More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1765 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1765  ribonuclease HII  100 
 
 
183 aa  380  1e-105  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0654906  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0342  ribonuclease HII  69.94 
 
 
184 aa  258  3e-68  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0247134  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0016  ribonuclease HII  53.76 
 
 
189 aa  208  4e-53  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0083  ribonuclease HII  56.91 
 
 
183 aa  203  9e-52  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0430  ribonuclease HII  55.14 
 
 
185 aa  198  3e-50  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0010  ribonuclease HII  54.34 
 
 
191 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000542544  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1971  Ribonuclease H  49.44 
 
 
182 aa  175  2e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0578493  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0280  ribonuclease HII  49.71 
 
 
188 aa  174  7e-43  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.259622  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0009  ribonuclease HII  53.76 
 
 
191 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0036  ribonuclease HII  53.76 
 
 
191 aa  169  2e-41  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.00659063  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1492  ribonuclease HII  43.26 
 
 
202 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1428  ribonuclease HII  43.26 
 
 
202 aa  134  5e-31  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.982643  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0542  ribonuclease HII, putative  43.89 
 
 
207 aa  132  3e-30  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.597529  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1547  ribonuclease HII  42.42 
 
 
198 aa  131  3.9999999999999996e-30  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.040973  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2583  ribonuclease HII  43.09 
 
 
199 aa  129  3e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.584045  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_07010  ribonuclease HII  40.54 
 
 
262 aa  128  4.0000000000000003e-29  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  decreased coverage  0.00000706526  normal  0.43338 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0038  ribonuclease HII  37.97 
 
 
205 aa  127  6e-29  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0761  ribonuclease HII  43.32 
 
 
256 aa  127  7.000000000000001e-29  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0868001  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2836  ribonuclease HII  42.7 
 
 
218 aa  127  9.000000000000001e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0154  RNase HII  41.71 
 
 
198 aa  126  2.0000000000000002e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.142664  hitchhiker  0.0000294513 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1910  ribonuclease HII  40.91 
 
 
216 aa  126  2.0000000000000002e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_6711  predicted protein  40.44 
 
 
189 aa  125  3e-28  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00445618  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0017  ribonuclease HII  40.64 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00136282  unclonable  0.000000928974 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0974  ribonuclease HII  41.24 
 
 
206 aa  125  4.0000000000000003e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000000438708  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17230  ribonuclease HII  41.48 
 
 
201 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0914  ribonuclease HII  41.71 
 
 
250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000211389 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002761  ribonuclease HII  42.46 
 
 
211 aa  125  5e-28  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3425  ribonuclease HII  39.25 
 
 
230 aa  124  6e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1271  ribonuclease HII  39.66 
 
 
210 aa  124  9e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.329181  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03223  ribonuclease HII  43.02 
 
 
212 aa  124  1e-27  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0271  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.259033  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1497  ribonuclease HII  40.91 
 
 
201 aa  124  1e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0256  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1375  ribonuclease HII  40.5 
 
 
198 aa  123  1e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000308633  normal  0.450716 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3420  Ribonuclease H  40.34 
 
 
198 aa  123  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00118566  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1548  ribonuclease HII  42.13 
 
 
217 aa  122  2e-27  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1115  ribonuclease HII  41.48 
 
 
213 aa  123  2e-27  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0187  ribonuclease HII  40.34 
 
 
198 aa  123  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000269157  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0185  ribonuclease HII  40.34 
 
 
198 aa  123  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000292767  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1092  ribonuclease HII  38.07 
 
 
219 aa  123  2e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.11848  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1531  Ribonuclease H  43.26 
 
 
203 aa  122  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00536473  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1605  ribonuclease HII  40.91 
 
 
207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.388739  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4172  ribonuclease HII  40.91 
 
 
207 aa  122  3e-27  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.709481  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0268  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.443462  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0252  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.653457 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0252  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  122  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.553168 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2456  ribonuclease HII  42.7 
 
 
208 aa  122  4e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.633452  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1357  ribonuclease HII  42.05 
 
 
218 aa  122  4e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1096  Ribonuclease H  41.71 
 
 
277 aa  121  6e-27  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0149417  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0018  ribonuclease HII  38.5 
 
 
206 aa  121  6e-27  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.0000000692909  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00181  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0135226  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00180  hypothetical protein  40.91 
 
