopimelate decarboxylase  41.52 
 
 
416 aa  340  2e-92  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0207  diaminopimelate decarboxylase  45.27 
 
 
420 aa  340  2.9999999999999998e-92  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00206  putative diaminopimelate decarboxylase  44.17 
 
 
416 aa  339  5e-92  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0219  diaminopimelate decarboxylase  45.39 
 
 
443 aa  338  8e-92  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.000590665  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3583  diaminopimelate decarboxylase  46.35 
 
 
414 aa  338  8e-92  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0267  diaminopimelate decarboxylase  45.11 
 
 
415 aa  338  9e-92  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1713  diaminopimelate decarboxylase  43.86 
 
 
417 aa  338  9.999999999999999e-92  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.283347  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0348  diaminopimelate decarboxylase  45 
 
 
445 aa  337  1.9999999999999998e-91  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000000869616  hitchhiker  0.0000188674 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4073  diaminopimelate decarboxylase  45.79 
 
 
415 aa  336  3.9999999999999995e-91  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0696  diaminopimelate decarboxylase  45.02 
 
 
431 aa  335  7e-91  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3475  diaminopimelate decarboxylase  42.79 
 
 
421 aa  335  7.999999999999999e-91  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0716  diaminopimelate decarboxylase  45.02 
 
 
431 aa  335  9e-91  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.670894 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3816  diaminopimelate decarboxylase  43.35 
 
 
422 aa  332  9e-90  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.010832 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2756  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.303641  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1897  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.705809  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0713  diaminopimelate decarboxylase  42.12 
 
 
421 aa  332  1e-89  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.788055 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3737  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3708  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  332  1e-89  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3766  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  331  1e-89  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.795007  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3451  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3197  diaminopimelate decarboxylase  44.5 
 
 
423 aa  332  1e-89  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2802  diaminopimelate decarboxylase  44.11 
 
 
420 aa  331  1e-89  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>