119 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1951 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1951  hypothetical protein  100 
 
 		 425 aa  863    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00148546  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0145  TPR repeat-containing protein  66.59 
 
 		 420 aa  591  1e-168  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.116417  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1322  TPR repeat-containing protein  42.09 
 
 		 413 aa  304  2.0000000000000002e-81  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0639  hypothetical protein  41.29 
 
 		 386 aa  300  4e-80  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.34085  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1307  hypothetical protein  37.27 
 
 		 421 aa  265  8e-70  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.181406  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0925  conserved hypothetical protein, putative ATP-dependent nuclease  31.98 
 
 		 411 aa  200  5e-50  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0730  TPR repeat-containing protein  30.43 
 
 		 427 aa  196  5.000000000000001e-49  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.115236  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0605  putative lipoprotein  31.92 
 
 		 425 aa  190  4e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.392037  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0518  putative lipoprotein  33.25 
 
 		 412 aa  189  1e-46  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1437  putative lipoprotein  32.99 
 
 		 424 aa  184  3e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0336  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  42.05 
 
 		 557 aa  67.8  0.0000000004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000572448  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0511  TPR repeat-containing protein  21.87 
 
 		 581 aa  62.8  0.00000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0074  TPR repeat-containing protein  24.04 
 
 		 567 aa  62.4  0.00000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00635622 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0345  TPR repeat-containing protein  23.27 
 
 		 616 aa  60.5  0.00000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.856106  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0712  tetratricopeptide TPR_2  40 
 
 		 677 aa  60.5  0.00000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1550  TPR repeat-containing protein  32.52 
 
 		 562 aa  58.9  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.119519  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2347  hypothetical protein  33 
 
 		 583 aa  57.4  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.396725  normal  0.172568 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1034  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.15 
 
 		 548 aa  57.4  0.0000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3694  TPR repeat-containing protein  30.83 
 
 		 638 aa  56.2  0.000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.663272  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0016  TPR repeat-containing protein  36.36 
 
 		 229 aa  56.2  0.000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0964608  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0478  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.7 
 
 		 599 aa  56.2  0.000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0259982 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3727  TPR repeat-containing protein  22.93 
 
 		 572 aa  55.1  0.000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.239991 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0942  hypothetical protein  37.7 
 
 		 619 aa  55.5  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0457  TPR repeat-containing protein  30.88 
 
 		 607 aa  55.5  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.559359 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0588  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  35.23 
 
 		 571 aa  55.1  0.000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.795395  normal  0.0835537 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1861  TPR repeat-containing protein  23.8 
 
 		 565 aa  55.1  0.000003  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.244613  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1085  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 592 aa  54.3  0.000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0681  tetratricopeptide TPR_2  22.54 
 
 		 562 aa  53.9  0.000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2475  peptidoglycan-binding LysM  27 
 
 		 632 aa  53.5  0.000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00625277  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4603  TPR repeat-containing protein  32 
 
 		 722 aa  53.1  0.000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.524488 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2472  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 566 aa  53.1  0.000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1107  TPR domain protein  31.58 
 
 		 575 aa  52.8  0.00001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1778  TPR domain-containing protein  36.59 
 
 		 425 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.128909  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1212  tetratricopeptide TPR_2  32 
 
 		 592 aa  52.8  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0425  TPR repeat-containing protein  36.59 
 
 		 566 aa  52.8  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1657  tetratricopeptide TPR_4  27.97 
 
 		 587 aa  52.4  0.00002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1382  TPR repeat-containing protein  24.64 
 
 		 579 aa  52.4  0.00002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.18968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1230  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.59 
 
 		 594 aa  52  0.00002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0725  TPR domain-containing protein  28.79 
 
 		 573 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.883173  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0947  TPR repeat-containing protein  31.58 
 
 		 556 aa  51.2  0.00003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0384  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 592 aa  50.8  0.00004  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.315529  normal  0.0233306 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0253  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.73 
 
 		 645 aa  50.4  0.00005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0424  TPR repeat-containing protein  37.31 
 
 		 642 aa  50.4  0.00006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0759  TPR repeat-containing protein  28.79 
 
 		 573 aa  50.4  0.00007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.449417  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4750  hypothetical protein  31.03 
 
 		 574 aa  50.1  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.447535  normal  0.153995 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4357  tetratricopeptide TPR_2  34.21 
 
 		 593 aa  49.3  0.0001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0312227  normal  0.0147446 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0292  hypothetical protein  22.32 
 
