105 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1472 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1472  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 
300 aa  611  9.999999999999999e-175  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1012  signal recognition particle protein  64.55 
 
 
304 aa  391  1e-108  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1455  radical SAM domain-containing protein  52.35 
 
 
308 aa  315  7e-85  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0530  conserved hypothetical protein, putative radical SAM domain protein  50.51 
 
 
302 aa  293  2e-78  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0316  Radical SAM domain protein  51.84 
 
 
303 aa  292  4e-78  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1259  radical SAM domain-containing protein  49.83 
 
 
300 aa  283  3.0000000000000004e-75  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0482  radical SAM domain-containing protein  49.33 
 
 
300 aa  281  8.000000000000001e-75  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.992471  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1380  radical SAM domain-containing protein  49.66 
 
 
300 aa  280  2e-74  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0538  Radical SAM domain protein  46.31 
 
 
303 aa  252  5.000000000000001e-66  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00127188  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1270  radical SAM domain-containing protein  47.75 
 
 
300 aa  250  2e-65  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0633  radical SAM family protein  40.74 
 
 
310 aa  223  3e-57  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.0000000656593  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2486  GTP-binding protein Obg/CgtA  35.05 
 
 
680 aa  162  8.000000000000001e-39  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0336  hypothetical protein  33.89 
 
 
319 aa  152  5e-36  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.300886  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2049  radical SAM domain-containing protein  37.2 
 
 
319 aa  151  1e-35  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1142  radical SAM domain-containing protein  33.33 
 
 
310 aa  149  8e-35  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0361  radical SAM domain-containing protein  33.21 
 
 
313 aa  144  1e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0886527  normal  0.763423 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2341  Radical SAM domain protein  38.46 
 
 
330 aa  145  1e-33  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.109673 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11060  Radical SAM domain protein  34.35 
 
 
239 aa  139  7.999999999999999e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00221485  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0808  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 
320 aa  138  1e-31  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0322  radical SAM domain-containing protein  36.2 
 
 
364 aa  136  5e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.44863  normal  0.156857 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1179  radical SAM domain-containing protein  28.57 
 
 
331 aa  135  9.999999999999999e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.143255 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0538  radical SAM domain-containing protein  29.84 
 
 
329 aa  130  2.0000000000000002e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.111503  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2156  radical SAM family protein  36.84 
 
 
313 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0108  radical SAM domain-containing protein  30.07 
 
 
295 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0458  Radical SAM domain protein  31.73 
 
 
332 aa  131  2.0000000000000002e-29  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1223  Radical SAM domain protein  31.6 
 
 
237 aa  127  3e-28  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00674183 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2377  Radical SAM domain protein  33.33 
 
 
365 aa  123  4e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0688  MoaA/NifB/PqqE family protein  28.88 
 
 
312 aa  120  1.9999999999999998e-26  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.110468  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0454  radical SAM domain-containing protein  28.29 
 
 
312 aa  121  1.9999999999999998e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.383393  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1848  radical SAM domain-containing protein  34.3 
 
 
310 aa  120  3e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1638  radical SAM domain-containing protein  27.33 
 
 
313 aa  120  3e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00824164  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04120  Radical SAM domain protein  32.56 
 
 
311 aa  120  3e-26  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1559  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 
316 aa  118  9e-26  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0969548  hitchhiker  0.000892375 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3462  radical SAM domain-containing protein  25.96 
 
 
313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0912  Radical SAM domain protein  32.21 
 
 
314 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.883819  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1667  Radical SAM domain protein  27.74 
 
 
321 aa  117  3e-25  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.332302  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1531  radical SAM domain-containing protein  31.6 
 
 
308 aa  116  6e-25  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.652201  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0562  radical SAM domain-containing protein  26.35 
 
 
311 aa  114  1.0000000000000001e-24  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1962  radical SAM domain-containing protein  26.92 
 
 
323 aa  114  2.0000000000000002e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1460  Elongator protein 3/MiaB/NifB  32.37 
 
 
312 aa  111  1.0000000000000001e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2416  Radical SAM domain protein  32.7 
 
 
328 aa  111  2.0000000000000002e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1586  hypothetical protein  28.62 
 
 
326 aa  108  2e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1404  radical SAM domain-containing protein  30.84 
 
 
320 aa  106  4e-22  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.937371  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3775  Radical SAM domain protein  31.05 
 
 
266 aa  105  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1155  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 
319 aa  105  1e-21  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0828  Fe-S oxidoreductase  32.78 
 
 
326 aa  104  2e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.389597  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2043  Radical SAM domain protein  33.17 
 
 
267 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1760  radical SAM domain-containing protein  30.56 
 
