More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CFF8240_0001 on replicon NC_008599
Organism: Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2056  chromosomal replication initiation protein  69.89 
 
 
436 aa  655    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0001  chromosomal replication initiation protein  100 
 
 
436 aa  890    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.76217  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1853  chromosomal replication initiation protein  67.36 
 
 
436 aa  612  9.999999999999999e-175  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0003  chromosomal replication initiator protein DnaA  62.27 
 
 
441 aa  574  1.0000000000000001e-163  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00105638  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0001  chromosomal replication initiation protein  59.5 
 
 
440 aa  544  1e-153  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.879571  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0001  chromosomal replication initiation protein  59.73 
 
 
440 aa  543  1e-153  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0027  chromosomal replication initiation protein  59.04 
 
 
440 aa  540  9.999999999999999e-153  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.984359  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0001  chromosomal replication initiation protein  58.35 
 
 
442 aa  508  1e-143  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0001  chromosomal replication initiation protein  50.12 
 
 
435 aa  452  1.0000000000000001e-126  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  50.46 
 
 
437 aa  444  1e-123  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.11482  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0001  chromosomal replication initiation protein  38.37 
 
 
450 aa  347  2e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0001  chromosomal replication initiation protein  38.83 
 
 
450 aa  346  5e-94  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.00000000447845  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  337  2.9999999999999997e-91  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000585905  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5319  chromosomal replication initiation protein  37.75 
 
 
446 aa  336  3.9999999999999995e-91  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.679479  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0001  chromosomal replication initiation protein  49.7 
 
 
458 aa  335  7.999999999999999e-91  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  decreased coverage  0.00000304436  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0001  chromosomal replication initiation protein  49.4 
 
 
460 aa  335  1e-90  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0001  chromosomal replication initiation protein  37.58 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.000594007  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000244098  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000163866  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus cereus E33L  Bacteria  unclonable  0.00000000459109  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.00000000425777  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0001  chromosomal replication initiation protein  37.36 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0001  chromosomal replication initiation protein  37.58 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000184902  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0001  chromosomal replication initiation protein  38.04 
 
 
446 aa  334  2e-90  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.000000325337  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0001  chromosomal replication initiation protein  37.33 
 
 
446 aa  333  3e-90  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.562714  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  37.61 
 
 
453 aa  326  6e-88  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.000000000208022  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
443 aa  325  7e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00172749  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0001  chromosomal replication initiation protein  40.93 
 
 
449 aa  324  2e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0001  chromosomal replication initiation protein  38.13 
 
 
457 aa  324  2e-87  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000458864  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.26 
 
 
443 aa  322  7e-87  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.49 
 
 
503 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0001  chromosomal replication initiation protein  38.13 
 
 
457 aa  322  9.999999999999999e-87  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00000597417  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0002  chromosomal replication initiation protein  36.16 
 
 
442 aa  320  3.9999999999999996e-86  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0135977  hitchhiker  0.0000101386 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0000.1  chromosomal replication initiation protein  38.76 
 
 
445 aa  318  1e-85  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.159401  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0001  chromosomal replication initiation protein  45.7 
 
 
450 aa  317  2e-85  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0001  initiation of chromosome replication  38.76 
 
 
436 aa  315  9.999999999999999e-85  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0001  chromosomal replication initiation protein  37.19 
 
 
441 aa  314  1.9999999999999998e-84  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000247534  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.04 
 
 
463 aa  311  1e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00536902  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.69 
 
 
591 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  hitchhiker  0.000633656  unclonable  0.0000000292755 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.69 
 
 
587 aa  310  2.9999999999999997e-83  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  hitchhiker  0.00000000718914  hitchhiker  0.000588843 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0001  chromosomal replication initiation protein  35.21 
 
 
451 aa  310  4e-83  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000764641  normal  0.435321 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.95 
 
 
474 aa  310  4e-83  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  hitchhiker  0.00000398294  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.28 
 
 
528 aa  309  5e-83  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.561876  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  46.06 
 
 
515 aa  308  1.0000000000000001e-82  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0001  chromosomal replication initiation protein  43.62 
 
 
491 aa  308  1.0000000000000001e-82  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.66 
 
 
480 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  32.73 
 
 
454 aa  307  3e-82  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.00039195  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0001  chromosomal replication initiation protein  38.15 
 
 
452 aa  306  4.0000000000000004e-82  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  3.98376e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.11 
 
 
461 aa  306  5.0000000000000004e-82  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  unclonable  0.0000000704659  normal  0.0525005 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  34.87 
 
 
458 aa  305  1.0000000000000001e-81  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0001  chromosomal replication initiation protein  35.75 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0001  chromosomal replication initiation protein  35.75 
 
 
452 aa  305  1.0000000000000001e-81  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0001  chromosomal replication initiation protein  37.27 
 
 
459 aa  305  1.0000000000000001e-81  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  0.0000386226  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  38.95 
 