 		 635 aa  49.7  0.0001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2594  TPR repeat-containing protein  35 
 
 		 617 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.390942 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2117  TPR repeat-containing protein  41.27 
 
 		 566 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.000306715  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0264  TPR repeat-containing protein  33.82 
 
 		 599 aa  48.5  0.0002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.907544  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41490  hypothetical protein  26.54 
 
 		 520 aa  48.5  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.510625  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3217  tetratricopeptide TPR_2  35 
 
 		 593 aa  48.9  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.7268  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0382  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 576 aa  48.9  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0280  Tetratricopeptide domain protein  22.49 
 
 		 645 aa  48.5  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5430  tetratricopeptide TPR_4  30.91 
 
 		 595 aa  48.5  0.0002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4458  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 573 aa  48.5  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2297  TPR domain-containing protein  34.15 
 
 		 226 aa  48.1  0.0003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0398  hypothetical protein  21.7 
 
 		 642 aa  48.1  0.0003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000413464  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0566  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 610 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0522  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  33.33 
 
 		 610 aa  48.1  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.133163  normal  0.433558 
 
 
-
 
NC_004310  BR0402  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  47.8  0.0004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1444  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.17 
 
 		 581 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0231382  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1165  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  34.18 
 
 		 574 aa  47.4  0.0004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.96712  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0856  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  22.94 
 
 		 563 aa  47.8  0.0004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.000292509  normal  0.491449 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0411  TPR domain-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  47.8  0.0004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0673088  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0769  TPR repeat-containing protein  29.13 
 
 		 573 aa  47.4  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1117  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 585 aa  47  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.573354 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0689  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 632 aa  47  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000734837  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1058  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 575 aa  47  0.0007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.364915  normal  0.506531 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3495  tetratricopeptide TPR_4  35.59 
 
 		 620 aa  47  0.0007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000742446 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0318  TPR repeat-containing protein  38.33 
 
 		 613 aa  46.6  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0135252  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1186  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  28.4 
 
 		 612 aa  46.6  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0586  hypothetical protein  27.45 
 
 		 573 aa  46.6  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1527  tetratricopeptide TPR_4  29.63 
 
 		 619 aa  46.2  0.001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.80343  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0902  tetratricopeptide domain-containing protein  27.45 
 
 		 625 aa  45.8  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.285036  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0720  TPR repeat-containing protein  25.23 
 
 		 595 aa  46.2  0.001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.537549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2168  TPR repeat-containing protein  34.85 
 
 		 573 aa  45.8  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.28547  normal  0.066147 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2210  hypothetical protein  26.53 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0162146  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2121  TPR repeat-containing protein  26.53 
 
 		 559 aa  46.6  0.001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  decreased coverage  0.0000963892  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  27.91 
 
 		 573 aa  45.4  0.002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2859  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.504005  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3232  hypothetical protein  29.36 
 
 		 609 aa  45.8  0.002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0129967  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1918  outer membrane lipoprotein LolB  30.3 
 
 		 494 aa  45.1  0.002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0520  TPR repeat-containing protein  33.33 
 
 		 621 aa  45.4  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2717  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 607 aa  45.8  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0254637  normal  0.13639 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0857  TPR repeat-containing protein  26.09 
 
 		 572 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.6877  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2098  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  32.43 
 
 		 566 aa  45.1  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000120088  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4074  TPR repeat-containing protein  32.89 
 
 		 622 aa  45.1  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2645  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.1 
 
 		 572 aa  45.1  0.003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000110346  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0485  tetratricopeptide TPR_2  34.43 
 
 		 566 aa  44.3  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4342  Tetratricopeptide domain protein  28.35 
 
 		 616 aa  44.3  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.118826  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0516  TPR repeat-containing protein  32.84 
 
 		 607 aa  44.3  0.004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.199101  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1053  TPR domain-containing protein  22.42 
 
 		 586 aa  43.9  0.005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.038306  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3607  TPR repeat-containing protein  32.43 
 
 		 584 aa  43.9  0.005  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.277474 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4380  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  31.58 
 
 		 619 aa  43.9  0.005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.842579  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2762  TPR domain protein  36.21 
 
 		 603 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2382  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  36.21 
 
 		 553 aa  43.9  0.005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.407653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2799  TPR repeat-containing protein  31.34 
 
 		 607 aa  43.9  0.006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.414914  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2656  TPR repeat-containing protein  31.25 
 
 		 568 aa  43.9  0.006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000162187  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2362  TPR repeat-containing protein  27.27 
 
 		 585 aa  43.9  0.006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>