More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0058 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0058  30S ribosomal protein S4  100 
 
 		 208 aa  419  1e-116  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0094  30S ribosomal protein S4  91.83 
 
 		 208 aa  390  1e-108  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0810213  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1752  30S ribosomal protein S4  90.38 
 
 		 208 aa  384  1e-106  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.000068654  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1766  30S ribosomal protein S4  90.87 
 
 		 208 aa  384  1e-106  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.534162  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1947  30S ribosomal protein S4  90.38 
 
 		 208 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.134861  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1009  30S ribosomal protein S4  89.42 
 
 		 208 aa  382  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.262144  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1581  30S ribosomal protein S4  90.38 
 
 		 208 aa  383  1e-105  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1943  ribosomal protein S4  87.5 
 
 		 208 aa  369  1e-101  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0206  30S ribosomal protein S4  83.65 
 
 		 208 aa  364  1e-100  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0326  30S ribosomal protein S4  81.73 
 
 		 208 aa  353  6.999999999999999e-97  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0344  30S ribosomal protein S4  56.67 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.311272  decreased coverage  0.0000419462 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2684  30S ribosomal protein S4  54.81 
 
 		 208 aa  224  5.0000000000000005e-58  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000106865  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0763  RNA-binding S4 domain-containing protein  55.92 
 
 		 211 aa  224  5.0000000000000005e-58  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0500  30S ribosomal protein S4  56.19 
 
 		 207 aa  224  7e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0732  RNA-binding S4 domain-containing protein  52.4 
 
 		 208 aa  221  6e-57  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00130119  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1319  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000360982  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4218  30S ribosomal protein S4  55.98 
 
 		 207 aa  220  9.999999999999999e-57  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1367  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 209 aa  220  9.999999999999999e-57  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000845169  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5046  30S ribosomal protein S4  55.71 
 
 		 207 aa  218  3.9999999999999997e-56  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2038  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 203 aa  218  6e-56  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.00000016478  normal  0.289482 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1046  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0397  30S ribosomal protein S4  55.71 
 
 		 207 aa  216  2e-55  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1111  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000499385  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0980  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 209 aa  216  2e-55  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.40186  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09100  30S ribosomal protein S4  54.5 
 
 		 206 aa  216  2e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.908313 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0861  30S ribosomal protein S4  53.55 
 
 		 206 aa  215  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00962  30S ribosomal protein S4  54.55 
 
 		 206 aa  216  2.9999999999999998e-55  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.00755213  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2397  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0284002  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0625  30S ribosomal protein S4  55.71 
 
 		 207 aa  215  2.9999999999999998e-55  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0405  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 207 aa  215  4e-55  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.916178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2270  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 203 aa  214  5.9999999999999996e-55  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0573155  hitchhiker  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2302  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 207 aa  214  7e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2592  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 205 aa  213  9.999999999999999e-55  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0221081  normal  0.907343 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0313  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 208 aa  213  9.999999999999999e-55  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.977941  normal  0.670617 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1013  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 206 aa  214  9.999999999999999e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000212014  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4666  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 206 aa  213  9.999999999999999e-55  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000332608  unclonable  0.00000000965042 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4295  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000502229  hitchhiker  0.00000000110473 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0315  30S ribosomal protein S4  51.2 
 
 		 203 aa  213  1.9999999999999998e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000187386  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0318  ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.665336  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1254  SSU ribosomal protein S4P  53.59 
 
 		 209 aa  213  1.9999999999999998e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.119667  normal  0.172003 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1841  30S ribosomal protein S4  51.43 
 
 		 206 aa  213  1.9999999999999998e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.470668  normal  0.674871 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0208  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 206 aa  212  2.9999999999999995e-54  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000000624869  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2044  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0881453  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1920  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1959  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  212  3.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2931  SSU ribosomal protein S4P  53.37 
 
 		 208 aa  211  4.9999999999999996e-54  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0070755  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0222  SSU ribosomal protein S4P  55.5 
 
 		 209 aa  211  7.999999999999999e-54  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.745829 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0959  30S ribosomal protein S4  51.44 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.317804  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1372  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  211  7.999999999999999e-54  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.179279  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2203  30S ribosomal protein S4  48.8 
 
 		 203 aa  210  1e-53  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00000000224183  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3980  ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 209 aa  210  1e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0454614  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0223  30S ribosomal protein S4  54.07 
 
 		 206 aa  210  1e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00230473  unclonable  0.0000000000516884 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3876  30S ribosomal protein S4  54.33 
 
 		 202 aa  210  1e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0255  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0223  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000007109  unclonable  0.0000000000236085 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0218  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  209  2e-53  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.000114073  hitchhiker  0.00573009 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3302  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00160725 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0705  30S ribosomal protein S4  50.96 
 
 		 208 aa  209  2e-53  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000946412  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2832  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  209  3e-53  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.80203  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1825  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 203 aa  208  4e-53  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0983  SSU ribosomal protein S4P  54.07 
 
 		 206 aa  208  4e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000000923822  hitchhiker  0.00443869 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0894  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 206 aa  208  5e-53  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000013906  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0172  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  207  6e-53  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000508668  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0206  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 203 aa  207  7e-53  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  hitchhiker  0.000707941  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3924  30S ribosomal protein S4  55.24 
 
 		 207 aa  207  7e-53  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0237  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000435795  unclonable  0.0000101717 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3500  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  207  7e-53  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0101758  hitchhiker  0.0000000843675 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01440  ribosomal protein S4  50 
 
 		 208 aa  207  9e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000107934  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0223  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000278242  normal  0.0713336 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4146  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000109466  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0220  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000964484  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2925  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 207 aa  207  1e-52  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227191 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0182  30S ribosomal protein S4  53.59 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000162542  hitchhiker  0.00157389 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4032  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  206  1e-52  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000000124947  hitchhiker  0.0000000000798632 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2613  30S ribosomal protein S4  53.11 
 
 		 206 aa  207  1e-52  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.872553  normal  0.744433 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06490  30S ribosomal protein S4  51.67 
 
 		 206 aa  206  2e-52  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2724  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 200 aa  205  3e-52  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000198678  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1937  30S ribosomal protein S4  49.52 
 
 		 208 aa  205  3e-52  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2432  30S ribosomal protein S4  50.48 
 
 		 208 aa  206  3e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3043  30S ribosomal protein S4  53.81 
 
 		 207 aa  206  3e-52  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.249876  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0194  30S ribosomal protein S4  52.63 
 
 		 206 aa  206  3e-52  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127646  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2348  30S ribosomal protein S4  49.76 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2734  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3735  30S ribosomal protein S4  52.15 
 
 		 206 aa  205  4e-52  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000110035  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0373  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.762852  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0352  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  205  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.243977 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3721  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.471129  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2607  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3503  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.535804  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3751  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.379241  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3144  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1949  30S ribosomal protein S4  53.33 
 
 		 207 aa  204  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3272  30S ribosomal protein S4  52.38 
 
 		 207 aa  204  6e-52  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00373853 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2994  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.63256 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1141  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 201 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.273227 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3155  30S ribosomal protein S4  51.9 
 
 		 207 aa  204  7e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1112  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 201 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1129  30S ribosomal protein S4  51.92 
 
 		 201 aa  204  7e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3779  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 207 aa  204  8e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0301  30S ribosomal protein S4  52.86 
 
 		 207 aa  204  9e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.152221  normal  0.0772792 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>