156 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2101 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2101  radical SAM family protein  100 
 
 		 417 aa  848    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2925  Radical SAM domain protein  46.23 
 
 		 440 aa  360  3e-98  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258536  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1387  radical SAM family protein  39.81 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05050  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  37.18 
 
 		 457 aa  279  5e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2369  Radical SAM domain protein  40.28 
 
 		 435 aa  261  1e-68  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0697954  normal  0.318858 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00200  pyruvate formate-lyase activating-like enzyme  35 
 
 		 464 aa  236  8e-61  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.158297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3410  Radical SAM domain protein  26.36 
 
 		 433 aa  97.1  5e-19  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.736979  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1369  hypothetical protein  25.77 
 
 		 471 aa  94  4e-18  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1025  Radical SAM domain protein  24.56 
 
 		 409 aa  91.3  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1481  radical SAM domain-containing protein  27.92 
 
 		 371 aa  88.2  3e-16  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.0924558  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0398  radical SAM domain-containing protein  28.16 
 
 		 371 aa  84  0.000000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0698777  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2157  radical SAM domain-containing protein  27.71 
 
 		 343 aa  83.6  0.000000000000006  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.350893  hitchhiker  0.000485535 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0983  radical SAM domain-containing protein  29.9 
 
 		 380 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.156314  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0439  radical SAM domain-containing protein  31.55 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0043  radical SAM family Fe-S protein  27.55 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000004  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0508  radical SAM domain-containing protein  29.43 
 
 		 373 aa  77.8  0.0000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1063  Radical SAM domain protein  27.48 
 
 		 350 aa  75.1  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.540032  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0464  radical SAM domain-containing protein  25.67 
 
 		 353 aa  73.9  0.000000000005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0273  hypothetical protein  29.95 
 
 		 353 aa  72  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.888723  normal  0.245364 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0016  radical SAM domain-containing protein  23.26 
 
 		 344 aa  63.5  0.000000006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.238462  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1327  Radical SAM domain protein  26.2 
 
 		 375 aa  58.5  0.0000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000000215386  hitchhiker  0.00000524996 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0772  Radical SAM domain protein  24.8 
 
 		 353 aa  57.4  0.0000005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.00827536  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1279  Radical SAM domain protein  32.71 
 
 		 327 aa  56.6  0.0000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000563551 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5017  radical SAM family protein  26.04 
 
 		 387 aa  56.2  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.44 
 
 		 317 aa  54.7  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2319  radical SAM domain-containing protein  27.75 
 
 		 360 aa  54.3  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.111929  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1690  radical SAM family protein  29.93 
 
 		 330 aa  53.9  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000452598  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4772  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  33.33 
 
 		 217 aa  53.5  0.000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.562953  normal  0.131097 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2366  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.47 
 
 		 332 aa  53.1  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2213  heme biosynthesis protein (NirJ-2)  27.54 
 
 		 479 aa  53.1  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0377777 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3366  radical SAM family protein  23.53 
 
 		 374 aa  53.1  0.000009  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0273275 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1968  Radical SAM domain protein  29.03 
 
 		 458 aa  52.8  0.00001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1680  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.46 
 
 		 397 aa  52.8  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.725852 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 565 aa  51.6  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1036  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.5 
 
 		 298 aa  52.4  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.643895  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1561  radical SAM domain-containing protein  25.12 
 
 		 455 aa  52.4  0.00002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.0998899  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0231  radical SAM family protein  35.78 
 
 		 445 aa  51.6  0.00003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0106929  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2893  radical SAM domain-containing protein  30.53 
 
 		 370 aa  50.8  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00746158  normal  0.722126 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1233  radical SAM family Fe-S protein  27.78 
 
 		 346 aa  50.4  0.00005  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.128205  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2836  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  25.99 
 
 		 381 aa  50.8  0.00005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.93 
 
 		 298 aa  50.8  0.00005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.370128  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0292  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.58 
 
 		 386 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.876947 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1688  radical SAM family protein  32.8 
 
 		 326 aa  50.4  0.00006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.52361  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0322  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.43 
 
 		 298 aa  50.1  0.00008  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1604  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.83 
 
 		 328 aa  49.7  0.00009  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0784  radical SAM family protein  27.14 
 
 		 337 aa  49.7  0.0001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  decreased coverage  0.00132902  normal  0.107419 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1715  Radical SAM domain protein  26.74 
 
