More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0052 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0052  50S ribosomal protein L15  100 
 
 
133 aa  265  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.712422  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0102  50S ribosomal protein L15  82.44 
 
 
133 aa  215  1e-55  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1857  50S ribosomal protein L15  78.12 
 
 
130 aa  201  2e-51  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1686  50S ribosomal protein L15  78.12 
 
 
130 aa  201  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2063  50S ribosomal protein L15  78.12 
 
 
130 aa  201  2e-51  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0077  50S ribosomal protein L15  75.59 
 
 
130 aa  194  5.000000000000001e-49  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.298672  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1758  50S ribosomal protein L15  72.52 
 
 
133 aa  190  5e-48  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0357402  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1015  50S ribosomal protein L15  70.45 
 
 
133 aa  189  1e-47  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0038652  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1950  ribosomal protein L15  67.94 
 
 
134 aa  187  5.999999999999999e-47  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0304  50S ribosomal protein L15  64.89 
 
 
132 aa  178  2e-44  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.888542  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1085  50S ribosomal protein L15  41.04 
 
 
146 aa  94.4  4e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.165048  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0699  50S ribosomal protein L15  47.58 
 
 
147 aa  94.4  5e-19  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.82238  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0645  50S ribosomal protein L15  45 
 
 
148 aa  93.6  9e-19  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000111424  hitchhiker  0.000000339891 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0720  ribosomal protein L15  49.6 
 
 
147 aa  93.2  1e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2314  ribosomal protein L15  44.19 
 
 
146 aa  92.4  2e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0114491  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2838  50S ribosomal protein L15  55.21 
 
 
148 aa  91.3  4e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.190663  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0314  ribosomal protein L15  46.92 
 
 
144 aa  90.5  8e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0194387  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0079  50S ribosomal protein L15  44.96 
 
 
144 aa  90.1  8e-18  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.213113  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1245  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
144 aa  89.7  1e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0277502  hitchhiker  0.00267047 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0952  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 
146 aa  89  2e-17  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0376093  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0309  50S ribosomal protein L15  46.96 
 
 
146 aa  89.4  2e-17  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  unclonable  2.36933e-28 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3309  50S ribosomal protein L15  54.17 
 
 
146 aa  89  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000932499 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2150  ribosomal protein L15  42.97 
 
 
144 aa  88.6  3e-17  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0266224  normal  0.13167 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1365  ribosomal protein L15  44.96 
 
 
149 aa  88.2  4e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.0025126  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4257  ribosomal protein L15  42.64 
 
 
144 aa  87.4  5e-17  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00000785215  unclonable  0.00000000000230267 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0885  50S ribosomal protein L15  42.76 
 
 
147 aa  87.8  5e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.487854  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2695  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2380  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0392  50S ribosomal protein L15  42.75 
 
 
143 aa  87  8e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.0068073  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0441  50S ribosomal protein L15  43.18 
 
 
147 aa  87  8e-17  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0400  50S ribosomal protein L15  42.75 
 
 
143 aa  87  8e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4933  ribosomal protein L15  38.97 
 
 
150 aa  86.7  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0104537  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1634  ribosomal protein L15  42.06 
 
 
148 aa  85.9  2e-16  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2306  ribosomal protein L15  42.19 
 
 
143 aa  85.1  3e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.494607  normal  0.411857 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3986  ribosomal protein L15  41.88 
 
 
176 aa  85.1  3e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0120912  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3160  50S ribosomal protein L15  47.41 
 
 
144 aa  84.3  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00889091  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0620  50S ribosomal protein L15  42.75 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.163377  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1041  50S ribosomal protein L15  44.72 
 
 
143 aa  84.7  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.140448  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0494  50S ribosomal protein L15P  41.98 
 
 
143 aa  84.3  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.420062  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1952  50S ribosomal protein L15  61.43 
 
 
165 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1927  50S ribosomal protein L15  61.43 
 
 
165 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2037  50S ribosomal protein L15  61.43 
 
 
165 aa  84  6e-16  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0727  50S ribosomal protein L15  42.28 
 
 
147 aa  84  7e-16  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0174765  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1855  ribosomal protein L15  39.58 
 
 
162 aa  84  7e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000152258  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0072  50S ribosomal protein L15  44.8 
 
