236 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0061 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0061  NifU family protein  100 
 
 		 88 aa  177  2.9999999999999997e-44  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.269629  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1742  hypothetical protein  77.27 
 
 		 91 aa  153  8e-37  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0211624  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1782  NifU family protein  77.27 
 
 		 88 aa  149  2e-35  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1004  NifU family protein  76.14 
 
 		 89 aa  148  3e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0012863  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1811  NifU family protein  65.52 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1999  NifU family protein  65.52 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1630  NifU family protein  65.52 
 
 		 90 aa  124  5e-28  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0110  conserved hypothetical protein, NifU family protein  64.29 
 
 		 91 aa  122  1e-27  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000197902  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0330  nitrogen-fixing NifU-like protein  52.27 
 
 		 91 aa  108  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1940  nitrogen-fixing NifU domain protein  64.04 
 
 		 93 aa  92.8  1e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1421  NifU domain-containing protein  49.3 
 
 		 72 aa  69.3  0.00000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.238769  normal  0.285517 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0074  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.15 
 
 		 87 aa  60.5  0.000000007  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2893  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.31 
 
 		 78 aa  60.5  0.000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3037  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.03 
 
 		 78 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0695  NifU domain-containing protein  48.28 
 
 		 75 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.219318 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0139  NifU domain-containing protein  43.94 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.820437  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1812  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.26 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1784  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.26 
 
 		 294 aa  58.9  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0140  NifU-related protein  36.92 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0134  NifU-related protein  36.92 
 
 		 190 aa  58.5  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00825478  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0889  nitrogen-fixing NifU domain protein  48.33 
 
 		 72 aa  58.5  0.00000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000213557  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2067  NifU domain-containing protein  46.38 
 
 		 73 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.0000000000395477  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1075  NifU domain-containing protein  41.1 
 
 		 191 aa  57.8  0.00000005  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.152457  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4037  nitrogen-fixing NifU-like  39.06 
 
 		 189 aa  57.8  0.00000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0153  scaffold protein Nfu/NifU  36.92 
 
 		 190 aa  57.4  0.00000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1823  scaffold protein Nfu/NifU  39.06 
 
 		 186 aa  57  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.266684  normal  0.103304 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0024  Scaffold protein Nfu/NifU  40.62 
 
 		 188 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.419851 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0036  Scaffold protein Nfu/NifU  40.62 
 
 		 188 aa  57  0.00000008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.231277 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0997  nitrogen-fixing NifU domain protein  55.36 
 
 		 77 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.997138 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1492  nitrogen-fixing NifU domain protein  37.21 
 
 		 109 aa  56.6  0.0000001  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0512001  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0036  scaffold protein Nfu/NifU  37.5 
 
 		 188 aa  56.6  0.0000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0881083  hitchhiker  0.0000181724 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02790  NifU C-terminal domain-containing protein, VnfU  41.43 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.197123  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_9865  predicted protein  45.76 
 
 		 73 aa  56.2  0.0000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.07223  normal  0.100166 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0480  NifU-like domain-containing protein  47.54 
 
 		 74 aa  55.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2331  NifU-like protein  47.69 
 
 		 103 aa  55.8  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00196281  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3080  nitrogen-fixing NifU-like  47.54 
 
 		 74 aa  55.5  0.0000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0463  nitrogen-fixing NifU-like  33.85 
 
 		 188 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1084  nitrogen-fixing NifU-like  43.48 
 
 		 331 aa  55.8  0.0000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0085  NifU domain-containing protein  50 
 
 		 72 aa  55.5  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.0000000000210342  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0531  NifU domain-containing protein  40.51 
 
 		 184 aa  55.8  0.0000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.241454  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0399  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.95 
 
 		 79 aa  55.5  0.0000002  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2279  NifU domain-containing protein  40.62 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.473385  normal  0.588083 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2900  Scaffold protein Nfu/NifU  35.38 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.25177 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0430  hypothetical protein  37.5 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.255854  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0457  Scaffold protein Nfu/NifU  35.38 
 
 		 188 aa  55.5  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3531  nitrogen-fixing NifU-like  37.84 
 
