More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0038 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0038  30S ribosomal protein S19  100 
 
 
93 aa  191  2e-48  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.0039169  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2325  30S ribosomal protein S19  94.62 
 
 
93 aa  184  5e-46  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.00000150625  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1871  30S ribosomal protein S19  92.47 
 
 
93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1700  30S ribosomal protein S19  92.47 
 
 
93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000107992  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2077  30S ribosomal protein S19  92.47 
 
 
93 aa  181  4.0000000000000006e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.0000362901  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0063  30S ribosomal protein S19  91.4 
 
 
93 aa  178  2.9999999999999997e-44  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000375737  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1964  ribosomal protein S19  82.8 
 
 
93 aa  166  9e-41  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0147162  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0290  30S ribosomal protein S19  83.33 
 
 
91 aa  166  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00351648  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0088  30S ribosomal protein S19  87.1 
 
 
93 aa  154  3e-37  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.106882  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2061  ribosomal protein S19  67.78 
 
 
90 aa  134  3.0000000000000003e-31  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000000159778  normal  0.210432 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3334  30S ribosomal protein S19  67.78 
 
 
91 aa  132  1.9999999999999998e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  decreased coverage  0.0000000761945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4001  ribosomal protein S19  69.77 
 
 
89 aa  131  3e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.142935  normal  0.648316 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2320  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
90 aa  130  3.9999999999999996e-30  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.0000162124  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2253  SSU ribosomal protein S19P  66.67 
 
 
93 aa  131  3.9999999999999996e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000103026  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0771  30S ribosomal protein S19  69.41 
 
 
93 aa  130  6e-30  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.18349  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0664  30S ribosomal protein S19  64.52 
 
 
94 aa  130  6.999999999999999e-30  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000545855  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2836  30S ribosomal protein S19  66.67 
 
 
91 aa  129  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00000453521  normal  0.181034 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2853  30S ribosomal protein S19  75.9 
 
 
93 aa  128  2.0000000000000002e-29  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0833186  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0083  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
93 aa  129  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0974328 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0723  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  4.0000000000000003e-29  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000724937  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0473  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000000607565  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0327  ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  127  5.0000000000000004e-29  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000195023  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0253  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000113028  normal  0.0178687 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1928  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.00000295141  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3482  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0000804319  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3640  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.0000000927803  hitchhiker  0.0000000000150693 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2628  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.00158971  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3772  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000000265315  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3451  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000000490482  decreased coverage  0.00387887 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0280  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000442981  normal  0.0699946 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3165  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000403295  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3064  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.0000207611  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0318  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000548079  decreased coverage  0.00231518 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2755  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00000407777  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0271  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00149939  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3800  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.238183  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3742  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000490611  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0352  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.0000694495  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0331  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  127  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000218247  normal  0.0337389 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1761  30S ribosomal protein S19  71.08 
 
 
93 aa  127  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0120416  normal  0.38061 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0217  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  125  1.0000000000000001e-28  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00000102796  unclonable  0.00000723515 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0323  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000170652  unclonable  0.0000000367695 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0409  30S ribosomal protein S19  66.27 
 
 
91 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000987549  normal  0.134092 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00734  ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  125  2.0000000000000002e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4313  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00000152177  unclonable  0.0000000000439739 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2946  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0382693  decreased coverage  0.000000116532 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3293  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  124  3e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000043477  hitchhiker  0.00000613779 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0235  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0204  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.0000147318  unclonable  0.00000836266 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0200  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.0000160903  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0282  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  124  3e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.135228  hitchhiker  0.00000000656503 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0299  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
90 aa  124  3e-28  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00139488  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0277  30S ribosomal protein S19  66.3 
 
 
92 aa  124  3e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  hitchhiker  0.00000202257  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0174  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000186112  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2320  ribosomal protein S19  67.47 
 
 
90 aa  125  3e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  hitchhiker  0.0000230352  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4686  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000144856  unclonable  0.0000000151604 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4052  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000500624  unclonable  0.00000000000533461 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0063  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  125  3e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000291736  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0203  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000219443  unclonable  0.0000000000154128 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0198  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00349045  hitchhiker  0.00163948 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001738  SSU ribosomal protein S19p (S15e)  68.67 
 
 
92 aa  124  3e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000320584  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0152  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012398  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3755  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000000285402  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0342  30S ribosomal protein S19  65.22 
 
 
92 aa  125  3e-28  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0483388  decreased coverage  0.000267992 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4166  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000000556834  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0203  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  3e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000108032  hitchhiker  0.00000000125391 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2368  ribosomal protein S19  63.33 
 
 
90 aa  124  4.0000000000000003e-28  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.540425  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0324  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  124  4.0000000000000003e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0470216  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3015  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
91 aa  124  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00000505191  decreased coverage  0.00185866 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2770  ribosomal protein S19  65.56 
 
 
90 aa  124  5e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.000879656  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0630  30S ribosomal protein S19  72.29 
 
 
93 aa  124  5e-28  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000177682  hitchhiker  0.00000000120384 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1268  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000477876  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2170  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
92 aa  124  5e-28  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000043951  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1559  ribosomal protein S19  66.28 
 
 
95 aa  124  5e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.917547  normal  0.993871 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0712  ribosomal protein S19  62.64 
 
 
92 aa  124  5e-28  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.672923  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0188  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  124  6e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000819027  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3175  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  124  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00320627  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0162  30S ribosomal protein S19  63.33 
 
 
92 aa  124  6e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000728304  decreased coverage  0.0000475067 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0283  SSU ribosomal protein S19P  64.44 
 
 
91 aa  123  7e-28  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000000019413  hitchhiker  0.00000161799 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2165  ribosomal protein S19  69.88 
 
 
90 aa  123  7e-28  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00915684  normal  0.130063 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04517  30S ribosomal protein S19  71.76 
 
 
89 aa  123  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.000000490547  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0684  30S ribosomal protein S19  64.44 
 
 
92 aa  123  9e-28  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.809282  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0395  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  122  1e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00895016  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3313  30S ribosomal protein S19  68.67 
 
 
91 aa  122  1e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00000716821  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3520  ribosomal protein S19  66.27 
 
 
92 aa  123  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.000623119  hitchhiker  0.00000086131 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0869  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  122  2e-27  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0398  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0373  30S ribosomal protein S19  62.22 
 
 
92 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0493  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  122  2e-27  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000000216881  hitchhiker  0.00346795 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0760  30S ribosomal protein S19  67.74 
 
 
89 aa  122  2e-27  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000341891  normal  0.0171843 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3439  30S ribosomal protein S19  69.88 
 
 
91 aa  122  2e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00121291  normal  0.122841 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0488  30S ribosomal protein S19  63.86 
 
 
91 aa  122  2e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.00000040228  normal  0.0259366 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3791  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  121  3e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.498806  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3905  30S ribosomal protein S19  65.06 
 
 
91 aa  121  3e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296371  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4272  30S ribosomal protein S19  61.11 
 
 
91 aa  121  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.0000253887  unclonable  0.00000000000338266 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_06290  30S ribosomal protein S19  58.89 
 
 
91 aa  121  3e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.336646  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0341  30S ribosomal protein S19  58.89 
 
 
95 aa  121  4e-27  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  6.9817e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0630  ribosomal protein S19  62.65 
 
 
91 aa  121  4e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.000445779  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4909  30S ribosomal protein S19  64.13 
 
 
92 aa  121  4e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  hitchhiker  0.00546448  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3995  30S ribosomal protein S19  67.47 
 
 
91 aa  120  4e-27  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000322685 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>