 
323 aa  103  3e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.265975  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1149  radical SAM family Fe-S protein  26.69 
 
 
326 aa  103  5e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0991  Radical SAM domain protein  27.54 
 
 
311 aa  102  7e-21  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4632  radical SAM family protein  27.73 
 
 
270 aa  100  2e-20  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.453222  normal  0.0698866 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3606  radical SAM domain-containing protein  35.98 
 
 
244 aa  99.8  5e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.455645 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1039  radical SAM domain-containing protein  26.13 
 
 
231 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0813206  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0892  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.93 
 
 
326 aa  56.6  0.0000005  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0729  hypothetical protein  25.47 
 
 
293 aa  53.1  0.000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1835  2-methylthioadenine synthase  26.55 
 
 
442 aa  52.4  0.000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1930  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.36 
 
 
319 aa  50.4  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1292  hypothetical protein  25.74 
 
 
291 aa  49.7  0.00005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.187698  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0821  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.39 
 
 
337 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1609  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  30.86 
 
 
317 aa  48.9  0.0001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1363  radical SAM domain-containing protein  26.97 
 
 
458 aa  48.9  0.0001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.359943  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0869  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.39 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0873  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.39 
 
 
337 aa  48.9  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.114642  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.29 
 
 
298 aa  48.1  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2491  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.39 
 
 
353 aa  48.1  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.989174  normal  0.187655 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1590  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  32.11 
 
 
316 aa  47.8  0.0002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2571  radical SAM domain-containing protein  25.62 
 
 
365 aa  47  0.0003  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0733  Radical SAM domain protein  26.53 
 
 
423 aa  47.4  0.0003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00000179291  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0507  radical SAM domain-containing protein  28.82 
 
 
332 aa  47  0.0004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0681581  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1337  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.83 
 
 
308 aa  46.2  0.0006  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0490637  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1486  radical SAM family protein  27.12 
 
 
292 aa  46.2  0.0006  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2214  tRNA-modifying enzyme  25.29 
 
 
297 aa  46.2  0.0007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0327  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  31.58 
 
 
344 aa  46.2  0.0007  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2567  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.19 
 
 
333 aa  45.8  0.0008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.324363  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0119  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
327 aa  45.8  0.0008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.491091 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0368  radical SAM domain-containing protein  26.67 
 
 
574 aa  45.1  0.001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1300  radical SAM domain-containing protein  25.77 
 
 
457 aa  45.4  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.32123  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1392  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.38 
 
 
317 aa  45.4  0.001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3074  Radical SAM domain protein  28.16 
 
 
431 aa  45.1  0.001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.316407 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2838  tRNA-modifying enzyme  26.74 
 
 
306 aa  44.7  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0197785 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1782  radical SAM protein  26.88 
 
 
349 aa  44.7  0.002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02449  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  26.44 
 
 
343 aa  44.7  0.002  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1853  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.11 
 
 
335 aa  45.1  0.002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0613  glycosyl transferase, group 1 family protein / moaA/nifB/pqqE family protein  23.1 
 
 
778 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.12808  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1039  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  29.81 
 
 
373 aa  44.3  0.003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.491937  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1476  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.27 
 
 
299 aa  43.9  0.003  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0576  radical SAM domain-containing protein  25.61 
 
 
457 aa  43.9  0.003  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.11056  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1850  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.39 
 
 
340 aa  43.5  0.004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1322  GTP cyclohydrolase subunit MoaA  29.75 
 
 
317 aa  43.5  0.004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.331504  normal  0.241678 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2244  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  27.04 
 
 
326 aa  43.5  0.004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.555933  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0940  Wyosine base formation domain protein  28.1 
 
 
350 aa  43.5  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.884068  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3844  radical SAM domain-containing protein  37.31 
 
 
533 aa  43.5  0.005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0597  putative molybdenum cofactor biosynthesis protein A  25.93 
 
 
348 aa  43.1  0.005  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0756  MiaB-like tRNA modifying enzyme  26.13 
 
 
404 aa  43.1  0.005  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0825  Radical SAM domain protein  27.87 
 
 
384 aa  43.5  0.005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000904645  hitchhiker  0.00000108839 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0923  hypothetical protein  28.57 
 
 
77 aa  43.1  0.006  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000000601668  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2268  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.06 
 
 
325 aa  42.7  0.006  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2280  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  30.57 
 
 
337 aa  42.7  0.008  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.321552  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1430  radical SAM domain-containing protein  23.91 
 
 
302 aa  42.4  0.009  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.698676  hitchhiker  0.00476012 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1371  radical SAM domain-containing protein  25 
 
 
457 aa  42.4  0.009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.000145601 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>