 		 183 aa  55.1  0.0000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0247  nitrogen-fixing NifU-like  37.5 
 
 		 188 aa  55.1  0.0000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1170  NifU family protein  35.94 
 
 		 192 aa  55.1  0.0000003  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.841091  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0889  NifU domain-containing protein  39.06 
 
 		 186 aa  55.1  0.0000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0368383  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0939  NifU domain-containing protein  47.54 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.388562  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1466  nitrogen-fixing NifU domain protein  47.83 
 
 		 73 aa  55.1  0.0000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1752  NifU-like protein  42.31 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.354649  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0800  nitrogen-fixing NifU, C-terminal  39.68 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2214  nitrogen-fixing NifU  39.06 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.731458  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0585  nitrogen-fixing NifU-like  35.94 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0980  nitrogen-fixing NifU-like protein  44.12 
 
 		 333 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.191022 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_04711  NifU-like protein  42.31 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.265709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3554  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00447  NifU-related protein (AFU_orthologue; AFUA_1G04680)  39.68 
 
 		 326 aa  54.7  0.0000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.215741  normal  0.563754 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0101  Fe-S cluster assembly protein NifU  44.44 
 
 		 283 aa  54.7  0.0000005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2095  Scaffold protein Nfu/NifU  39.13 
 
 		 187 aa  54.7  0.0000005  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.724202  normal  0.959854 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_04791  NifU-like protein  40.26 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0414  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.212463  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3611  scaffold protein Nfu/NifU  42.19 
 
 		 201 aa  54.3  0.0000006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1408  nitrogen-fixing NifU domain protein  46.67 
 
 		 73 aa  54.3  0.0000006  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.510061  normal  0.98694 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_04691  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04381  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.725479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3484  nitrogen-fixing NifU domain protein  41.18 
 
 		 74 aa  53.9  0.0000007  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000000024465  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2071  nitrogen-fixing NifU-like protein  35.53 
 
 		 190 aa  53.9  0.0000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0389413  normal  0.471165 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3402  nitrogen-fixing NifU-like  42.65 
 
 		 80 aa  53.9  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.168954 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_20981  NifU-like protein  44.12 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2542  nitrogen-fixing NifU domain protein  45 
 
 		 306 aa  53.9  0.0000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.364829 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5086  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4821  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4659  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4678  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0148  nifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5056  nifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5186  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4771  NifU domain-containing protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3091  nitrogen-fixing NifU-like  40.54 
 
 		 187 aa  53.5  0.0000009  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.758224  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5092  nifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5094  nifU domain protein  47.37 
 
 		 78 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2796  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.9 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000131696  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1414  nitrogen-fixing NifU domain protein  45.9 
 
 		 73 aa  52.8  0.000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.68572e-21 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0076  nitrogen-fixing NifU domain protein  40.98 
 
 		 73 aa  53.1  0.000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04161  NifU-like protein  42.42 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.43569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1585  NifU-like protein  42.03 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.716402  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0796  NifU-like protein  42.03 
 
 		 81 aa  53.5  0.000001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.077695  normal  0.023151 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0365  thioredoxin-related protein  48.98 
 
 		 191 aa  52.8  0.000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.299726  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0936  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00633324  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_00755  NifU protein, putative  41.27 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0945933  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0333  NifU domain-containing protein  41.67 
 
 		 74 aa  53.1  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000601792  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0955  NifU domain-containing protein  36.36 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.283464  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2839  hypothetical protein  39.06 
 
 		 187 aa  53.5  0.000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.0061746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_82838  predicted protein  39.39 
 
 		 254 aa  53.5  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0133189  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0464  NifU domain-containing protein  42.03 
 
 		 75 aa  52.4  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.046891  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1775  NifU domain-containing protein  36.92 
 
 		 185 aa  52  0.000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.126577  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0016  nitrogen-fixing NifU-like  36.92 
 
 		 191 aa  52.8  0.000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  hitchhiker  0.00443934  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3799  NifU domain-containing protein  34.15 
 
 		 291 aa  52.4  0.000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>