61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1735 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1735  F0F1 ATP synthase subunit delta  100 
 
 		 176 aa  347  7e-95  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0914  F0F1 ATP synthase subunit delta  71.02 
 
 		 176 aa  249  1e-65  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00240789  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1528  F0F1 ATP synthase subunit delta  50 
 
 		 176 aa  165  4e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0797496  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0512  ATP synthase F1, delta subunit  45.45 
 
 		 176 aa  154  9e-37  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0192  F0F1 ATP synthase subunit delta  44.89 
 
 		 173 aa  135  4e-31  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.745397  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0684  F0F1 ATP synthase subunit delta  40.34 
 
 		 176 aa  133  9.999999999999999e-31  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0099  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.77 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0139  F0F1 ATP synthase subunit delta  39.77 
 
 		 173 aa  123  1e-27  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0111  F0F1 ATP synthase subunit delta  38.07 
 
 		 173 aa  119  1.9999999999999998e-26  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.262179  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1406  F0F1 ATP synthase subunit delta  36.16 
 
 		 177 aa  110  9e-24  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.233831  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3878  ATP synthase F1, delta subunit  30.08 
 
 		 178 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000205385  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6359  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.399454  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3190  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.89 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73280  F0F1 ATP synthase subunit delta  27.71 
 
 		 178 aa  55.1  0.0000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0119  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.23 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.231197  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2952  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.23 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.226604  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.23 
 
 		 179 aa  54.7  0.0000007  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0559682  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3285  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.23 
 
 		 179 aa  54.3  0.0000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.724178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3515  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.33 
 
 		 178 aa  54.3  0.0000008  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.218117  hitchhiker  0.000331491 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52190  F1 sector of membrane-bound ATP synthase, delta subunit  28.15 
 
 		 178 aa  53.9  0.000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3320  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.03 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.0028725  normal  0.130024 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.58 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.163792  normal  0.702124 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4610  ATP synthase F1, delta subunit  29.32 
 
 		 178 aa  53.1  0.000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.994341  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0094  F0F1 ATP synthase subunit delta  22.58 
 
 		 179 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.244879  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0182  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.29 
 
 		 179 aa  51.6  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.98764  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3311  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0205663  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3012  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.250614  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4045  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3971  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1590  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0134138  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0103  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.29 
 
 		 179 aa  50.4  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00560737  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2954  F0F1 ATP synthase subunit delta  23.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0301983  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0037  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.53 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0129228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3897  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.53 
 
 		 179 aa  49.7  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0307  ATP synthase F1, delta subunit  27.78 
 
 		 178 aa  50.1  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.0000503063  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3030  F0F1 ATP synthase subunit delta  21.94 
 
 		 179 aa  49.3  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3969  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.48 
 
 		 178 aa  47.8  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00110961  normal  0.295514 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3349  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.71 
 
 		 179 aa  47.8  0.00009  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.363795  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0005  F0F1 ATP synthase subunit delta  29.13 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000453389  hitchhiker  0.00865282 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5203  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.99 
 
 		 178 aa  45.4  0.0004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.021535  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3828  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.92 
 
 		 180 aa  44.7  0.0007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5298  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.54 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.243387  normal  0.15096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5434  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.54 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5416  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.54 
 
 		 178 aa  44.3  0.0008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.952329  hitchhiker  0.000678034 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3497  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 180 aa  44.3  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0214054  normal  0.242714 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4179  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000101182  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2800  F-type H+-transporting ATP synthase, delta (OSCP) subunit  24.29 
 
 		 178 aa  44.3  0.001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.31614  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0269  ATP synthase F1, delta subunit  27.41 
 
 		 175 aa  43.9  0.001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4205  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000051054  normal  0.165641 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4223  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.84 
 
 		 177 aa  44.3  0.001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000462366  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5733  F0F1 ATP synthase subunit delta  25.77 
 
 		 178 aa  43.1  0.002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00607755  normal  0.419726 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3308  H(+)-transporting two-sector ATPase  23.88 
 
 		 178 aa  42.4  0.003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.276301  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5124  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.06 
 
 		 178 aa  42.7  0.003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.346499  normal  0.863545 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2433  F0F1 ATP synthase subunit delta  19.57 
 
 		 178 aa  42.4  0.004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.270416  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4243  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.11 
 
 		 177 aa  42  0.005  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000376424  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4129  F0F1 ATP synthase subunit delta  24.2 
 
 		 177 aa  41.6  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.000754285  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0252  F0F1 ATP synthase subunit delta  30.68 
 
 		 179 aa  41.2  0.007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5602  ATP synthase F1, delta subunit  25.45 
 
 		 178 aa  41.2  0.007  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4465  ATP synthase F1, delta subunit  25.47 
 
 		 178 aa  41.2  0.008  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00110137  hitchhiker  0.0000000108481 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0324  F0F1 ATP synthase subunit delta  26.62 
 
 		 176 aa  40.8  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.201646  normal  0.377172 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4298  ATP synthase F1, delta subunit  31.25 
 
 		 177 aa  40.8  0.01  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0142998  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>