 
146 aa  84  7e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.461938  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0333  50S ribosomal protein L15  46.96 
 
 
144 aa  83.6  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0239722  decreased coverage  0.00345429 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2931  50S ribosomal protein L15  46.22 
 
 
143 aa  83.6  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000484025 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3278  50S ribosomal protein L15  45.38 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.1219  hitchhiker  0.000182201 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3785  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468805  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3000  50S ribosomal protein L15  45.38 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0225964  normal  0.0517579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2613  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.305611  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0413  50S ribosomal protein L15  44.19 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0388  50S ribosomal protein L15  44.19 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1835  50S ribosomal protein L15  42.64 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.380683  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0424  50S ribosomal protein L15P  41.98 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.41995  normal  0.220664 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3757  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0366066  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2306  ribosomal protein L15  40.68 
 
 
144 aa  83.2  0.000000000000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000818267  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1832  50S ribosomal protein L15  47.5 
 
 
184 aa  82.8  0.000000000000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.281324  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0342  ribosomal protein L15  38.97 
 
 
142 aa  83.2  0.000000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.0000342315  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3727  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00477937  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0339  ribosomal protein L15  43.09 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.126422  hitchhiker  0.00264264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3150  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0138753  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2305  ribosomal protein L15  41.86 
 
 
143 aa  82.8  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.356329  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1930  50S ribosomal protein L15  40.31 
 
 
164 aa  83.2  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.663831 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3298  50S ribosomal protein L15  43.18 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3497  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0356  50S ribosomal protein L15  42.64 
 
 
143 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000022076  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1943  50S ribosomal protein L15  44.27 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.37846  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3890  50S ribosomal protein L15  43.09 
 
 
143 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0000709059  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0473  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.874189  hitchhiker  0.00000311349 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3625  50S ribosomal protein L15  46.96 
 
 
144 aa  82  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000359726  hitchhiker  0.0000000000162231 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0503  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000448251  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0506  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0331231  normal  0.0198269 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2238  50S ribosomal protein L15  39.85 
 
 
149 aa  82.4  0.000000000000002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.150633  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2441  50S ribosomal protein L15P  42.86 
 
 
146 aa  82  0.000000000000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2692  ribosomal protein L15  40 
 
 
147 aa  82.4  0.000000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4730  50S ribosomal protein L15  45.16 
 
 
144 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000304581  normal  0.615753 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0130  50S ribosomal protein L15  46.96 
 
 
146 aa  82  0.000000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.86911  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0645  ribosomal protein L15  44.35 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.182127  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4529  50S ribosomal protein L15  44.35 
 
 
144 aa  81.6  0.000000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0663764  normal  0.20573 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0738  ribosomal protein L15  41.09 
 
 
144 aa  82  0.000000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00000164514  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0839  50S ribosomal protein L15  40.91 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0234  50S ribosomal protein L15  44.62 
 
 
146 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000856605  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0305  50S ribosomal protein L15  44.92 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00213706  normal  0.150657 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0069  50S ribosomal protein L15  44 
 
 
146 aa  80.9  0.000000000000005  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0534535  hitchhiker  0.000000000000915919 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0978  50S ribosomal protein L15  41.86 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00708309  hitchhiker  0.00387669 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0440  50S ribosomal protein L15P  43.41 
 
 
144 aa  81.3  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.124289  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3424  50S ribosomal protein L15  40.77 
 
 
143 aa  80.9  0.000000000000005  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.200413 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5060  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
145 aa  80.9  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000270231  normal  0.131551 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3466  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0152588  normal  0.0772589 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06440  50S ribosomal protein L15  41.22 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2740  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0509969  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0346  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.187663  normal  0.0708986 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1266  ribosomal protein L15  45.92 
 
 
178 aa  80.9  0.000000000000006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0367  50S ribosomal protein L15  46.09 
 
 
144 aa  80.9  0.000000000000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.293833  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3895  50S ribosomal protein L15  40.46 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000614268  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0601  50S ribosomal protein L15  40.46 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000000630291  normal  0.89254 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0302  50S ribosomal protein L15  40.46 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000713012  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3930  50S ribosomal protein L15  42.98 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2820  50S ribosomal protein L15  41.98 
 
 
144 aa  80.5  0.000000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.355582  normal  0.252798 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>