More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1740 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1740  transcription elongation factor GreA  100 
 
 		 135 aa  269  1e-71  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.97626  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0919  ExbBTolQ family transport protein  93.28 
 
 		 155 aa  254  3e-67  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.014762  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1523  ExbBTolQ family transport protein  72.18 
 
 		 199 aa  184  3e-46  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00000117252  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0689  ExbBTolQ family transport protein  64.18 
 
 		 192 aa  176  7e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  decreased coverage  0.00337  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0517  MotA/TolQ/ExbB proton channel  65.69 
 
 		 195 aa  174  4e-43  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0144  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  58.27 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.000000207566  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0116  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  58.27 
 
 		 184 aa  141  3e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000187763  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0197  TonB system transport protein ExbB  56.49 
 
 		 186 aa  140  7e-33  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.0000967122  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0104  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  57.48 
 
 		 184 aa  139  1.9999999999999998e-32  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1401  MotA/TolQ/ExbB proton channel  50 
 
 		 188 aa  120  5e-27  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.471919  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0683  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.23 
 
 		 231 aa  82.4  0.000000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.303112  normal  0.112554 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2325  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.36 
 
 		 232 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.928005  normal  0.316985 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0672  biopolymer transport protein, TolQ  45.36 
 
 		 232 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00353274  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1014  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.57 
 
 		 233 aa  77.8  0.00000000000004  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.362797  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3581  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.14 
 
 		 299 aa  78.2  0.00000000000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3975  tolQ protein  45.45 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0234616  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1412  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 231 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0108204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.3 
 
 		 232 aa  76.6  0.00000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.794955  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1226  tolQ protein  44.79 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.369592  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0172  TonB system transport protein ExbB  42.55 
 
 		 253 aa  76.3  0.0000000000001  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0147  protein TolQ  40.87 
 
 		 235 aa  75.9  0.0000000000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0142  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.34 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0923  protein TolQ  43.24 
 
 		 248 aa  75.1  0.0000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.130209 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4430  protein TolQ  47.62 
 
 		 232 aa  75.5  0.0000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.46646 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2136  Tol-Pal system, TolQ  50.72 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0533  protein TolQ  42.86 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.331397  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0331  MotA/TolQ/ExbB proton channel  35.14 
 
 		 232 aa  74.7  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0399463  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1532  hypothetical protein  37.6 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1451  hypothetical protein  37.6 
 
 		 224 aa  74.3  0.0000000000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1219  biopolymer transport protein TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.712744  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1248  Tol-Pal system, TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.216384  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4199  protein TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.40323  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3996  protein TolQ  45.45 
 
 		 231 aa  74.3  0.0000000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.523638  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0273  protein TolQ  42.34 
 
 		 241 aa  74.3  0.0000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.673317  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1274  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 231 aa  73.9  0.0000000000007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.232758  normal  0.304845 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2463  protein TolQ  36.36 
 
 		 234 aa  73.9  0.0000000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0263661  normal  0.458025 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1850  MotA/TolQ/ExbB proton channel  39.42 
 
 		 225 aa  73.6  0.0000000000008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.83962  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 238 aa  73.6  0.0000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0125924  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1854  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.68 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0235502  normal  0.794171 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_36670  TolQ proton channel  39.45 
 
 		 231 aa  73.2  0.000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0994349  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.21615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2941  protein TolQ  37.29 
 
 		 236 aa  73.6  0.000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2734  protein TolQ  45.68 
 
 		 229 aa  73.2  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.252045  hitchhiker  0.000106629 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3165  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.55 
 
 		 229 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2232  TolQ protein  40.45 
 
 		 228 aa  73.6  0.000000000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3985  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.82 
 
 		 238 aa  73.2  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.912211  normal  0.139699 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2089  MotA/TolQ/ExbB proton channel  47.5 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000689785  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0147  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1782  protein TolQ  39.09 
 
 		 228 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000921899  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2567  Tol-Pal system TolQ  45.68 
 
 		 229 aa  72.4  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000000576197  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1215  Tol-Pal system TolQ  46.75 
 
 		 236 aa  72.4  0.000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.21017  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_51750  TolQ protein  44.16 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438505  hitchhiker  0.0000223597 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2541  protein TolQ  39.09 
 
