40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2073 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2073  orotate phosphoribosyltransferase (oprt) (oprtase)  100 
 
 
435 aa  861    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1378  putative C4-dicarboxylate transporter  61.89 
 
 
430 aa  517  1.0000000000000001e-145  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1244  C4-dicarboxylate ABC transporter permease  57.08 
 
 
430 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0747  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  46.76 
 
 
422 aa  350  2e-95  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3522  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  26.87 
 
 
455 aa  109  1e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00146557  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03087  predicted transporter  26.87 
 
 
455 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0562634  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03038  hypothetical protein  26.87 
 
 
455 aa  106  6e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0593549  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0479  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  26.87 
 
 
455 aa  106  6e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00235153  normal  0.454228 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0479  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  26.87 
 
 
455 aa  106  6e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000747268  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0857  C4-dicarboxylate transporter DcuC  25.56 
 
 
455 aa  103  5e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.510054  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1114  anaerobic C4-dicarboxylate transporter  24.79 
 
 
453 aa  103  5e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0607  C4-dicarboxylate transporter DcuC  26.01 
 
 
459 aa  103  6e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06095  C4-dicarboxylate transporter DcuC  25.17 
 
 
455 aa  100  4e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1207  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  27.51 
 
 
458 aa  100  5e-20  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000293  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuC  25.17 
 
 
455 aa  98.6  2e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.296544  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0673  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  24.78 
 
 
447 aa  96.7  7e-19  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0278  anaerobic C4-dicarboxylate transporter, putative  25.67 
 
 
479 aa  93.6  6e-18  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3709  putative cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD  26.64 
 
 
440 aa  93.6  7e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000109992  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1391  cryptic C4-dicarboxylate transporter DcuD, authentic frameshift  24.75 
 
 
479 aa  91.3  3e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902807  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1820  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  23.8 
 
 
471 aa  90.9  4e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1816  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter  25.26 
 
 
451 aa  90.1  7e-17  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  unclonable  0.0000000187232  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3039  C4-dicarboxylate transporter DcuC  27.13 
 
 
450 aa  80.5  0.00000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1579  C4-dicarboxylate transporter DcuC  26.94 
 
 
452 aa  79.7  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.704309  normal  0.946993 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1292  C4-dicarboxylate transporter DcuC  26.61 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0051  putative C4-dicarboxylate transporter  25.67 
 
 
457 aa  78.2  0.0000000000002  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.211631  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1194  anaerobic C4-dicarboxylate transporter DcuC  26.17 
 
 
454 aa  76.3  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1152  C4-dicarboxylate transporter DcuC  25.05 
 
 
457 aa  68.2  0.0000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0640  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.45 
 
 
461 aa  56.2  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.907894  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0644  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.2 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0173361  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00591  anaerobic C4-dicarboxylate transport  23.2 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00580  hypothetical protein  23.2 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3004  anaerobic c4-dicarboxylate antiporter, DcuC family  23.2 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0709  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.2 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00726308  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0668  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.75 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0313164  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0742  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.75 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.178111  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0682  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.75 
 
 
476 aa  55.1  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0536  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.2 
 
 
461 aa  55.1  0.000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0786  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.75 
 
 
476 aa  55.1  0.000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.026448  normal  0.816494 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0728  C4-dicarboxylate transporter DcuC  23.5 
 
 
476 aa  53.9  0.000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3023  C4-dicarboxylate transporter DcuC  22.54 
 
 
461 aa  54.3  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.780031  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>