16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0015 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008599  CFF8240_0015  putative helix-turn-helix containsing protein  100 
 
 		 353 aa  710    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0345  putative helix-turn-helix containsing protein  42.31 
 
 		 364 aa  286  2.9999999999999996e-76  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000345136  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1064  putative helix-turn-helix containsing protein  40.27 
 
 		 365 aa  268  1e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0000317042  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0431  putative helix-turn-helix containsing protein  40.38 
 
 		 368 aa  253  3e-66  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1970  hypothetical protein  32.23 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  decreased coverage  0.000000826676  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0056  conserved hypothetical ATP-binding protein  30.75 
 
 		 353 aa  157  2e-37  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.000000112269  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0284  uncharacterized ATPase  28.13 
 
 		 354 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00295155  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1518  hypothetical protein  29.89 
 
 		 345 aa  120  4.9999999999999996e-26  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1704  hypothetical protein  29.35 
 
 		 345 aa  117  3e-25  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.287149  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1884  hypothetical protein  28.8 
 
 		 345 aa  116  5e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2115  ATPase  23.92 
 
 		 428 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0382  hypothetical protein  28.43 
 
 		 430 aa  59.3  0.0000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0904  ATPase  22.78 
 
 		 428 aa  50.4  0.00005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.49289  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0254  hypothetical protein  20.26 
 
 		 421 aa  50.1  0.00007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.225348  normal  0.118561 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1407  hypothetical protein  25.16 
 
 		 403 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0262  ATPase  25.54 
 
 		 427 aa  43.9  0.004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.626918  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>