222 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1682 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1682  hypothetical protein  100 
 
 
246 aa  463  1e-129  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0348  hypothetical protein  49.77 
 
 
242 aa  202  3e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.01487  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0553  protein of unknown function DUF81  49.32 
 
 
250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1601  Cpp22  50 
 
 
246 aa  196  4.0000000000000005e-49  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1259  hypothetical protein  56.12 
 
 
242 aa  184  1.0000000000000001e-45  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0347  hypothetical protein  45.62 
 
 
247 aa  173  1.9999999999999998e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0306416  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1164  hypothetical protein  45.74 
 
 
246 aa  167  1e-40  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.344756  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1329  conserved hypothetical integral membrane protein (DUF81 domain protein)  37.96 
 
 
259 aa  160  2e-38  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.520044  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0391  hypothetical protein  37.5 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.329397  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0367  hypothetical protein  37.07 
 
 
261 aa  145  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1616  hypothetical protein  36.64 
 
 
261 aa  142  6e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0457  hypothetical protein  26.29 
 
 
307 aa  84  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1940  hypothetical protein  29.85 
 
 
269 aa  79  0.00000000000006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0073  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0071  hypothetical protein  28.57 
 
 
251 aa  75.9  0.0000000000006  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1905  protein of unknown function DUF81  26.54 
 
 
305 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2258  hypothetical protein  26.54 
 
 
296 aa  71.2  0.00000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0208  protein of unknown function DUF81  26.85 
 
 
307 aa  68.6  0.00000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.61262  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0237  protein of unknown function DUF81  26.85 
 
 
307 aa  68.2  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.455283  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0881  hypothetical protein  25.62 
 
 
306 aa  67.4  0.0000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.308903 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0026  hypothetical protein  26.44 
 
 
305 aa  66.6  0.0000000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.25228  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0148  hypothetical protein  26.29 
 
 
308 aa  65.9  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.171694 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2206  hypothetical protein  25.62 
 
 
306 aa  65.9  0.0000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.767696  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0843  hypothetical protein  28.12 
 
 
307 aa  65.1  0.0000000009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.226682 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0749  hypothetical protein  28.46 
 
 
270 aa  64.7  0.000000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0741  hypothetical protein  25.88 
 
 
308 aa  63.5  0.000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.610206  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15320  hypothetical protein  27.23 
 
 
249 aa  62.8  0.000000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1097  hypothetical protein  24.55 
 
 
262 aa  62.4  0.000000007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0909  protein of unknown function DUF81  28.34 
 
 
268 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0764  hypothetical protein  28.34 
 
 
264 aa  62.4  0.000000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0184  hypothetical protein  23.81 
 
 
343 aa  62  0.000000008  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.249656  normal  0.93927 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0921  hypothetical protein  27.8 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0525574  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0940  hypothetical protein  27.8 
 
 
275 aa  61.2  0.00000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2287  hypothetical protein  27.32 
 
 
306 aa  61.2  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.733159  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1534  hypothetical protein  26.26 
 
 
263 aa  60.8  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.544082 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0534  hypothetical protein  25.1 
 
 
310 aa  60.8  0.00000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.736309  normal  0.683051 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0967  protein of unknown function DUF81  24.59 
 
 
303 aa  60.1  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000092207  normal  0.442745 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0958  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3994  hypothetical protein  24.35 
 
 
249 aa  59.7  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000982231  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2847  hypothetical protein  25.49 
 
 
306 aa  59.7  0.00000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.258589  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0249  hypothetical protein  29.69 
 
 
267 aa  59.7  0.00000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0931  protein of unknown function DUF81  30.95 
 
 
259 aa  60.1  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0761  hypothetical protein  30.95 
 
 
260 aa  59.3  0.00000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0602  hypothetical protein  28.3 
 
 
307 aa  58.5  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.116643  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2132  hypothetical protein  25.5 
 
 
254 aa  58.5  0.00000009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0203643  normal  0.380542 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0881  protein of unknown function DUF81  23.9 
 
 
320 aa  58.2  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3094  hypothetical protein  26.05 
 
 
253 aa  57.8  0.0000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1862  hypothetical protein  23.32 
 
 
249 aa  57  0.0000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.478353  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2432  hypothetical protein  26.92 
 
 
252 aa  57.4  0.0000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4039  hypothetical protein  26.19 
 
 
306 aa  57.8  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.995552  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1464  hypothetical protein  27.49 
 
