83 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2086 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2086  nitrilase/cyanide hydratase and apolipoprotein N-acyltransferase  100 
 
 
665 aa  1360    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  unclonable  0.0000285057  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15070  outer membrane copper receptor OprC  31.36 
 
 
723 aa  285  2.0000000000000002e-75  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0127729 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1325  TonB-dependent copper receptor  31.44 
 
 
719 aa  285  3.0000000000000004e-75  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1039  TonB-dependent copper receptor  32.16 
 
 
667 aa  284  4.0000000000000003e-75  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.377632 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0596  TonB-dependent copper receptor  30.75 
 
 
710 aa  280  9e-74  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.834175  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4838  TonB-dependent copper receptor  30.69 
 
 
688 aa  275  2.0000000000000002e-72  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.412488 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4075  TonB-dependent copper receptor  32.06 
 
 
725 aa  274  3e-72  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3668  TonB-dependent copper receptor  30.99 
 
 
686 aa  274  4.0000000000000004e-72  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.743452  normal  0.496513 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3427  TonB-dependent copper receptor  32.06 
 
 
698 aa  274  4.0000000000000004e-72  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.40271  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4894  TonB-dependent copper receptor  30.4 
 
 
688 aa  271  4e-71  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.386711  normal  0.630866 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4716  TonB-dependent copper receptor  30.26 
 
 
688 aa  270  5e-71  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.129936 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4630  TonB-dependent copper receptor  30.98 
 
 
688 aa  270  8e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.102852 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3408  TonB-dependent copper receptor  29.71 
 
 
668 aa  269  1e-70  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.233269  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0630  TonB-dependent receptor  31.3 
 
 
668 aa  265  2e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0622  TonB-dependent copper receptor  31.08 
 
 
668 aa  265  3e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3205  TonB-dependent copper receptor  30.65 
 
 
687 aa  264  4.999999999999999e-69  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.742642  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0999  nosA protein, putative  29.07 
 
 
676 aa  263  6.999999999999999e-69  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40090  outer membrane copper transport protein  29.12 
 
 
726 aa  263  1e-68  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0941  TonB-dependent copper receptor  28.91 
 
 
676 aa  260  5.0000000000000005e-68  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.591251  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4157  TonB-dependent copper receptor  31.04 
 
 
667 aa  246  8e-64  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0351  TonB-dependent copper receptor  29.88 
 
 
661 aa  244  5e-63  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3808  TonB-dependent copper receptor  30.28 
 
 
687 aa  243  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.494445  normal  0.660377 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1392  TonB-dependent copper receptor  29.57 
 
 
691 aa  243  7e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4452  TonB-dependent copper receptor  29.64 
 
 
710 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.876031  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3613  TonB-dependent copper receptor  29.64 
 
 
710 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3914  TonB-dependent copper receptor  29.64 
 
 
710 aa  243  7.999999999999999e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4607  TonB-dependent copper receptor  29.87 
 
 
724 aa  243  1e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0702651  normal  0.0726755 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0470  TonB-dependent copper receptor  30.47 
 
 
663 aa  242  1e-62  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2981  TonB-dependent copper receptor  29.83 
 
 
669 aa  243  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.724806  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2174  TonB-dependent copper receptor  30.34 
 
 
710 aa  241  2.9999999999999997e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.25751  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3292  TonB-dependent copper receptor  29.99 
 
 
709 aa  240  6.999999999999999e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.49865 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0638  TonB-dependent copper receptor  29.81 
 
 
753 aa  239  9e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3712  TonB-dependent copper receptor OprC  28.86 
 
 
686 aa  238  2e-61  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0452  TonB-dependent copper receptor  30.11 
 
 
662 aa  238  3e-61  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0239  TonB-dependent copper receptor  28.62 
 
 
681 aa  237  4e-61  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0477  TonB-dependent copper receptor  29.5 
 
 
745 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.157724  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1806  TonB-dependent copper receptor  29.5 
 
 
745 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0427  TonB-dependent copper receptor  29.5 
 
 
745 aa  238  4e-61  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0821  TonB-dependent copper receptor  29.5 
 
 
749 aa  237  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2368  TonB-dependent copper receptor  29.5 
 
 
749 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.468955  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2507  TonB-dependent copper receptor  29.5 
 
