142 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1435 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1435  hypothetical protein  100 
 
 
313 aa  643    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0152442  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0090  mce related protein  67.83 
 
 
313 aa  447  1.0000000000000001e-124  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0699486  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0575  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  40.26 
 
 
288 aa  233  3e-60  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0475  putative ABC transport system periplasmic substrate-binding protein  38.26 
 
 
304 aa  204  2e-51  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.848355  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0119  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  29.66 
 
 
275 aa  96.3  5e-19  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0156  hypothetical protein  25.24 
 
 
312 aa  96.3  6e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.997452 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2028  hypothetical protein  29.03 
 
 
307 aa  94  3e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0626  ABC transporter permease  23.2 
 
 
308 aa  93.2  4e-18  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.112844  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0100  Mammalian cell entry related domain protein  27.33 
 
 
316 aa  93.2  5e-18  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0140  hypothetical protein  24.61 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.682464 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2008  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  22.51 
 
 
296 aa  92.4  9e-18  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0158  hypothetical protein  24.61 
 
 
312 aa  92  1e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0577  hypothetical protein  22.36 
 
 
308 aa  91.7  1e-17  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.749568  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1820  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.19 
 
 
296 aa  91.3  2e-17  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1679  hypothetical protein  29.61 
 
 
298 aa  90.9  2e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1639  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  22.19 
 
 
296 aa  91.7  2e-17  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2023  hypothetical protein  28.64 
 
 
307 aa  90.9  3e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0039  hypothetical protein  24.92 
 
 
312 aa  90.5  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.292682  normal  0.178021 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22660  hypothetical protein  25.95 
 
 
312 aa  89.7  6e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00283529 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0522  Mammalian cell entry related domain protein  22.88 
 
 
308 aa  89  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.629914  normal  0.424693 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2344  hypothetical protein  25.08 
 
 
306 aa  89  1e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0043368 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5087  hypothetical protein  23.97 
 
 
312 aa  89  1e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0684473 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0249  ABC-type transport system periplasmic component  29.02 
 
 
315 aa  87  3e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.79889 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0371  hypothetical protein  24.76 
 
 
305 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1913  hypothetical protein  25.16 
 
 
312 aa  86.3  6e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1552  hypothetical protein  24.05 
 
 
458 aa  85.1  0.000000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.394461  normal  0.189115 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0743  hypothetical protein  23.36 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1222  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  23.36 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1208  hypothetical protein  23.27 
 
 
308 aa  85.1  0.000000000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4115  hypothetical protein  25.38 
 
 
307 aa  84.7  0.000000000000002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0544388  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3566  hypothetical protein  23.75 
 
 
312 aa  84  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.46814  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2315  hypothetical protein  23.61 
 
 
433 aa  82.4  0.000000000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.629666  normal  0.23577 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1983  hypothetical protein  25.48 
 
 
301 aa  81.6  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1360  Mammalian cell entry related domain protein  24.32 
 
 
334 aa  81.3  0.00000000000002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1503  Mammalian cell entry related domain protein  26.4 
 
 
307 aa  79.7  0.00000000000005  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2805  Mammalian cell entry related domain protein  29.6 
 
 
357 aa  79.7  0.00000000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1895  ABC transporter substrate binding protein  27.35 
 
 
455 aa  79.3  0.00000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2193  Mammalian cell entry related domain protein  25.86 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.141725  normal  0.182946 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1610  hypothetical protein  23.25 
 
 
313 aa  78.2  0.0000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1982  Mammalian cell entry related domain protein  25.86 
 
 
456 aa  77.8  0.0000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0362661  normal  0.670067 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0178  Mammalian cell entry related domain protein  22.78 
 
 
305 aa  78.2  0.0000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2514  hypothetical protein  22.29 
 
 
302 aa  77.8  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0373094  hitchhiker  0.00640469 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1718  hypothetical protein  23.89 
 
 
321 aa  77  0.0000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.130812  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1487  hypothetical protein  23.91 
 
 
321 aa  76.6  0.0000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.30011 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2811  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein  23.91 
 
 
321 aa  76.3  0.0000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.218461  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0479  hypothetical protein  24.23 
 
 
313 aa  75.1  0.000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0772873  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2002  hypothetical protein  23.61 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2368  hypothetical protein  21.41 
 
 
316 aa  75.1  0.000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.709282  normal  0.77833 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1317  hypothetical protein  24.75 
 
 
293 aa  74.3  0.000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2048  hypothetical protein  23.33 
 
 
579 aa  74.7  0.000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.715666 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3670  hypothetical protein  22.86 
 