 
274 aa  57.4  0.0000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0625984  normal  0.0621231 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1713  hypothetical protein  26.96 
 
 
270 aa  57.8  0.0000002  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.598316  n/a   
 
 
-
 
NC_011688  PHATRDRAFT_49038  predicted protein  32.56 
 
 
2798 aa  57.4  0.0000002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1540  hypothetical protein  32.22 
 
 
305 aa  57.4  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.472601 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0040  protein of unknown function DUF81  25.68 
 
 
309 aa  57  0.0000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1150  hypothetical protein  25.61 
 
 
275 aa  57  0.0000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04440  putative permease  26.98 
 
 
267 aa  56.6  0.0000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2248  hypothetical protein  34.69 
 
 
255 aa  57  0.0000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00169132  normal  0.307882 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5143  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.161366  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2854  hypothetical protein  25.23 
 
 
254 aa  56.2  0.0000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5050  hypothetical protein  28.46 
 
 
260 aa  56.2  0.0000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4610  hypothetical protein  25.69 
 
 
307 aa  55.5  0.0000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.427893  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0772  hypothetical protein  26.59 
 
 
316 aa  55.5  0.0000008  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000254854  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0823  hypothetical protein  25.79 
 
 
316 aa  55.5  0.0000008  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.580669  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3852  hypothetical protein  24.87 
 
 
261 aa  55.5  0.0000008  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.29385  normal  0.134077 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5196  hypothetical protein  28.52 
 
 
260 aa  55.1  0.0000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0800  hypothetical protein  24.6 
 
 
307 aa  54.7  0.000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.979856  normal  0.617739 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1418  hypothetical protein  24.78 
 
 
300 aa  54.7  0.000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.297306  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3547  hypothetical protein  23.19 
 
 
304 aa  54.7  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.519882 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0807  putative permease  24.71 
 
 
308 aa  54.7  0.000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0899504 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3172  hypothetical protein  24.71 
 
 
277 aa  53.9  0.000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.934574  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2848  hypothetical protein  25.98 
 
 
244 aa  54.3  0.000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.362941  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0189  hypothetical protein  25.69 
 
 
270 aa  54.7  0.000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2986  hypothetical protein  25.91 
 
 
255 aa  53.9  0.000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.509534  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3910  hypothetical protein  24.71 
 
 
277 aa  54.3  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.562696  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0322  hypothetical protein  27.69 
 
 
260 aa  54.3  0.000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.875431  normal  0.804382 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1437  hypothetical protein  24.35 
 
 
261 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.306922 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0433  hypothetical protein  26.88 
 
 
260 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0394251  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1975  hypothetical protein  24.31 
 
 
394 aa  53.5  0.000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.00000141125  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7258  protein of unknown function DUF81  25.56 
 
 
263 aa  53.5  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.338595  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1499  hypothetical protein  26.03 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1472  hypothetical protein  22.8 
 
 
261 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.246205  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5375  hypothetical protein  28.57 
 
 
260 aa  53.1  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.243467 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1285  protein of unknown function DUF81  25.91 
 
 
286 aa  53.1  0.000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2312  hypothetical protein  24.49 
 
 
265 aa  53.1  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.597575 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4952  protein of unknown function DUF81  26.5 
 
 
262 aa  53.1  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1177  hypothetical protein  24.59 
 
 
266 aa  52.8  0.000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0812924  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1173  protein of unknown function DUF81  27.17 
 
 
267 aa  52.8  0.000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3098  hypothetical protein  25.83 
 
 
330 aa  52.8  0.000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.075635  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0240  hypothetical protein  27.56 
 
 
313 aa  52.4  0.000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.0364801  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2541  protein of unknown function DUF81  42.11 
 
 
258 aa  52.4  0.000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18800  predicted permease  24.91 
 
 
323 aa  52.4  0.000007  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2483  hypothetical protein  35.05 
 
 
119 aa  52.4  0.000008  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1572  hypothetical protein  26.32 
 
 
268 aa  52  0.000009  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2244  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3494  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  51.2  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.585154  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1875  hypothetical protein  30 
 
 
261 aa  52  0.00001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0603  hypothetical protein  23.42 
 
 
315 aa  51.6  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.117453  normal  0.827716 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1708  protein of unknown function DUF81  25 
 
 
291 aa  50.8  0.00002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.680358 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1649  protein of unknown function DUF81  35.48 
 
 
277 aa  50.8  0.00002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.641158  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>