 		 228 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000245733  hitchhiker  0.00000309411 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2364  protein TolQ  52.31 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.501441 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1702  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 229 aa  72.8  0.000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0354123  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1739  Tol-Pal system TolQ  39.09 
 
 		 228 aa  72  0.000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000000243293  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0390  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.4 
 
 		 227 aa  72.4  0.000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4332  MotA/TolQ/ExbB proton channel  34.85 
 
 		 238 aa  72.4  0.000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.236556  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1604  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 228 aa  72  0.000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00156809  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4539  TolQ protein  44.16 
 
 		 231 aa  72.4  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0595  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.23 
 
 		 235 aa  72.4  0.000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0747  protein TolQ  38.94 
 
 		 238 aa  72  0.000000000003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.958202 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2751  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  45.45 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3240  tolQ protein  46.75 
 
 		 236 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.126744  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0167  tonB-system energizer ExbB  36.36 
 
 		 323 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.115924 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1524  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0123133  normal  0.884869 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2954  transmembrane protein/ biopolymer transport  37.27 
 
 		 227 aa  72  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0172322  normal  0.721905 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4405  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.16 
 
 		 221 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0344768  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0895  MotA/TolQ/ExbB proton channel  37.62 
 
 		 229 aa  71.6  0.000000000003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000627927  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_02500  transport protein ExbB  38.53 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0102562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2532  peptidase A8, signal peptidase II  43.21 
 
 		 231 aa  72  0.000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00489789  normal  0.411252 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0280  transport protein ExbB  38.53 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2371  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00211275  normal  0.155674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3390  protein TolQ  39.66 
 
 		 238 aa  71.2  0.000000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.431246  normal  0.281119 
 
 
-
 
NC_004310  BR1700  tolQ protein  46.75 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4433  protein TolQ  39.66 
 
 		 238 aa  71.6  0.000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0339426  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2214  MotA/TolQ/ExbB proton channel  42.86 
 
 		 232 aa  71.6  0.000000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1642  protein TolQ  38.74 
 
 		 236 aa  71.2  0.000000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.528905  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5555  MotA/TolQ/ExbB proton channel  36.36 
 
 		 317 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2978  TolQ protein  54.84 
 
 		 223 aa  71.6  0.000000000004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3629  tolQ protein  44.32 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2534  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000101898  normal  0.114902 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0149  MotA/TolQ/ExbB proton channel  44.32 
 
 		 251 aa  71.6  0.000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.000197157  hitchhiker  0.00713803 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2443  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 228 aa  71.6  0.000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000858501  normal  0.237078 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1459  MotA/TolQ/ExbB proton channel  46.75 
 
 		 229 aa  71.2  0.000000000004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00757308  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1618  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00749474 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1900  MotA/TolQ/ExbB proton channel  48.65 
 
 		 233 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4056  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.01 
 
 		 225 aa  70.9  0.000000000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3537  MotA/TolQ/ExbB proton channel  41.58 
 
 		 224 aa  70.9  0.000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000120137  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0471  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 		 230 aa  70.9  0.000000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.564154  normal  0.664917 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1559  MotA/TolQ/ExbB proton channel  49.37 
 
 		 244 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.413379  hitchhiker  0.000693318 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1743  MotA/TolQ/ExbB proton channel  38.18 
 
 		 228 aa  70.9  0.000000000006  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000915639  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0752  MotA/TolQ/ExbB proton channel  43.75 
 
 		 268 aa  70.9  0.000000000006  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00339966  normal  0.664237 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1895  TolQ protein, inner membrane component  40.43 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000007  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1376  tolQ protein  35.16 
 
 		 225 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0482994  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003916  MotA/TolQ/ExbB proton channel family protein  37.27 
 
 		 211 aa  70.5  0.000000000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0542858  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1391  MotA/TolQ/ExbB proton channel  45.45 
 
 		 229 aa  70.5  0.000000000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000787618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2717  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.86 
 
 		 228 aa  70.5  0.000000000008  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.169266  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5305  protein TolQ  48.05 
 
 		 238 aa  70.5  0.000000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.442812  normal  0.461474 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0245  MotA/TolQ/ExbB proton channel  40.74 
 
 		 235 aa  70.5  0.000000000008  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>