 
353 aa  73.6  0.000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0456409 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1954  hypothetical protein  23.28 
 
 
360 aa  73.2  0.000000000005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.104433  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1355  hypothetical protein  24.76 
 
 
390 aa  72.8  0.000000000007  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4483  Mammalian cell entry related domain protein  26.87 
 
 
297 aa  71.6  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5555  ABC transporter periplasmic-binding protein  25.52 
 
 
292 aa  72  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.99193  normal  0.689785 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5748  ABC transporter substrate-binding protein  25.24 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.588091  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1454  hypothetical protein  26.39 
 
 
289 aa  71.6  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0474733  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4041  hypothetical protein  24.32 
 
 
367 aa  71.2  0.00000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.474065  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1923  hypothetical protein  24.64 
 
 
369 aa  71.2  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.743497  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1375  hypothetical protein  23.79 
 
 
390 aa  70.5  0.00000000003  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0922  hypothetical protein  24.9 
 
 
321 aa  70.9  0.00000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1021  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein, putative  25.14 
 
 
331 aa  70.1  0.00000000004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0988  putative ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  25.14 
 
 
331 aa  70.5  0.00000000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0232  hypothetical protein  23.23 
 
 
310 aa  70.1  0.00000000005  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04760  MCE domain protein  23.78 
 
 
312 aa  69.3  0.00000000008  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.321932  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0367  hypothetical protein  21.86 
 
 
320 aa  67.8  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1156  Mammalian cell entry related domain protein  24.48 
 
 
313 aa  67  0.0000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1629  hypothetical protein  25.11 
 
 
291 aa  67  0.0000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.232196 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1195  hypothetical protein  25.41 
 
 
312 aa  67  0.0000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0184  hypothetical protein  25.34 
 
 
310 aa  67  0.0000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.683235  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1638  hypothetical protein  24.89 
 
 
317 aa  66.6  0.0000000005  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0308  hypothetical protein  23.88 
 
 
326 aa  65.9  0.0000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4715  Mammalian cell entry related domain protein  23.41 
 
 
398 aa  64.7  0.000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.324726  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0297  Mammalian cell entry related domain protein  23.08 
 
 
323 aa  64.3  0.000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.525082  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1526  hypothetical protein  22.94 
 
 
300 aa  63.9  0.000000003  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0265226  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3498  hypothetical protein  26.09 
 
 
378 aa  62.4  0.000000009  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.252503 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0853  Mammalian cell entry related domain protein  20 
 
 
360 aa  62  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.547444  normal  0.0740756 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1203  hypothetical protein  22.74 
 
 
310 aa  62  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.511791  normal  0.098201 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0819  Mammalian cell entry related domain protein  21.3 
 
 
360 aa  61.2  0.00000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.940856  normal  0.371377 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0376  Mammalian cell entry related domain protein  25.61 
 
 
295 aa  61.6  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.202968  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2744  hypothetical protein  25.91 
 
 
315 aa  61.2  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0811657 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0170  Mammalian cell entry related domain protein  21.45 
 
 
322 aa  60.5  0.00000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4935  hypothetical protein  22.71 
 
 
359 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.704687  normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0838  virulence factor Mce family protein  26.5 
 
 
523 aa  60.1  0.00000005  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0172  Mce family protein  23.95 
 
 
304 aa  59.7  0.00000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0246  Mammalian cell entry related domain protein  22.92 
 
 
325 aa  59.7  0.00000006  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2843  hypothetical protein  22.08 
 
 
319 aa  59.7  0.00000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0893  hypothetical protein  19.62 
 
 
360 aa  59.7  0.00000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.932259  normal  0.840241 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0315  signal peptide protein  20.12 
 
 
330 aa  58.9  0.0000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0252  hypothetical protein  22.92 
 
 
325 aa  58.9  0.0000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.0686058 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2109  hypothetical protein  22.49 
 
 
331 aa  58.5  0.0000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4963  Mammalian cell entry related domain protein  22.83 
 
 
359 aa  58.2  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2275  Mammalian cell entry related domain protein  20.17 
 
 
305 aa  57.4  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0177  Mammalian cell entry related domain protein  21.45 
 
 
322 aa  57  0.0000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2948  hypothetical protein  22.01 
 
 
310 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1841  hypothetical protein  21.9 
 
 
313 aa  55.5  0.000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0405  hypothetical protein  26.23 
 
 
309 aa  55.5  0.000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0144565 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2810  hypothetical protein  22.01 
 
 
311 aa  55.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.177575 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0614  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.399104  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0230  ABC transporter, periplasmic substrate-binding protein  21 
 
 
309 aa  55.1  0.000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>