More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0070 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0539  aldehyde dehydrogenase A  65.76 
 
 
479 aa  657    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1445  aldehyde dehydrogenase A  67.01 
 
 
479 aa  670    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0070  aldehyde dehydrogenase A  100 
 
 
482 aa  993    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.432911  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1953  aldehyde dehydrogenase A  63.42 
 
 
479 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2021  aldehyde dehydrogenase A  62.58 
 
 
479 aa  611  9.999999999999999e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217871 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4949  lactaldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 
478 aa  612  9.999999999999999e-175  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.206035 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0361  lactaldehyde dehydrogenase  61.81 
 
 
479 aa  612  9.999999999999999e-175  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01370  aldehyde dehydrogenase A, NAD-linked  62.37 
 
 
479 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2230  Aldehyde Dehydrogenase  62.58 
 
 
479 aa  610  1e-173  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0354043  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2243  aldehyde dehydrogenase A  62.58 
 
 
479 aa  610  1e-173  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4414  aldehyde dehydrogenase A  62.16 
 
 
479 aa  608  1e-173  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1757  aldehyde dehydrogenase A  62.37 
 
 
479 aa  608  1e-173  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000000249904 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1498  aldehyde dehydrogenase A  62.58 
 
 
479 aa  610  1e-173  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01382  hypothetical protein  62.37 
 
 
479 aa  609  1e-173  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1596  aldehyde dehydrogenase A  62.58 
 
 
479 aa  611  1e-173  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4133  aldehyde dehydrogenase A  61.95 
 
 
479 aa  607  9.999999999999999e-173  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2695  aldehyde dehydrogenase  59.92 
 
 
477 aa  605  9.999999999999999e-173  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.152226  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1635  aldehyde dehydrogenase A  62.37 
 
 
479 aa  606  9.999999999999999e-173  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09240  Aldehyde dehydrogenase  60.21 
 
 
477 aa  581  1e-164  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.904508  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2446  aldehyde dehydrogenase  58.37 
 
 
478 aa  572  1.0000000000000001e-162  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0324  lactaldehyde dehydrogenase  57.77 
 
 
484 aa  569  1e-161  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.22298  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0293  aldehyde dehydrogenase  57.66 
 
 
477 aa  563  1.0000000000000001e-159  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.974595  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05560  lactaldehyde dehydrogenase  50.42 
 
 
478 aa  494  9.999999999999999e-139  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1997  Aldehyde Dehydrogenase  44.12 
 
 
480 aa  409  1e-113  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2080  aldehyde dehydrogenase family protein  40.72 
 
 
479 aa  393  1e-108  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.710123  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2645  betaine-aldehyde dehydrogenase  40.92 
 
 
481 aa  393  1e-108  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237988  normal  0.24266 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1990  Aldehyde Dehydrogenase  40.46 
 
 
481 aa  382  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.405223 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2553  betaine-aldehyde dehydrogenase  42.04 
 
 
487 aa  382  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.153843  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2835  lactaldehyde dehydrogenase  39.71 
 
 
474 aa  373  1e-102  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3004  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 
482 aa  349  6e-95  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0814  Aldehyde Dehydrogenase  37.26 
 
 
480 aa  346  5e-94  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.350858  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0299  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.95 
 
 
483 aa  345  2e-93  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0359  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.95 
 
 
483 aa  343  2.9999999999999997e-93  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4947  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.53 
 
 
483 aa  343  5e-93  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0951  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
482 aa  343  5e-93  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0312  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.74 
 
 
483 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0295  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NAD(P)+)  37.74 
 
 
483 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0327  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.74 
 
 
483 aa  342  5.999999999999999e-93  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1323  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
485 aa  342  9e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.73252  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0401  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.53 
 
 
483 aa  342  9e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00719001  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0373  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.53 
 
 
483 aa  342  1e-92  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0307  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
483 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0306  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.31 
 
 
483 aa  340  5e-92  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0909  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.15 
 
 
488 aa  338  9.999999999999999e-92  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.107387  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1914  aldehyde dehydrogenase  37.84 
 
 
484 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4942  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  37.1 
 
 
482 aa  337  1.9999999999999998e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.498743  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0356  succinate-semialdehyde dehydrogenase (NADP+)  37.1 
 
