107 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1779 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1779  LysR family transcriptional regulator  100 
 
 
95 aa  194  4.0000000000000005e-49  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.027196  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0212  CBS domain-containing protein  71.58 
 
 
247 aa  144  5e-34  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2059  regulatory protein LysR  61.63 
 
 
245 aa  115  1.9999999999999998e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000246336  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1499  molybdate transport repressor  54.44 
 
 
233 aa  104  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.890291  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1859  molybdate transport repressor  54.44 
 
 
233 aa  104  3e-22  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1680  molybdate transport repressor  54.44 
 
 
245 aa  104  4e-22  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0360  putative transcriptional regulator, ModE family  50 
 
 
242 aa  100  9e-21  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0023  ModE family transcriptional regulator  42.35 
 
 
135 aa  62.4  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3521  Fis family transcriptional regulator  36.47 
 
 
125 aa  61.2  0.000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0330  putative transcriptional regulator, ModE family  37.93 
 
 
116 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000000263512  normal  0.179413 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1572  ModE family transcriptional regulator  34.07 
 
 
123 aa  58.2  0.00000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.113677  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0460  ModE family transcriptional regulator  34.52 
 
 
127 aa  57.8  0.00000006  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000661787  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4071  putative transcriptional regulator, ModE family  35.71 
 
 
115 aa  57.4  0.00000006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1100  ModE family transcriptional regulator  35.35 
 
 
145 aa  57.4  0.00000007  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.87335  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1701  ModE family transcriptional regulator  32.18 
 
 
125 aa  56.6  0.0000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.540153  normal  0.344174 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0054  ModE family transcriptional regulator  39.19 
 
 
138 aa  54.7  0.0000004  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0286693 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4205  putative transcriptional regulator, ModE family  28.77 
 
 
125 aa  54.7  0.0000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.590179  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0940  transcriptional regulator, ModE family  34.21 
 
 
263 aa  54.3  0.0000006  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.000000762676  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0057  ModE family transcriptional regulator  36.49 
 
 
137 aa  52.8  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3409  ModE family transcriptional regulator  29.79 
 
 
116 aa  51.6  0.000003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0426925  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5342  putative transcriptional regulator, ModE family  40.58 
 
 
114 aa  52  0.000003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2172  putative transcriptional regulator, ModE family  32.94 
 
 
131 aa  51.6  0.000003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.890438 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2293  ModE family transcriptional regulator  30 
 
 
115 aa  51.2  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.11585  normal  0.260705 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3881  putative transcriptional regulator, ModE family  28 
 
 
119 aa  50.8  0.000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.180792  normal  0.0155271 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0962  molybdate transport repressor  31.43 
 
 
263 aa  50.8  0.000006  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0066  ModE family transcriptional regulator  29.41 
 
 
108 aa  50.4  0.000008  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.0000184024  normal  0.128771 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0856  ModE family transcriptional regulator  31.43 
 
 
263 aa  50.4  0.000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2041  putative transcriptional regulator, ModE family  31.65 
 
 
118 aa  50.4  0.000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1086  NUDIX hydrolase  30.99 
 
 
236 aa  49.7  0.00001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.702437  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4419  ModE family transcriptional regulator  30.59 
 
 
125 aa  49.7  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.675399  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3706  putative transcriptional regulator, ModE family  27.38 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0482  putative transcriptional regulator, ModE family  33.33 
 
 
128 aa  49.7  0.00001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000243706  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5199  transcriptional regulator, ModE family  30.14 
 
 
263 aa  49.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5511  putative transcriptional regulator, ModE family  27.38 
 
 
114 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0934  LysR family transcriptional regulator  28.26 
 
 
134 aa  49.3  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.102124  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6143  putative transcriptional regulator, ModE family  30.26 
 
 
114 aa  49.3  0.00002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.144159  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3515  ModE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
112 aa  48.9  0.00002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000445767  normal  0.258614 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2877  ModE family transcriptional regulator  27.16 
 
 
125 aa  49.3  0.00002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.795322  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6170  ModE family transcriptional regulator  30.99 
 
 
141 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.350331  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0533  putative transcriptional regulator, ModE family  32.95 
 
 
118 aa  48.5  0.00003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2664  ModE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
118 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.554277  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0705  ModE family transcriptional regulator  28.77 
 
 
263 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.190808 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01590  molybdenum-binding protein  34.57 
 
 
114 aa  47.8  0.00005  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.55567  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0555  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.601772  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1034  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0993  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  47.4  0.00006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0233787  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2794  ModE family transcriptional regulator  33.77 
 
