More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1803 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1803  ribosome-binding factor A  100 
 
 		 656 aa  1343    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3929  enterobactin receptor protein  35.43 
 
 		 663 aa  381  1e-104  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  0.881798 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4523  enterobactin receptor protein  35.43 
 
 		 663 aa  376  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0219  enterobactin receptor protein  34.97 
 
 		 666 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0246836  normal  0.0975103 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4120  enterobactin receptor protein  34.82 
 
 		 666 aa  375  1e-102  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00000897059  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4241  enterobactin receptor protein  35.03 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0112255  hitchhiker  0.000515179 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0217  enterobactin receptor protein  34.82 
 
 		 666 aa  374  1e-102  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000171736  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3503  enterobactin receptor protein  34.51 
 
 		 666 aa  371  1e-101  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.00217636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3220  putative outer membrane receptor  34.78 
 
 		 665 aa  366  1e-100  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00190191 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0934  putative outer membrane receptor  33.02 
 
 		 655 aa  365  2e-99  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2666  putative outer membrane receptor  34.32 
 
 		 665 aa  364  3e-99  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1541  putative outer membrane receptor  34.32 
 
 		 665 aa  364  3e-99  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2748  putative outer membrane receptor  34.32 
 
 		 665 aa  364  4e-99  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3294  TonB-dependent receptor, plug  35.22 
 
 		 676 aa  360  6e-98  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1811  diaminopimelate epimerase (DAP epimerase)  52.68 
 
 		 330 aa  351  3e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2046  TonB-dependent receptor  33.84 
 
 		 713 aa  345  2e-93  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00183904 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3795  TonB-dependent receptor  33.88 
 
 		 740 aa  336  1e-90  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.837422  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2678  enterobactin receptor protein  32.39 
 
 		 653 aa  335  2e-90  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3815  TonB-dependent receptor  33.54 
 
 		 658 aa  328  2.0000000000000001e-88  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009431  Rsph17025_4281  hypothetical protein  32.65 
 
 		 700 aa  323  5e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3962  TonB-dependent receptor  33.28 
 
 		 698 aa  321  1.9999999999999998e-86  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1628  TonB-dependent receptor, plug  33.92 
 
 		 680 aa  320  6e-86  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.58484 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1099  TonB-dependent receptor  31.58 
 
 		 664 aa  317  4e-85  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002470  TonB-dependent receptor  30.87 
 
 		 652 aa  312  1e-83  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.337593  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3494  TonB-dependent receptor  31.33 
 
 		 715 aa  310  6.999999999999999e-83  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0028  enterobactin receptor protein  31.33 
 
 		 652 aa  308  2.0000000000000002e-82  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000507235  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0806  TonB-dependent receptor  31.36 
 
 		 743 aa  298  2e-79  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0847  ferric receptor CfrA  32.01 
 
 		 696 aa  298  3e-79  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1631  TonB-dependent receptor, plug  30.6 
 
 		 739 aa  298  3e-79  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.371565 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0784  TonB-dependent siderophore receptor, putative  31.75 
 
 		 656 aa  297  4e-79  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1261  ferric receptor CfrA  31.49 
 
 		 702 aa  293  8e-78  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0469  iron-regulated outer membrane virulence protein, TonB receptor CfrA  30.91 
 
 		 698 aa  288  2e-76  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.442515  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1659  TonB-dependent receptor  30.23 
 
 		 714 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000365717  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01120  iron-regulated outer membrane virulence protein  32.41 
 
 		 572 aa  279  1e-73  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0899  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.72 
 
 		 696 aa  275  2.0000000000000002e-72  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1357  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.72 
 
 		 696 aa  275  2.0000000000000002e-72  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0456407  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1930  TonB-dependent receptor  29.43 
 
 		 702 aa  273  6e-72  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3276  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 698 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0938  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 698 aa  272  2e-71  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00410623  normal  0.440689 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3409  TonB-dependent receptor  28.53 
 
 		 698 aa  272  2e-71  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.19526  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1691  TonB-dependent receptor, plug  31.46 
 
 		 732 aa  270  5e-71  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.524758  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4161  TonB-dependent receptor  30.15 
 
 		 799 aa  269  1e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3128  bifunctional enterobactin receptor/adhesin protein  29.83 
 
 		 695 aa  268  2e-70  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4368  TonB-dependent receptor  29.7 
 
 		 799 aa  268  2e-70  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4233  TonB-dependent receptor  30 
 
 		 799 aa  267  5e-70  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5052  TonB-dependent receptor  29.64 
 
 		 726 aa  266  5.999999999999999e-70  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0923716  normal  0.422268 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1648  ferric receptor CfrA  29.9 
 
 		 696 aa  262  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.1522  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1493  putative TonB-dependent receptor  30.4 
 
 		 697 aa  259  9e-68  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.404893  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2434  colicin I receptor  30.35 
 
 		 650 aa  259  1e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.198809 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2390  colicin I receptor  30.2 
 
 		 650 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.107934 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2756  colicin I receptor  28.55 
 
