43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2052 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2052  hydrolase  100 
 
 
412 aa  846    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1848  hypothetical protein  89.32 
 
 
411 aa  752    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0006  hydrolase  74.14 
 
 
406 aa  636    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1522  hypothetical protein  72.2 
 
 
408 aa  593  1e-168  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0015  hypothetical protein  71.57 
 
 
408 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.83051  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0042  hypothetical protein  71.57 
 
 
408 aa  586  1e-166  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.233125  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0015  hypothetical protein  71.32 
 
 
408 aa  584  1.0000000000000001e-165  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.2869  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0007  hydrolase  65.6 
 
 
405 aa  558  1e-158  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0891222  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0008  hypothetical protein  62.53 
 
 
403 aa  514  1e-144  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0396  HAD superfamily hydrolase  46.1 
 
 
396 aa  361  1e-98  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.917223 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2075  hydrolase (HAD superfamily)  42.16 
 
 
396 aa  338  9.999999999999999e-92  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.957527  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2605  hypothetical protein  38.05 
 
 
412 aa  261  2e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000329131  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0050  hypothetical protein  36.9 
 
 
416 aa  257  3e-67  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0968  hypothetical protein  35.28 
 
 
423 aa  254  2.0000000000000002e-66  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.309382 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0727  hypothetical protein  38.23 
 
 
413 aa  254  3e-66  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.190594  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1061  hypothetical protein  35.96 
 
 
413 aa  241  1e-62  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  unclonable  0.0000023277  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0736  hypothetical protein  36.36 
 
 
413 aa  241  2e-62  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000863321  normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1299  hypothetical protein  34.01 
 
 
398 aa  217  2.9999999999999998e-55  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.201423  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1594  hydrolase (HAD superfamily)  31.48 
 
 
396 aa  207  4e-52  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0590  metal dependent phosphohydrolase  24.22 
 
 
349 aa  79  0.0000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1938  metal dependent phosphohydrolase  23.9 
 
 
360 aa  78.2  0.0000000000003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000381363  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1074  metal dependent phosphohydrolase  35.29 
 
 
359 aa  55.1  0.000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2047  hypothetical protein  31.2 
 
 
195 aa  51.2  0.00003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00634487  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0827  hypothetical protein  27.03 
 
 
195 aa  48.9  0.0001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.315099  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004035  hypothetical protein  30 
 
 
206 aa  48.1  0.0002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01071  metal dependent phosphohydrolase  26.05 
 
 
199 aa  47.4  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2265  hypothetical protein  27.87 
 
 
195 aa  47  0.0006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.693233  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1913  hypothetical protein  30.65 
 
 
195 aa  47  0.0006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0121835  unclonable  0.00000201736 
 
 
-
 
NC_009140  SNSL254_pSN254_0131  putative 5'-nucleotidase  23.08 
 
 
201 aa  47  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0292  metal dependent phosphohydrolase  25.66 
 
 
205 aa  47  0.0007  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.496578  normal  0.28635 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0157  hypothetical protein  28.97 
 
 
201 aa  46.6  0.0008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0423  HD domain-containing protein  28.17 
 
 
213 aa  45.8  0.001  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2345  hypothetical protein  27.42 
 
 
195 aa  44.7  0.003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.267418  hitchhiker  0.000000795999 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01426  hypothetical protein  28.46 
 
 
215 aa  43.9  0.005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1906  hypothetical protein  29.84 
 
 
195 aa  43.5  0.006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.233056  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1994  hypothetical protein  29.84 
 
 
195 aa  43.5  0.006  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  decreased coverage  0.000000000122059  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2835  hypothetical protein  28.1 
 
 
199 aa  43.5  0.008  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0310374  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02216  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2440  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02176  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3430  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.583869  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2446  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.863522  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1361  hypothetical protein  28.21 
 
 
199 aa  42.7  0.01  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.516026 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>