26 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0042 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0042  50S ribosomal protein L29  100 
 
 
61 aa  120  7e-27  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.118761  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1960  ribosomal protein L29  83.05 
 
 
62 aa  99  2e-20  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.430573  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1025  50S ribosomal protein L29  78.69 
 
 
61 aa  94.7  4e-19  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00341949  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1769  50S ribosomal protein L29  73.77 
 
 
64 aa  92  2e-18  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.000104669  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0067  50S ribosomal protein L29  77.05 
 
 
61 aa  91.3  4e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00273848  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1867  50S ribosomal protein L29  72.88 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2073  50S ribosomal protein L29  72.88 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.0466832  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1696  50S ribosomal protein L29  72.88 
 
 
61 aa  86.3  1e-16  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00133107  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0294  50S ribosomal protein L29  57.38 
 
 
61 aa  67  0.00000000009  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00124097  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0092  50S ribosomal protein L29  70.49 
 
 
61 aa  48.1  0.00004  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.786092  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2170  ribosomal protein L29  44.07 
 
 
64 aa  45.4  0.0003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.37818  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0061  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 
70 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000925239  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0058  50S ribosomal protein L29  41.38 
 
 
64 aa  44.3  0.0006  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000783638  hitchhiker  2.2701500000000002e-18 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3330  50S ribosomal protein L29  43.64 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00000258995  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0273  ribosomal protein L29  48.28 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000123805  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1153  ribosomal protein L29  41.82 
 
 
71 aa  43.5  0.001  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000020056  hitchhiker  0.0000241726 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0766  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
67 aa  43.1  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000000346597  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf434  50S ribosomal protein L29  44.83 
 
 
88 aa  43.1  0.001  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3659  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 
69 aa  42.7  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000000152137  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23390  LSU ribosomal protein L29P  42.37 
 
 
69 aa  42.4  0.002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000127538  hitchhiker  0.000000855419 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1566  ribosomal protein L29  43.64 
 
 
68 aa  42.7  0.002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00135889  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1257  50S ribosomal protein L29  49.02 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.681642  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2911  50S ribosomal protein L29  47.37 
 
 
67 aa  42  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09920  LSU ribosomal protein L29P  42.37 
 
 
64 aa  42  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.0238741  hitchhiker  0.0000015632 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2849  50S ribosomal protein L29  46.55 
 
 
64 aa  41.6  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.851445  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0287  50S ribosomal protein L29P  34.48 
 
 
69 aa  41.6  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000000866901  hitchhiker  0.00000164935 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>