 
198 aa  121  7e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.010735  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2962  ribonuclease H  41.01 
 
 
204 aa  121  7e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0717  ribonuclease HII  42.54 
 
 
255 aa  120  7e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00641691  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3477  ribonuclease HII  40.91 
 
 
198 aa  121  7e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.000111932  normal  0.110141 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1160  ribonuclease HII  40.34 
 
 
207 aa  120  7e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.392772  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0194  ribonuclease HII  40.34 
 
 
198 aa  120  8e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00608058  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1837  ribonuclease HII  42.05 
 
 
206 aa  120  9e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0721  ribonuclease HII  40.34 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2025  ribonuclease HII  39.11 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.179353  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0193  ribonuclease HII  40.34 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.614653  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6072  ribonuclease HII  39.11 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.236887  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0176  ribonuclease HII  40.34 
 
 
198 aa  120  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0723713  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3039  ribonuclease HII  41.48 
 
 
208 aa  120  9.999999999999999e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.982104  normal  0.582676 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2005  ribonuclease HII  39.11 
 
 
214 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0508  RNase HII  38.71 
 
 
213 aa  120  9.999999999999999e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.261807  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2871  ribonuclease HII  40.68 
 
 
203 aa  120  9.999999999999999e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.035191  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0298  ribonuclease HII  38.98 
 
 
217 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1324  ribonuclease HII  39.77 
 
 
191 aa  120  1.9999999999999998e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3757  ribonuclease HII  40.34 
 
 
216 aa  119  1.9999999999999998e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00155926  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0012  ribonuclease HII  43.32 
 
 
238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5315  ribonuclease HII  39.11 
 
 
214 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.120662  normal  0.147211 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1993  ribonuclease HII  39.04 
 
 
206 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0012  ribonuclease HII  43.32 
 
 
238 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0018  ribonuclease HII  39.78 
 
 
207 aa  119  1.9999999999999998e-26  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000987865  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4934  ribonuclease HII  43.26 
 
 
235 aa  119  1.9999999999999998e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.207973  normal  0.116655 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1012  ribonuclease HII  39.43 
 
 
253 aa  119  3e-26  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0454013  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1324  ribonuclease HII  37.99 
 
 
249 aa  119  3e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0444833  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1407  Ribonuclease H  39.34 
 
 
204 aa  119  3e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1516  RNase HII  39.33 
 
 
193 aa  119  3e-26  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0921  ribonuclease H  39.55 
 
 
210 aa  119  3e-26  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.952016  normal  0.218653 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1327  ribonuclease HII  39.2 
 
 
191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0963  ribonuclease HII  41.38 
 
 
198 aa  118  3.9999999999999996e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.765501  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0011  ribonuclease HII  39.15 
 
 
208 aa  118  4.9999999999999996e-26  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  decreased coverage  0.00000000150276  normal  0.177364 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1696  ribonuclease HII  39.11 
 
 
248 aa  118  4.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.915201  normal  0.585229 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1418  ribonuclease HII  39.11 
 
 
236 aa  118  6e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.222636  normal  0.0561712 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0554  Ribonuclease H  40 
 
 
214 aa  118  6e-26  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.14554 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2441  ribonuclease HII  38.55 
 
 
248 aa  118  6e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0813221  normal  0.0206101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2783  ribonuclease HII  37.57 
 
 
227 aa  117  7e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00722116  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1907  ribonuclease HII  37.99 
 
 
217 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.420407 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0560  ribonuclease HII  38.55 
 
 
229 aa  117  9e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2038  ribonuclease HII  37.99 
 
 
217 aa  117  9e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.886397  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0703  ribonuclease H  36.7 
 
 
269 aa  117  9.999999999999999e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.076303  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0334  Ribonuclease H  42.62 
 
 
199 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0045  ribonuclease HII  40.56 
 
 
181 aa  117  9.999999999999999e-26  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4068  ribonuclease HII  39.77 
 
 
207 aa  117  9.999999999999999e-26  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0312759 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1837  ribonuclease HII  40.45 
 
 
240 aa  117  9.999999999999999e-26  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38850  ribonuclease HII  40.45 
 
 
207 aa  116  1.9999999999999998e-25  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.234048  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1452  ribonuclease HII  42.13 
 
 
209 aa  116  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.44522 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0668  ribonuclease H  39.89 
 
 
199 aa  116  1.9999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0544972  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>