 		 656 aa  258  3e-67  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.35711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2345  colicin I receptor  30.2 
 
 		 650 aa  258  3e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0748809  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2548  colicin I receptor  30.2 
 
 		 650 aa  257  5e-67  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00911927 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0471  TonB-dependent receptor, putative, degenerate  30.47 
 
 		 704 aa  256  8e-67  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2438  colicin I receptor  30 
 
 		 650 aa  256  1.0000000000000001e-66  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.593043  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1503  TonB-dependent receptor plug  29.8 
 
 		 663 aa  251  4e-65  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000115095  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1493  colicin I receptor  29.8 
 
 		 663 aa  251  4e-65  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.351325 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2289  colicin I receptor  29.8 
 
 		 663 aa  251  4e-65  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2302  colicin I receptor  29.58 
 
 		 641 aa  249  8e-65  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.010442 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02084  ferric iron-catecholate outer membrane transporter  29.65 
 
 		 663 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.184448  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3290  colicin I receptor  29.8 
 
 		 659 aa  249  9e-65  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.359827  normal  0.810258 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02043  hypothetical protein  29.65 
 
 		 663 aa  249  9e-65  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.214275  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2451  colicin I receptor  29.58 
 
 		 663 aa  249  2e-64  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01404  hypothetical protein  29.91 
 
 		 640 aa  228  2e-58  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3738  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 665 aa  221  3.9999999999999997e-56  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.430842  normal  0.0543439 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3364  putative TonB-dependent receptor  28.62 
 
 		 635 aa  221  3.9999999999999997e-56  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.346597  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39650  putative TonB-dependent receptor  27.96 
 
 		 653 aa  219  1e-55  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1513  TonB-dependent receptor  27.71 
 
 		 649 aa  212  2e-53  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000309269  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3535  TonB-dependent receptor  26.38 
 
 		 681 aa  200  7.999999999999999e-50  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.243459  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0558  TonB-dependent receptor  26.6 
 
 		 657 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0460  TonB-dependent receptor  27.23 
 
 		 648 aa  185  2.0000000000000003e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1806  TonB-dependent receptor  26.99 
 
 		 649 aa  175  2.9999999999999996e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0624  outer membrane receptor FepA  24.9 
 
 		 751 aa  171  4e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1977  sulfate/thiosulfate import ATP-binding protein CysA 2 (Sulfate-transporting ATPase 2)  40.52 
 
 		 326 aa  171  5e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3964  outer membrane receptor FepA  26.01 
 
 		 746 aa  170  7e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.364367  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1826  TonB-dependent receptor  27.41 
 
 		 661 aa  170  8e-41  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0922924  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0743  outer membrane receptor FepA  24.62 
 
 		 751 aa  170  9e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.100086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0852  TonB-dependent outer membrane receptor for Fe3+/colicin I  27.36 
 
 		 633 aa  170  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000258389  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0681  outer membrane receptor FepA  24.62 
 
 		 751 aa  169  1e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.757968  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0697  outer membrane receptor FepA  24.76 
 
 		 751 aa  169  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0638  outer membrane receptor FepA  24.48 
 
 		 751 aa  168  2e-40  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2242  outer membrane receptor FepA  26.75 
 
 		 744 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.620188 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3496  outer membrane receptor FepA  26.47 
 
 		 744 aa  167  4e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2171  TonB-dependent receptor  26.66 
 
 		 649 aa  167  4e-40  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0680  outer membrane receptor FepA  25.76 
 
 		 783 aa  167  8e-40  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0125648  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29350  outer membrane receptor FepA  25.96 
 
 		 746 aa  166  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.93217  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1485  outer membrane receptor FepA  26.82 
 
 		 777 aa  165  2.0000000000000002e-39  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0839984  normal  0.152216 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2412  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 662 aa  165  3e-39  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.115111  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1861  TonB-dependent receptor  26.24 
 
 		 653 aa  165  3e-39  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0473101  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2423  TonB-dependent receptor  26.74 
 
 		 662 aa  164  4.0000000000000004e-39  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.075703  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2531  TonB-dependent receptor  26.42 
 
 		 680 aa  164  5.0000000000000005e-39  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.276329 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1716  outer membrane receptor FepA  26.6 
 
 		 746 aa  163  7e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1935  TonB-dependent receptor  26.26 
 
 		 662 aa  162  1e-38  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.00717608  normal  0.914131 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1870  outer membrane receptor FepA  26.75 
 
 		 744 aa  163  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37020  outer membrane receptor FepA  26.48 
 
 		 746 aa  162  1e-38  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.145193  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3430  outer membrane receptor FepA  25.33 
 
 		 759 aa  158  2e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00101807 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0485  outer membrane receptor FepA  25.42 
 
 		 746 aa  158  4e-37  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0603  outer membrane receptor FepA  25.14 
 
 		 746 aa  157  7e-37  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3061  outer membrane receptor FepA  25 
 
 		 746 aa  156  1e-36  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.00912473  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37010  outer membrane receptor FepA  26.05 
 
 		 757 aa  156  1e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0110447  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>