 
483 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2465  Aldehyde Dehydrogenase  37.61 
 
 
485 aa  336  3.9999999999999995e-91  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.146216  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0187  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.81 
 
 
480 aa  336  5e-91  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0343  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.23 
 
 
483 aa  335  7.999999999999999e-91  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0152  Aldehyde Dehydrogenase  35.68 
 
 
510 aa  335  1e-90  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03430  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  37.02 
 
 
483 aa  334  2e-90  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.59013  hitchhiker  1.44142e-17 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0213  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
480 aa  333  5e-90  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.246043 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0228  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
480 aa  332  7.000000000000001e-90  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0300  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.38 
 
 
480 aa  332  9e-90  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0237  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
480 aa  332  9e-90  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1093  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.61 
 
 
486 aa  332  1e-89  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1497  succinate-semialdehyde dehydrogenase [NADP+] (ssdh)  35.9 
 
 
477 aa  332  1e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.442426  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0231  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.93 
 
 
483 aa  331  2e-89  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4999  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.72 
 
 
480 aa  329  7e-89  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.354077  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3399  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.48 
 
 
500 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.547981  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0091  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.17 
 
 
480 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1113  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
482 aa  328  2.0000000000000001e-88  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1099  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
482 aa  327  2.0000000000000001e-88  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.681795  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0846  aldehyde dehydrogenase  35.26 
 
 
493 aa  327  2.0000000000000001e-88  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3187  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.44 
 
 
482 aa  327  3e-88  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.450535  normal  0.0362336 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2971  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.07 
 
 
482 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0217153 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2904  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.07 
 
 
482 aa  326  7e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2988  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.07 
 
 
482 aa  325  8.000000000000001e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.853074  normal  0.0957266 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2913  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
482 aa  325  8.000000000000001e-88  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0320472  normal  0.673658 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3092  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  36.07 
 
 
482 aa  325  9e-88  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4305  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.72 
 
 
484 aa  325  1e-87  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1292  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.75 
 
 
485 aa  325  1e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00190928  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3722  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.27 
 
 
500 aa  325  1e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1204  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.01 
 
 
482 aa  324  2e-87  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.160081  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49080  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  34.89 
 
 
483 aa  324  2e-87  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.133526  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1171  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.23 
 
 
482 aa  325  2e-87  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0195542  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4421  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
479 aa  323  3e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3092  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
482 aa  323  4e-87  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.101414  normal  0.617954 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4355  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.8 
 
 
493 aa  323  5e-87  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00805728 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0173  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.09 
 
 
479 aa  322  8e-87  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02517  succinate-semialdehyde dehydrogenase I, NADP-dependent  35.64 
 
 
482 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02481  hypothetical protein  35.64 
 
 
482 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2796  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.64 
 
 
482 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1045  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.64 
 
 
482 aa  322  9.000000000000001e-87  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2905  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.98 
 
 
494 aa  322  9.000000000000001e-87  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1381  aldehyde dehydrogenase (acceptor)  35.98 
 
 
496 aa  322  9.999999999999999e-87  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.514457 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3903  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.85 
 
 
482 aa  322  9.999999999999999e-87  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.85959 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1022  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.64 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0292  hypothetical protein  36.65 
 
 
488 aa  321  1.9999999999999998e-86  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2941  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.64 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2781  succinate-semialdehyde dehydrogenase I  35.64 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.610238 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2991  succinic semialdehyde dehydrogenase  36.11 
 
 
485 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6539300000000001e-18 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2995  succinate semialdehyde dehydrogenase  36.93 
 
 
482 aa  321  1.9999999999999998e-86  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0765297  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1275  succinate-semialdehyde dehydrogenase  36.29 
 
 
482 aa  320  3e-86  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0808  succinate semialdehyde dehydrogenase  37.74 
 
 
488 aa  320  3e-86  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.232727 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2774  succinic semialdehyde dehydrogenase  35.87 
 
 
486 aa  320  3e-86  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3646  aldehyde dehydrogenase family protein  34.81 
 
 
493 aa  320  3.9999999999999996e-86  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.196663 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0380  Aldehyde Dehydrogenase  37.56 
 
 
485 aa  320  3.9999999999999996e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3273  succinic semialdehyde dehydrogenase  37.8 
 
 
492 aa  320  3.9999999999999996e-86  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>