More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0037 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0037  50S ribosomal protein L2  100 
 
 		 276 aa  560  1.0000000000000001e-159  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00257974  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0352  50S ribosomal protein L2  90.97 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000147687  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1029  50S ribosomal protein L2  91.34 
 
 		 277 aa  520  1e-146  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000494173  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0062  50S ribosomal protein L2  87.68 
 
 		 276 aa  501  1e-141  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000124196  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1872  50S ribosomal protein L2  87.68 
 
 		 276 aa  503  1e-141  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.701919  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1701  50S ribosomal protein L2  87.32 
 
 		 276 aa  501  1e-141  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000371548  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2078  50S ribosomal protein L2  86.96 
 
 		 276 aa  499  1e-140  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00000477294  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0087  50S ribosomal protein L2  84.78 
 
 		 276 aa  476  1e-133  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.025242  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1965  ribosomal protein L2  85.51 
 
 		 276 aa  473  1e-132  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000977898  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0289  50S ribosomal protein L2  77.01 
 
 		 279 aa  441  1e-123  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0147738  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23440  LSU ribosomal protein L2P  63.77 
 
 		 276 aa  350  1e-95  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  unclonable  0.00000561637  decreased coverage  0.0000000103379 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09970  LSU ribosomal protein L2P  64.26 
 
 		 276 aa  348  7e-95  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.7223  hitchhiker  0.00000165173 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01200  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 277 aa  345  3e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0770167  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2175  ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 276 aa  341  9e-93  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0289  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 275 aa  340  2e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0283371  normal  0.0481443 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1181  ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 274 aa  337  9e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000178958  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2457  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 276 aa  337  9.999999999999999e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.0871736 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0218  50S ribosomal protein L2  61.23 
 
 		 275 aa  332  3e-90  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00127498  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0870  50S ribosomal protein L2  63.41 
 
 		 275 aa  332  5e-90  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000015035  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1349  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 274 aa  330  1e-89  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2906  50S ribosomal protein L2  62.68 
 
 		 275 aa  329  3e-89  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0172805  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2708  ribosomal protein L2  60.36 
 
 		 276 aa  328  5.0000000000000004e-89  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000275562  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1158  ribosomal protein L2  58.63 
 
 		 278 aa  327  9e-89  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.00000162145  hitchhiker  0.000000663071 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1070  50S ribosomal protein L2  62.64 
 
 		 274 aa  327  1.0000000000000001e-88  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000147453  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2711  50S ribosomal protein L2  61.87 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2396  50S ribosomal protein L2  61.87 
 
 		 277 aa  326  3e-88  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.445207  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0425  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 276 aa  325  6e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000111287  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0629  50S ribosomal protein L2  61.54 
 
 		 274 aa  324  1e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000833663  hitchhiker  0.00000000000856838 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0850  50S ribosomal protein L2  60.29 
 
 		 277 aa  323  1e-87  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00104266  decreased coverage  0.0000130499 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0704  50S ribosomal protein L2  62.04 
 
 		 273 aa  321  8e-87  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000350454  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0110  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2854  50S ribosomal protein L2  61.17 
 
 		 274 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.16125  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0114  50S ribosomal protein L2  61.96 
 
 		 276 aa  318  5e-86  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000290971  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2315  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 277 aa  318  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.000000290927  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2274  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 277 aa  318  7e-86  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  unclonable  0.0000000299614  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0936  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 		 274 aa  318  9e-86  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000014248  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2293  50S ribosomal protein L2  57.86 
 
 		 279 aa  317  1e-85  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0106582  normal  0.012024 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3325  50S ribosomal protein L2  60.81 
 
 		 274 aa  317  1e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000129312 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0683  50S ribosomal protein L2  59.71 
 
 		 274 aa  316  2e-85  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.660032  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1762  50S ribosomal protein L2  60.58 
 
 		 276 aa  315  5e-85  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  hitchhiker  0.00807764  normal  0.409688 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2904  ribosomal protein L2  57.97 
 
 		 275 aa  315  6e-85  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1904  50S ribosomal protein L2  58.27 
 
 		 277 aa  315  7e-85  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0061  50S ribosomal protein L2  58.42 
 
 		 277 aa  314  9e-85  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.41006  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1828  50S ribosomal protein L2  57.55 
 
 		 277 aa  314  9.999999999999999e-85  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.256739  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2771  50S ribosomal protein L2  61.01 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00347741  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0107  50S ribosomal protein L2  60.65 
 
 		 276 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000204251  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2062  50S ribosomal protein L2  61.31 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.0000000331539  normal  0.228916 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2330  50S ribosomal protein L2  57.82 
 