 		 370 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.707887  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0964  radical SAM domain-containing protein  24.4 
 
 		 300 aa  49.7  0.0001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1616  Radical SAM domain protein  27.27 
 
 		 370 aa  49.7  0.0001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.230625  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0169  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  23.97 
 
 		 375 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.280654  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1156  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.23 
 
 		 322 aa  48.9  0.0002  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1859  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.89 
 
 		 334 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.155054 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  24.86 
 
 		 299 aa  47.8  0.0003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2062  radical SAM domain-containing protein  23.22 
 
 		 341 aa  48.1  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0822  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.23 
 
 		 322 aa  48.1  0.0003  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0225831  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11650  predicted Fe-S oxidoreductase  37.68 
 
 		 769 aa  47.8  0.0004  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  0.920993 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0341  Radical SAM domain protein  35.87 
 
 		 358 aa  47.4  0.0005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.0000860608  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5883  radical SAM domain-containing protein  23.39 
 
 		 332 aa  47.4  0.0005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2076  Radical SAM domain protein  27.56 
 
 		 382 aa  47.4  0.0005  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0416  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.15 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.315113  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  28.26 
 
 		 292 aa  47  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2016  Radical SAM domain protein  28.57 
 
 		 315 aa  47  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0248343  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2372  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.87 
 
 		 341 aa  47  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.760376  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  28.48 
 
 		 427 aa  47  0.0006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0951  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.57 
 
 		 338 aa  47  0.0006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1255  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.17 
 
 		 319 aa  47  0.0007  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17970  predicted Fe-S oxidoreductase  26.17 
 
 		 356 aa  46.6  0.0008  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0729  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.45 
 
 		 380 aa  46.6  0.0008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.701014  normal  0.10573 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3615  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 		 465 aa  46.6  0.0008  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0909279  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2470  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.33 
 
 		 407 aa  46.6  0.0009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.616066 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2269  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.78 
 
 		 345 aa  45.8  0.001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6168  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.42 
 
 		 374 aa  45.8  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0169631  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1440  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.77 
 
 		 347 aa  46.2  0.001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.160949  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0071  Radical SAM domain protein  23.16 
 
 		 428 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2557  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.15 
 
 		 330 aa  46.2  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1789  radical SAM domain-containing protein  22.69 
 
 		 341 aa  46.2  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0081  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  23.08 
 
 		 373 aa  45.8  0.001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2955  Radical SAM domain protein  32.76 
 
 		 475 aa  46.2  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.807752  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0612  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.72 
 
 		 387 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.481896  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2192  glycyl-radical activating family protein  22.62 
 
 		 307 aa  45.8  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0969  radical SAM domain-containing protein  26.5 
 
 		 377 aa  45.8  0.001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00591663 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0857  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  32.23 
 
 		 378 aa  45.1  0.002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3249  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.42 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.384282  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2045  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 323 aa  45.1  0.002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.990495  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0688  metallo cofactor biosynthesis protein  27.36 
 
 		 390 aa  45.8  0.002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06670  heme d1 biosynthesis protein NirJ  26.72 
 
 		 387 aa  45.8  0.002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.196876  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5119  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.42 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.830153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1498  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  26.45 
 
 		 326 aa  45.4  0.002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.286832  normal  0.0117341 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2588  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  30.5 
 
 		 414 aa  45.4  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0973479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0672  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.49 
 
 		 332 aa  45.8  0.002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2248  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 		 332 aa  45.4  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.0000000187282  normal  0.0755271 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2492  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.87 
 
 		 400 aa  45.1  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.250234  normal  0.0827229 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5965  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  28.23 
 
 		 387 aa  45.1  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0233125 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0621  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.61 
 
 		 327 aa  45.4  0.002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.239747  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5162  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.42 
 
 		 379 aa  45.1  0.002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.426022 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0379  anaerobic ribonucleoside-triphosphate reductase activating protein  28.23 
 
 		 239 aa  45.1  0.002  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.346145  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5901  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  27.42 
 
 		 374 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.630073 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1449  pyrroloquinoline quinone biosynthesis protein PqqE  26.44 
 
 		 373 aa  44.7  0.003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0775464  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1760  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.08 
 
 		 323 aa  44.7  0.003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.7115  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0919  radical SAM domain-containing protein  27.81 
 
 		 338 aa  44.7  0.003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>