 
745 aa  236  7e-61  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4669  TonB-dependent copper receptor  29.54 
 
 
713 aa  234  3e-60  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0923349  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3953  TonB-dependent copper receptor OprC  28.55 
 
 
681 aa  234  3e-60  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1564  TonB-dependent receptor  25.31 
 
 
697 aa  159  1e-37  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.298375  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0677  TonB-dependent receptor  25.53 
 
 
672 aa  158  4e-37  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0620216  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2454  TonB-dependent copper receptor  36.82 
 
 
684 aa  154  4e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.119589  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3560  TonB-dependent copper receptor  24.26 
 
 
695 aa  146  1e-33  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3452  TonB-dependent receptor  22.91 
 
 
699 aa  115  2.0000000000000002e-24  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0377  TonB-dependent receptor  24.07 
 
 
661 aa  112  3e-23  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.337812  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1606  TonB-dependent receptor  24.24 
 
 
696 aa  103  1e-20  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.00000000000872297  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0484  TonB-dependent receptor  23.52 
 
 
702 aa  100  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.766292  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1476  TonB-dependent receptor  23.28 
 
 
668 aa  98.2  4e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0512  TonB-dependent receptor  23.68 
 
 
702 aa  96.3  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0165393  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0517  TonB-dependent receptor  23.24 
 
 
702 aa  89.4  2e-16  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.392314  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2293  TonB-dependent receptor  23.49 
 
 
685 aa  88.6  3e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0619  TonB-dependent receptor  22.3 
 
 
673 aa  84  0.000000000000008  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  unclonable  0.000000000412727  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2133  TonB-dependent receptor  20.99 
 
 
760 aa  76.3  0.000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.207681  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2982  TonB dependent receptor, putative  25.97 
 
 
699 aa  73.2  0.00000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0303  TonB-dependent receptor  23.71 
 
 
681 aa  72.4  0.00000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3630  TonB-dependent receptor  23.03 
 
 
713 aa  65.5  0.000000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0496  TonB-dependent receptor  23.47 
 
 
713 aa  61.6  0.00000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3454  TonB-dependent receptor  22.01 
 
 
713 aa  61.2  0.00000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4077  TonB-dependent receptor, putative  24.34 
 
 
708 aa  60.5  0.0000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0454  TonB-dependent outer membrane receptor for cobalamin and Fe transport  24.89 
 
 
646 aa  59.7  0.0000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000108252  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1499  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 
649 aa  58.5  0.0000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.378064  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0595  TonB-dependent receptor  22.53 
 
 
713 aa  58.5  0.0000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0539  TonB-dependent receptor  22.09 
 
 
708 aa  57.8  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0513  TonB-dependent receptor  21.74 
 
 
713 aa  55.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0508  TonB-dependent receptor  25 
 
 
764 aa  54.7  0.000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.786517  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2202  TonB-dependent receptor  23.72 
 
 
714 aa  54.3  0.000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.113523  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3804  TonB-dependent receptor  21.51 
 
 
713 aa  53.9  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4088  TonB-dependent receptor  22.72 
 
 
750 aa  52.8  0.00002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0621  hypothetical protein  38.67 
 
 
185 aa  51.6  0.00004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.495613 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0534  TonB-dependent receptor  21.14 
 
 
713 aa  51.2  0.00006  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0440  TonB-dependent receptor, putative  22.32 
 
 
775 aa  51.2  0.00006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0655  TonB-dependent receptor  25.26 
 
 
768 aa  50.4  0.0001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0123  TonB-dependent receptor  27.6 
 
 
719 aa  50.4  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.333478 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2027  TonB-dependent receptor  22.06 
 
 
769 aa  45.1  0.004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0554382  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2848  TonB-dependent receptor  20.36 
 
 
729 aa  44.7  0.005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2337  TonB-dependent receptor  25.6 
 
 
741 aa  44.7  0.005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3233  TonB-dependent receptor, putative  25.81 
 
 
701 aa  44.7  0.006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.88155  normal  0.66393 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2744  TonB-dependent receptor  28.43 
 
 
701 aa  44.3  0.008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0878  TonB-dependent receptor  28.21 
 
 
773 aa  43.9  0.01  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>