More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2134 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2134  tRNA-Glu  100 
 
 		 75 bp  149  1.0000000000000001e-34  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00397523  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1672  tRNA-Glu  98.67 
 
 		 75 bp  141  3e-32  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.990539  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1710  tRNA-Glu  96 
 
 		 75 bp  125  2e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.48567  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2209  tRNA-Glu  96 
 
 		 77 bp  125  2e-27  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.35059  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0046  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1490  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 72 bp  119  9e-26  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1585  tRNA-Glu  95.83 
 
 		 77 bp  119  9e-26  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.158615  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0182  tRNA-Glu  94.67 
 
 		 75 bp  117  3.9999999999999997e-25  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_R0018  tRNA-Glu  97.96 
 
 		 72 bp  89.7  8e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.141914 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0605  tRNA-Glu  89.33 
 
 		 75 bp  85.7  0.000000000000001  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.221994  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0052  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.662201 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0006  tRNA-Glu  89.47 
 
 		 76 bp  79.8  0.00000000000008  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.439898 
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2221  tRNA-Glu  88 
 
 		 77 bp  77.8  0.0000000000003  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0001  tRNA-Glu  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0190537  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0001  tRNA-Glu  88.73 
 
 		 75 bp  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0745  tRNA-Glu  97.56 
 
 		 75 bp  73.8  0.000000000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.105433  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0077  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t1600  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000236382  normal  0.392081 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0077  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0030  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000000352546  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_t0454  tRNA-Glu  91.07 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  0.134142 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0030  tRNA-Glu  88.24 
 
 		 72 bp  71.9  0.00000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000403372  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_R0027  tRNA-Glu  97.5 
 
 		 75 bp  71.9  0.00000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.251037  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_R0055  tRNA-Glu  88.16 
 
 		 76 bp  71.9  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0042  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0336501  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_2176  tRNA-Glu  86.67 
 
 		 75 bp  69.9  0.00000000008  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0024  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.574829  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0050  tRNA-Glu  89.39 
 
 		 76 bp  67.9  0.0000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.190647  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0099  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000545128  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_R0031  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0217674  hitchhiker  0.000684647 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_R0018  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000034168  normal  0.183849 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0064  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.554799  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0009  tRNA-Glu  87.69 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.488573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0097  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000000640462  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0073  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 76 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0122023  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0031  tRNA-Glu  90.57 
 
 		 75 bp  65.9  0.000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0040985  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0032  tRNA-Glu  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.519477  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0035  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.278246  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0044  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000149136  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  90.2 
 
 		 72 bp  61.9  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5649  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000000534541  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5658  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000000540002  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5673  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000836354  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0271  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5665  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.00000888654  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0050  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.162753  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_R0063  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.276545  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000143078  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0076  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  0.0000000555984  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_R0033  tRNA-Glu  97.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.150537  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00000000178514  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-1  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000814932  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00786644  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000000632296  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0079  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0000510385  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0190  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000533026  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-2  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000147192  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000240396  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0602  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101894  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5146  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000335132  normal  0.576058 
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Glu-7  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 78 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000806398  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5051  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000192208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-3  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000000044884  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Glu-4  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000000000436983  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0044  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000245211  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_R0035  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.00000000414108  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0043  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0132709  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_R0062  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000161369  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_R0017  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0051  tRNA-Glu  85.33 
 
 		 75 bp  61.9  0.00000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.41574 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0526  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.33331e-28 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0293  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  unclonable  0.000000000258541  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5708  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000091391  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5652  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.0000748883  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4775  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000223531  hitchhiker  0.00000000000000424318 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0169  tRNA-Glu  88.14 
 
 		 77 bp  61.9  0.00000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0185201 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0186  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t24  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0564834  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR_t25  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 72 bp  58  0.0000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0571109  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0092  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000633389  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_R0008  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.862218 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0030  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  1.2294100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0082  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000179786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0045  tRNA-Glu  88.68 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000502563  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0014  tRNA-Glu  87.72 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000021205  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2009  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  58  0.0000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0391  tRNA-Glu  86.96 
 
 		 73 bp  58  0.0000003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1242  tRNA-Glu  92.68 
 
 		 75 bp  58  0.0000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0541834  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_t33  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 73 bp  56  0.000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.285433 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5646  tRNA-Glu  87.5 
 
 		 72 bp  56  0.000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000268036  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_t32  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0584269  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA39  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.783995  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_RNA58  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.237213  normal  0.68605 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_R0045  tRNA-Glu  100 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R33  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R35  tRNA-Glu  86.76 
 
 		 76 bp  56  0.000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>