 
107 aa  47.4  0.00007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2247  transcriptional regulator, ModE family  28.21 
 
 
266 aa  47.4  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1405  putative transcriptional regulator, ModE family  27.5 
 
 
126 aa  47  0.00008  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.518534  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0976  ModE family transcriptional regulator  31.82 
 
 
270 aa  47  0.00008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0983  putative transcriptional regulator, ModE family  31.76 
 
 
134 aa  47.4  0.00008  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1731  ModE family transcriptional regulator  27.17 
 
 
268 aa  47  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000816631  normal  0.0463603 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2363  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  47  0.00009  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4147  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  46.2  0.0001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.70321  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0898  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1450  molybdenum-binding protein  29.76 
 
 
111 aa  46.2  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2824  ModE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
152 aa  46.6  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.812847 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2203  molybdenum-pterin binding domain-containing protein  34.85 
 
 
260 aa  46.2  0.0001  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0910  molybdate metabolism transcriptional regulator  34.33 
 
 
368 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.527444  normal  0.0178578 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2202  putative transcriptional regulator, ModE family  30.14 
 
 
111 aa  46.6  0.0001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2731  ModE family transcriptional regulator  30.14 
 
 
266 aa  45.8  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.134416 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4319  ModE family transcriptional regulator  28.26 
 
 
129 aa  45.1  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0494502  normal  0.0757875 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2496  ModE family transcriptional regulator  35.71 
 
 
115 aa  45.1  0.0003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1642  LysR family transcriptional regulator  25.26 
 
 
128 aa  44.3  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.986241 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3225  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3754  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
279 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.305631  normal  0.20307 
 
 
-
 
NC_009007  RSP_3874  transcriptional repressor, ModE  27.14 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0735734  n/a   
 
 
-
 
NC_009040  Rsph17029_4166  ModE family transcriptional regulator  27.14 
 
 
262 aa  43.9  0.0007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00104797  normal  0.104434 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2239  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
278 aa  43.9  0.0008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.814022  normal  0.101345 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4507  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
281 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3857  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
281 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.12009  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3670  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
278 aa  43.9  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.266756 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0974  molybdenum-binding transcriptional repressor  33.33 
 
 
132 aa  43.9  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4134  putative transcriptional regulator, ModE family  32.86 
 
 
121 aa  43.5  0.0009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0113407 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1477  molybdenum-binding protein, N-terminal:molybdenum-pterin binding protein  29.67 
 
 
272 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0590  transcriptional regulator ModE  36 
 
 
282 aa  43.1  0.001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2036  ModE family transcriptional regulator  33.33 
 
 
276 aa  43.5  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.646179  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0281  ModE family transcriptional regulator  28.09 
 
 
134 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1343  molybdenum transport protein, putative  28.21 
 
 
177 aa  42.4  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS05434  putative molybdenum-pterin-binding protein  34.94 
 
 
269 aa  42.7  0.002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2851  ModE family transcriptional regulator  37.35 
 
 
278 aa  42.4  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.894632  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4219  transcriptional regulator, ModE family  34.94 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4329  transcriptional regulator, ModE family  34.94 
 
 
270 aa  42.7  0.002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00653536 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1928  ModE family transcriptional regulator  30.26 
 
 
274 aa  42  0.003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.105567  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2953  ModE family transcriptional regulator  30.14 
 
 
263 aa  42  0.003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1927  ModE family transcriptional regulator  31.76 
 
 
129 aa  42  0.003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4259  ModE family transcriptional regulator  32.86 
 
 
138 aa  42  0.003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.459196  normal  0.100548 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4888  ModE family transcriptional regulator  37.04 
 
 
278 aa  42  0.003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.448887  hitchhiker  0.00360632 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3767  putative transcriptional regulator, ModE family  34.33 
 
 
112 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50680  Mo regulation, Mo processing homeostasis  30 
 
 
270 aa  42  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.438349  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0446  molybdate transport repressor  32.84 
 
 
344 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3008  regulatory protein  32.84 
 
 
344 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2514  ModE family transcriptional regulator  28.57 
 
 
125 aa  41.6  0.004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.217491  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2591  molybdate transport repressor  32.84 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0963  molybdate transport repressor  32.84 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.386261  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2898  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.392199  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2960  LysR family transcriptional regulator  32.84 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0184  molybdate transport repressor  32.84 
 
 
359 aa  41.6  0.004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6807  transcriptional regulator, ModE family  37.35 
 
 
278 aa  41.6  0.004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118536 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0230  putative transcriptional regulator, ModE family  29.35 
 
 
117 aa  41.6  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>