 
473 aa  305  1.0000000000000001e-81  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.0000000000000284064 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.94 
 
 
446 aa  304  3.0000000000000004e-81  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000208181  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0001  chromosomal replication initiation protein  43.22 
 
 
490 aa  303  3.0000000000000004e-81  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1227  chromosomal replication initiation protein  35.48 
 
 
449 aa  303  4.0000000000000003e-81  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.174697  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0001  chromosomal replication initiation protein  43.57 
 
 
477 aa  303  4.0000000000000003e-81  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0001  chromosomal replication initiation protein  43.92 
 
 
492 aa  302  6.000000000000001e-81  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.943807  normal  0.152297 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.18 
 
 
453 aa  302  9e-81  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.71 
 
 
449 aa  301  1e-80  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141272  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0001  chromosomal replication initiation protein  41.07 
 
 
464 aa  301  1e-80  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000013935  decreased coverage  1.67388e-26 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0001  chromosomal replication initiation protein  35.56 
 
 
440 aa  302  1e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000118947  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.41 
 
 
444 aa  300  2e-80  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  39.37 
 
 
454 aa  300  2e-80  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00000331762  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0001  chromosomal replication initiation protein  41.76 
 
 
524 aa  301  2e-80  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0237228  normal  0.131634 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_00010  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.25 
 
 
490 aa  300  3e-80  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.49 
 
 
527 aa  300  3e-80  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0861644  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.11 
 
 
566 aa  300  4e-80  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  decreased coverage  0.0000150843  normal  0.201816 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0001  chromosomal replication initiation protein  36.13 
 
 
451 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  decreased coverage  0.000000000123931  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0001  chromosomal replication initiation protein  36.13 
 
 
451 aa  300  4e-80  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00187127  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2371  chromosomal replication initiation protein  37.27 
 
 
443 aa  299  6e-80  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0166544  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0001  DNA replication initiation ATPase- like protein  43.1 
 
 
582 aa  299  7e-80  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.00000523076  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.65 
 
 
721 aa  299  8e-80  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00000423182  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0001  chromosomal replication initiation protein  35.39 
 
 
455 aa  298  1e-79  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.632445  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0001  chromosomal replication initiation protein  34.24 
 
 
462 aa  298  1e-79  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000281438  unclonable  0.0000000118337 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0001  chromosomal replication initiation protein  37.24 
 
 
445 aa  298  2e-79  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.00343862  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.7 
 
 
518 aa  298  2e-79  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.7384  hitchhiker  0.00538334 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0032  chromosomal replication initiation protein  35.29 
 
 
463 aa  298  2e-79  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.0000217775  normal  0.251102 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0001  chromosomal replication initiation protein  39.82 
 
 
478 aa  296  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0000339822  hitchhiker  0.0000314878 
 
 
-
 
NC_002977  MCA3033  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.34 
 
 
442 aa  296  3e-79  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.949168  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  35.59 
 
 
462 aa  297  3e-79  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.138659  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  43.92 
 
 
476 aa  296  4e-79  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  unclonable  0.00000000240109  normal  0.165841 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  42.38 
 
 
534 aa  296  4e-79  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0001  chromosomal replication initiation protein  37.41 
 
 
450 aa  296  7e-79  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000322878  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0001  chromosomal replication initiation protein  40.12 
 
 
472 aa  295  8e-79  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000368077  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.1 
 
 
455 aa  295  1e-78  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.738178 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  36.91 
 
 
469 aa  295  1e-78  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.000259143  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0001  chromosomal replication initiation protein  44.64 
 
 
440 aa  295  1e-78  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.203604  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0001  chromosomal replication initiation protein  43.32 
 
 
491 aa  295  1e-78  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.96301  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0001  chromosomal replication initiation protein  35.14 
 
 
465 aa  295  1e-78  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00429077  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  40.87 
 
 
570 aa  295  1e-78  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.000116219  normal  0.231349 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0001  chromosomal replication initiation protein  42.09 
 
 
487 aa  295  2e-78  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00605191  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0001  chromosomal replication initiation protein  42.69 
 
 
615 aa  294  2e-78  Thermobifida fusca YX  Bacteria  unclonable  0.000000000479277  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2133  chromosomal replication initiation protein  41.03 
 
 
489 aa  295  2e-78  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  unclonable  0.00000000845727  normal  0.662665 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  41.67 
 
 
562 aa  294  2e-78  Frankia sp. CcI3  Bacteria  unclonable  0.0000000690317  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2553  chromosomal replication initiation protein  35.51 
 
 
451 aa  293  3e-78  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000248403  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0001  chromosomal replication initiation protein  41.49 
 
 
453 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000795473  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0001  chromosomal replication initiation protein  41.49 
 
 
453 aa  294  3e-78  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.101414  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0001  chromosomal replication initiator protein DnaA  44.2 
 
 
468 aa  292  8e-78  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>