253 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0114 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0114  50S ribosomal protein L35  100 
 
 
63 aa  126  8.000000000000001e-29  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1839  50S ribosomal protein L35  88.89 
 
 
63 aa  114  6e-25  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0346  50S ribosomal protein L35  88.89 
 
 
63 aa  113  1.0000000000000001e-24  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0034  50S ribosomal protein L35  84.13 
 
 
63 aa  106  1e-22  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0294  50S ribosomal protein L35  82.54 
 
 
63 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0269  50S ribosomal protein L35  82.54 
 
 
63 aa  105  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0241  50S ribosomal protein L35  80.95 
 
 
63 aa  103  9e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0493  ribosomal protein L35  82.26 
 
 
63 aa  102  2e-21  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0083  ribosomal protein L35  69.35 
 
 
64 aa  89.4  1e-17  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.00000000192427  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2145  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000037882  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1857  50S ribosomal protein L35  59.68 
 
 
65 aa  70.1  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.000000905032  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0045  ribosomal protein L35  58.06 
 
 
65 aa  67  0.00000000009  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0365  50S ribosomal protein L35P  58.06 
 
 
65 aa  66.6  0.0000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000000290331  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0621  ribosomal protein L35  56.25 
 
 
68 aa  62.8  0.000000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1871  ribosomal protein L35  59.02 
 
 
65 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0000188111  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3755  ribosomal protein L35  54.69 
 
 
65 aa  62.4  0.000000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00241542 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0914  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  62.8  0.000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1420  ribosomal protein L35  59.32 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490106  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1224  50S ribosomal protein L35P  51.61 
 
 
65 aa  61.2  0.000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000287397  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0426  ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  60.8  0.000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  unclonable  0.000000276792  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1009  50S ribosomal protein L35P  54.84 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0922518  hitchhiker  0.0085078 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1908  ribosomal protein L35  50 
 
 
66 aa  59.7  0.00000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2612  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0594985  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1644a  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
64 aa  59.7  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.00277503  normal  0.0564408 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2241  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  59.7  0.00000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00115942  hitchhiker  0.00480689 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2097  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1998  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0506186  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2318  50S ribosomal protein L35  55.17 
 
 
65 aa  59.3  0.00000002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000144382  normal  0.192028 
 
 
-
 
NC_002950  PG0990  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.5  0.00000003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2380  ribosomal protein L35  52.46 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.113129  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2164  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.0000105441  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2053  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  58.9  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000471288  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1933  50S ribosomal protein L35  52.46 
 
 
64 aa  58.2  0.00000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000771602  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1517  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  hitchhiker  0.00941946  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2018  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  57.8  0.00000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01385  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  57.4  0.00000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1413  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.000000182997  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0206  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
63 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1822  LSU ribosomal protein L35P  61.54 
 
 
64 aa  57.4  0.00000007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000209842  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1223  ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  57  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00194553  hitchhiker  0.00674467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2803  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1277  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.147861  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1413  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  56.2  0.0000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000696271  normal  0.451536 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1162  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.245099  normal  0.908987 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1205  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000004157  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1476  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000000416006  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1886  50S ribosomal protein L35P  50 
 
 
67 aa  56.2  0.0000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.0101932 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0165  50S ribosomal protein L35  53.23 
 
 
64 aa  55.8  0.0000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.442287  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2301  50S ribosomal protein L35  53.45 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.000837102  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1234  ribosomal protein L35  46.88 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  hitchhiker  0.00000264492  normal  0.0861149 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0766  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.5  0.0000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0216  50S ribosomal protein L35  49.21 
 
 
65 aa  55.8  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000459393  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2852  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
67 aa  55.8  0.0000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0103934 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1579  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2104  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
67 aa  55.1  0.0000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.365417  normal  0.232505 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2626  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000318579  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0026  50S ribosomal protein L35  53.12 
 
 
65 aa  55.1  0.0000003  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1645  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.354073  normal  0.121255 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0448  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000139111  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1452  ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  54.7  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.150894  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1975  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  55.1  0.0000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1318  ribosomal protein L35  49.18 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.35652  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1614  50S ribosomal protein L35  46.77 
 
 
64 aa  54.3  0.0000005  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.00000000148702  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0523  ribosomal protein L35  48.28 
 
 
66 aa  54.3  0.0000005  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.0000000250837  unclonable  0.0000000265454 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1373  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  54.3  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.140505  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1978  50S ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  54.3  0.0000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0378736  normal  0.0703875 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2506  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.684912  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0489  ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.351657  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1992  ribosomal protein L35  54.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.709618  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2659  ribosomal protein L35  45.16 
 
 
66 aa  53.9  0.0000007  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000049252  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28670  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 
64 aa  53.9  0.0000007  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000017021 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2228  ribosomal protein L35  54.1 
 
 
65 aa  53.9  0.0000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00277145 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1801  50S ribosomal protein L35  47.54 
 
 
64 aa  53.5  0.0000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  decreased coverage  0.00132404  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20440  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  53.9  0.0000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.836721  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2059  ribosomal protein L35  46.67 
 
 
63 aa  53.5  0.0000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.617937  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2754  50S ribosomal protein L35  50 
 
 
65 aa  53.5  0.0000009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10263  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1714  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.143899  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2467  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00110477  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3223  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.86306 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2301  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1454  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.190157  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1747  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
67 aa  53.1  0.000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00635626 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1094  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0139822  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4614  50S ribosomal protein L35  46.88 
 
 
67 aa  53.5  0.000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.247052  normal  0.0110084 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2016  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
64 aa  53.5  0.000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000210298  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1401  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.158617  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2637  50S ribosomal protein L35  56.45 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.163287  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05600  ribosomal protein L35  52.83 
 
 
57 aa  53.1  0.000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000612539  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2593  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0965  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.511335  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0995  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3479  50S ribosomal protein L35  46.03 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0370445  normal  0.0138501 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1737  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.713888  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1477  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.567723  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2045  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000199534  hitchhiker  0.00708309 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1767  50S ribosomal protein L35  50.82 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000852967  normal  0.0187188 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1556  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0709  50S ribosomal protein L35  51.61 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.00000132711  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1537  50S ribosomal protein L35  48.39 
 
 
65 aa  53.5  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.689804  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0429  ribosomal protein L35  47.62 
 
 
64 aa  53.1  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>