33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_2030 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_2030  hypothetical protein  100 
 
 
74 aa  149  2e-35  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1908  hypothetical protein  55.41 
 
 
76 aa  86.3  1e-16  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00701296  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1729  hypothetical protein  36.99 
 
 
75 aa  60.8  0.000000005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0726991  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2905  hypothetical protein  39.19 
 
 
76 aa  57  0.0000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3029  hypothetical protein  31.94 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1521  hypothetical protein  30.56 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0911335 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1455  hypothetical protein  30.56 
 
 
94 aa  54.7  0.0000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2198  hypothetical protein  40.32 
 
 
86 aa  54.3  0.0000005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2410  hypothetical protein  31.88 
 
 
94 aa  54.3  0.0000006  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2707  hypothetical protein  33.85 
 
 
94 aa  53.9  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1657  hypothetical protein  33.85 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.681097  hitchhiker  0.000000408303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2808  hypothetical protein  33.85 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.198035 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2729  hypothetical protein  33.85 
 
 
94 aa  53.9  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00123009  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_2037  hypothetical protein  34.85 
 
 
77 aa  53.1  0.000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1511  hypothetical protein  31.88 
 
 
93 aa  52  0.000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.503038  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1026  hypothetical protein  32.81 
 
 
74 aa  50.4  0.000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0013  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  50.4  0.000008  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00237209 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0020  hypothetical protein  46.15 
 
 
84 aa  50.1  0.000009  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0108405  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2687  hypothetical protein  32.81 
 
 
74 aa  50.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.383276  normal  0.520608 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3643  hypothetical protein  34.33 
 
 
76 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0888  hypothetical protein  33.33 
 
 
96 aa  48.9  0.00002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0481059 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2422  hypothetical protein  32.31 
 
 
82 aa  48.5  0.00003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.615962  normal  0.0455353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1690  hypothetical protein  34.78 
 
 
100 aa  48.1  0.00004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0441835  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0028  hypothetical protein  38.18 
 
 
91 aa  47.4  0.00006  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.323512  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1755  hypothetical protein  29.58 
 
 
77 aa  47.4  0.00007  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.137723  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1237  hypothetical protein  30.3 
 
 
88 aa  46.6  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4371  hypothetical protein  30.65 
 
 
78 aa  44.7  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455488  normal  0.184222 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2864  hypothetical protein  25.76 
 
 
78 aa  44.3  0.0006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.0403984  hitchhiker  0.00610579 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0877  hypothetical protein  35.9 
 
 
74 aa  43.9  0.0008  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2854  hypothetical protein  32.84 
 
 
77 aa  40.8  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.162663  normal  0.214257 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0601  hypothetical protein  32.31 
 
 
91 aa  40.4  0.008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.208487  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2685  hypothetical protein  31.94 
 
 
75 aa  40.4  0.008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5567  hypothetical protein  27.27 
 
 
73 aa  40  0.01  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0503052 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>