25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1460 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1460  putative lipoprotein  100 
 
 
166 aa  340  4e-93  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.628596  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0762  putative lipoprotein  53.85 
 
 
171 aa  192  2e-48  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00319685  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1141  conserved hypothetical lipoprotein (DUF400 domain protein)  53.53 
 
 
172 aa  191  4e-48  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1045  putative lipoprotein  53.85 
 
 
171 aa  190  7e-48  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.0113599  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1170  putative lipoprotein  53.25 
 
 
171 aa  189  2e-47  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1461  putative lipoprotein  54.6 
 
 
161 aa  182  2.0000000000000003e-45  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0322  protein of unknown function DUF400  55.24 
 
 
145 aa  122  2e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0639  hypothetical protein  47.31 
 
 
192 aa  95.9  2e-19  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00823182  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1297  hypothetical protein  30.82 
 
 
148 aa  53.1  0.000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1339  hypothetical protein  34.04 
 
 
148 aa  49.3  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1482  hypothetical protein  26.4 
 
 
223 aa  49.3  0.00003  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1334  hypothetical protein  33.7 
 
 
148 aa  48.5  0.00004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.572155  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3159  hypothetical protein  34.57 
 
 
178 aa  48.1  0.00005  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3106  hypothetical protein  31.03 
 
 
155 aa  48.1  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.380867  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0036  hypothetical protein  30.39 
 
 
292 aa  48.1  0.00006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000461635  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1591  hypothetical protein  36.25 
 
 
148 aa  47.8  0.00007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1470  putative lipoprotein  25.84 
 
 
155 aa  47.4  0.0001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0154  hypothetical protein  32.61 
 
 
146 aa  45.4  0.0003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1151  hypothetical protein  30.85 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3785  hypothetical protein  25.58 
 
 
209 aa  43.9  0.001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.210896  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1265  hypothetical protein  30.07 
 
 
302 aa  43.5  0.001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.014663  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2344  putative lipoprotein  34.62 
 
 
144 aa  42  0.004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.724152  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004179  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  42  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01278  hypothetical protein  31.25 
 
 
143 aa  40.8  0.008  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02936  hypothetical protein  25.77 
 
 
161 aa  40.8  0.008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>