More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1964 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009802  CCC13826_1231  L(+)-tartrate dehydratase subunit beta (L-TTD beta)  81.13 
 
 
583 aa  992  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1010  type II secretion system protein E  72.24 
 
 
598 aa  822  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1964  general secretion pathway protein E  100 
 
 
583 aa  1193  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1052  general secretion pathway protein E (Type II traffic warden ATPase)(cholera toxin secretion protein EpsE)  65.12 
 
 
585 aa  803  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1039  type II secretion system protein E  66.61 
 
 
583 aa  777  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1387  type II secretion system protein E  57.34 
 
 
577 aa  605  1e-171  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00517077  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0873  general secretory pathway protein E  44.44 
 
 
871 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1322  type II secretion system protein E  40.69 
 
 
553 aa  431  1e-119  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.0787535 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1107  type II secretion system protein E  40.07 
 
 
787 aa  417  1e-115  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1128  type II secretion system protein E  38.79 
 
 
563 aa  408  1e-112  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1822  type II secretion system protein E  41.88 
 
 
557 aa  406  1e-112  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0186286  normal  0.89431 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1554  type II secretion system protein E  37.96 
 
 
553 aa  406  1e-112  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.185461 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1347  type II secretion system protein E  40.58 
 
 
556 aa  404  1e-111  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17740  type II secretion system protein E (GspE)  39.39 
 
 
557 aa  397  1e-109  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.898246 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0991  type II secretion system protein E  37.26 
 
 
564 aa  397  1e-109  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1166  type II secretion system protein E  39.96 
 
 
572 aa  392  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4189  type II secretion system protein E  39.12 
 
 
557 aa  392  1e-108  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0956  type II secretion system protein E  41.16 
 
 
561 aa  393  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0682  general secretory pathway protein E  42.97 
 
 
520 aa  394  1e-108  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.980899  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3257  type II secretion system protein E  40.99 
 
 
561 aa  389  1e-107  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1034  type II secretion system protein E  39.8 
 
 
558 aa  392  1e-107  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2648  type II secretion system protein E  46.06 
 
 
579 aa  390  1e-107  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0969268  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0408  type II secretion system protein E  37.99 
 
 
570 aa  390  1e-107  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1504  type II secretion system protein E  39.02 
 
 
558 aa  389  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1725  general secretory pathway protein E  38.46 
 
 
553 aa  388  1e-106  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0968  type II secretion system protein E  36.93 
 
 
561 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.197479  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1451  type II secretion system protein E  37.87 
 
 
574 aa  385  1e-105  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0608  general secretory pathway protein E  42.69 
 
 
520 aa  384  1e-105  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  6.11826e-14 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05970  Tfp pilus assembly protein PilB  38.22 
 
 
558 aa  383  1e-105  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0594  general secretory pathway protein E  42.69 
 
 
520 aa  384  1e-105  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0328  general secretion pathway protein E  43.55 
 
 
514 aa  385  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3765  type II secretion system protein E  38.37 
 
 
577 aa  383  1e-105  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.238087  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1884  type II secretion system protein E  38.5 
 
 
570 aa  382  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  6.26903e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0138  type II secretion system protein E  37.37 
 
 
569 aa  383  1e-105  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2414  type II secretion system protein E  38.03 
 
 
564 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2895  type II secretion system protein E  42.47 
 
 
580 aa  382  1e-105  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.847539  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4414  type II secretion system protein E  37.57 
 
 
585 aa  381  1e-104  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0327101  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1818  general secretory pathway protein E  40.27 
 
 
519 aa  380  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0426  type II secretion system protein E  40.62 
 
 
577 aa  379  1e-104  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0285266  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3365  type II secretion system protein E  43.13 
 
 
520 aa  382  1e-104  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.219755  normal  0.0138681 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1464  general secretory pathway protein E  39.77 
 
 
519 aa  381  1e-104  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1644  general secretory pathway protein E  40.47 
 
 
519 aa  379  1e-104  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.161212  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1280  general secretory pathway protein E  40.62 
 
 
521 aa  382  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3555  type II secretion system protein E  36.73 
 
 
573 aa  376  1e-103  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.422315  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0547  type II secretion system protein E  37.79 
 
 
584 aa  379  1e-103  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1042  general secretory pathway protein E  42.31 
 
 
570 aa  378  1e-103  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.90473  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0888  type II secretion system protein E  40.43 
 
 
553 aa  378  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29490  putative type II secretion protein  36.57 
 
 
575 aa  376  1e-103  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3660  type II secretion system protein E  41.49 
 
 
586 aa  375  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0508  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
586 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.344725  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1299  general secretory pathway protein E  45.24 
 