 		 275 aa  313  1.9999999999999998e-84  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.000156043  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1521  ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 275 aa  312  2.9999999999999996e-84  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0113  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  unclonable  0.00000000200839  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0113  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  unclonable  0.000000000138046  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0109  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  2.27306e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0107  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000901221  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0228  50S ribosomal protein L2  57.66 
 
 		 275 aa  312  3.9999999999999997e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.728905  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0113  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  unclonable  0.00000000000512601  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0125  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.14187e-61 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0144  50S ribosomal protein L2  59.93 
 
 		 276 aa  312  3.9999999999999997e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.00000000100516  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2254  50S ribosomal protein L2  59.85 
 
 		 276 aa  310  1e-83  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000201463  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0787  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 274 aa  311  1e-83  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.469967  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1742  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 276 aa  310  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000110614  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0108  50S ribosomal protein L2  59.57 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  unclonable  0.000000187869  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0082  50S ribosomal protein L2  58.39 
 
 		 276 aa  309  2.9999999999999997e-83  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.173583 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5192  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000180933  unclonable  2.65522e-25 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0134  50S ribosomal protein L2  59.21 
 
 		 276 aa  308  4e-83  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000249417  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1229  50S ribosomal protein L2  57.88 
 
 		 275 aa  308  5e-83  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.624705  unclonable  0.0000121783 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0711  50S ribosomal protein L2  59.12 
 
 		 275 aa  308  6.999999999999999e-83  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.876488  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2152  50S ribosomal protein L2  57.61 
 
 		 279 aa  308  8e-83  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0924201  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1864  50S ribosomal protein L2  58.27 
 
 		 277 aa  307  1.0000000000000001e-82  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0213539  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0718  ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 273 aa  306  3e-82  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1343  ribosomal protein L2  56.83 
 
 		 279 aa  305  7e-82  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0840  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.419692  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08880  50S ribosomal protein L2  55.84 
 
 		 273 aa  304  1.0000000000000001e-81  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0116261 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0288  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 274 aa  303  2.0000000000000002e-81  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.101113  n/a   
 
 
-
 
NC_011025  MARTH_orf440  50S ribosomal protein L2  57.35 
 
 		 281 aa  302  3.0000000000000004e-81  Mycoplasma arthritidis 158L3-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2531  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 279 aa  302  4.0000000000000003e-81  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.445887  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0694  50S ribosomal protein L2  58.82 
 
 		 287 aa  301  6.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00211234  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4918  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 275 aa  301  8.000000000000001e-81  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.113284  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1182  50S ribosomal protein L2  56.57 
 
 		 275 aa  301  8.000000000000001e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.566503 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0285  50S ribosomal protein L2  56.68 
 
 		 280 aa  301  1e-80  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0408  50S ribosomal protein L2  55.27 
 
 		 273 aa  301  1e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00399178  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1719  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.238282  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1391  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  unclonable  0.00000232502  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0364  50S ribosomal protein L2  55.43 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.838149  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1792  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 278 aa  300  2e-80  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.109634  normal  0.0522844 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1295  50S ribosomal protein L2  58.18 
 
 		 276 aa  300  2e-80  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000122183  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0762  50S ribosomal protein L2  56.32 
 
 		 279 aa  300  2e-80  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.052515  normal  0.51938 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3664  50S ribosomal protein L2  58.99 
 
 		 281 aa  299  3e-80  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000272816  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2399  50S ribosomal protein L2  56.2 
 
 		 276 aa  299  3e-80  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00287166  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0989  50S ribosomal protein L2  54.21 
 
 		 278 aa  299  3e-80  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.227684  normal  0.0318056 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0663  50S ribosomal protein L2  57.71 
 
 		 282 aa  299  4e-80  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.000112808  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1675  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 278 aa  299  4e-80  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4023  50S ribosomal protein L2  56.93 
 
 		 275 aa  298  5e-80  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.796821  hitchhiker  0.00000688583 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1480  50S ribosomal protein L2  57.25 
 
 		 281 aa  298  6e-80  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  unclonable  0.000000000000349234  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl126  50S ribosomal protein L2  57.3 
 
 		 281 aa  298  7e-80  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0445797  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0286  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 274 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00000315964  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0587  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 274 aa  298  7e-80  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000050829  normal  0.227169 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3912  50S ribosomal protein L2  54.32 
 
 		 274 aa  298  7e-80  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  1.5044e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0351  50S ribosomal protein L2  55.68 
 
 		 275 aa  298  7e-80  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00000123883  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0396  50S ribosomal protein L2  54.55 
 
 		 273 aa  297  1e-79  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000072222  hitchhiker  0.000353424 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0279  50S ribosomal protein L2  55.31 
 
 		 275 aa  297  1e-79  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  decreased coverage  0.000000000585498  normal  0.0839884 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>