 
575 aa  376  1e-103  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.0445374 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1527  type II secretion system protein E  44.11 
 
 
482 aa  379  1e-103  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.155656  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0392  type II secretion system protein E  38.23 
 
 
586 aa  375  1e-103  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0487  type II secretion system protein E  40.67 
 
 
586 aa  378  1e-103  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0511  type II secretion system protein E  40.48 
 
 
586 aa  377  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0388  MshA biogenesis protein MshE  37.95 
 
 
594 aa  378  1e-103  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000356112  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2744  type II secretion system protein E  40.7 
 
 
527 aa  377  1e-103  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.804654  normal  0.322952 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2570  secretion system protein E  38.1 
 
 
562 aa  377  1e-103  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_16170  type II secretion system protein E, GspE  41.9 
 
 
569 aa  376  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1792  type II secretion system protein E  39.14 
 
 
573 aa  373  1e-102  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.608065 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0326  type II secretion system protein E  38.2 
 
 
612 aa  374  1e-102  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.038954  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0042  type II secretion system protein E  33.69 
 
 
568 aa  374  1e-102  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0756  type II secretion system protein E  35.84 
 
 
589 aa  374  1e-102  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0457  MSHA biogenesis protein MshE  37.01 
 
 
587 aa  374  1e-102  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1924  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
576 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00254  putative Mannose-sensitive agglutinin (MSHA) biogenesis protein MshE (pilus type IV)  38.04 
 
 
570 aa  373  1e-102  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0563  type II secretion system protein E  37.79 
 
 
586 aa  372  1e-102  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3832  type II secretion system protein E  40.08 
 
 
586 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0461846  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2103  type II secretion system protein E  39.4 
 
 
571 aa  372  1e-102  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1392  type II secretion system protein E  37.16 
 
 
571 aa  373  1e-102  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.025124 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0949  type II secretion system protein E  36.49 
 
 
885 aa  370  1e-101  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.14742  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0469  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
586 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4500  putative general secretion pathway protein E  41.33 
 
 
522 aa  370  1e-101  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.155561 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3748  type II secretion system protein E  37.08 
 
 
586 aa  370  1e-101  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.307926  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0362  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  36.86 
 
 
569 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal  0.388372 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1585  type II secretion system protein E  38.97 
 
 
552 aa  372  1e-101  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.834386 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1408  type II secretion system protein E  36.17 
 
 
577 aa  370  1e-101  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.22381  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3483  type II secretion system protein E  41.29 
 
 
586 aa  371  1e-101  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3937  general secretory pathway protein E  41.54 
 
 
495 aa  370  1e-101  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.279584 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4109  MSHA biogenesis protein MshE  41.49 
 
 
586 aa  369  1e-101  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1055  type II secretion system protein E  44.05 
 
 
559 aa  372  1e-101  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0268645  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0183  type IV pilus assembly protein  36.86 
 
 
569 aa  372  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3344  type II secretion system protein E  41.04 
 
 
586 aa  369  1e-101  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0160309  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0719  general secretory pathway protein E  39.65 
 
 
599 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3666  type II secretion system protein E  36.72 
 
 
566 aa  368  1e-100  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4828  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  37.61 
 
 
563 aa  368  1e-100  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.436741 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1684  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  39.85 
 
 
577 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.0417932  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0729  general secretory pathway protein E  39.96 
 
 
603 aa  369  1e-100  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.26973  normal  0.525639 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4824  putative type II secretion system protein  45.83 
 
 
469 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0112939  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2149  type II secretory pathway, ATPase PulE/Tfp pilus assembly pathway, ATPase PilB  40.54 
 
 
566 aa  367  1e-100  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.365322  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55440  putative type II secretion system protein  46.09 
 
 
469 aa  367  1e-100  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000766086  normal  0.021503 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2272  secretion system protein E  37.87 
 
 
563 aa  365  1e-100  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2089  general secretory pathway protein E  37.21 
 
 
559 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.86871  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1491  type IV pilus biogenesis protein PilB  36.36 
 
 
568 aa  365  1e-100  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.10563  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0173  type II secretion system protein E  36.41 
 
 
637 aa  366  1e-100  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1526  type II secretion system protein E  41.09 
 
 
567 aa  367  1e-100  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.30964 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0720  general secretory pathway protein E  39.65 
 
 
599 aa  367  1e-100  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2562  type II secretion system protein E  39.29 
 
 
555 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1114  general secretion pathway protein E  40.81 
 
 
585 aa  368  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2682  type IV-A pilus assembly ATPase PilB  39.61 
 
 
568 aa  367  1e-100  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>