More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1432 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1432  queuine tRNA-ribosyltransferase  100 
 
 		 388 aa  810    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0681966  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0093  queuine tRNA-ribosyltransferase  81.7 
 
 		 376 aa  674    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0899534  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1172  queuine tRNA-ribosyltransferase  76.56 
 
 		 372 aa  624  1e-178  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0980  queuine tRNA-ribosyltransferase  75.98 
 
 		 374 aa  616  1e-175  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0584  queuine tRNA-ribosyltransferase  71.61 
 
 		 373 aa  587  1e-166  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.0414152  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1028  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.97 
 
 		 373 aa  558  1e-158  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1090  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.71 
 
 		 373 aa  556  1e-157  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.50041  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1267  queuine tRNA-ribosyltransferase  68.67 
 
 		 373 aa  552  1e-156  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0779  queuine tRNA-ribosyltransferase  69.45 
 
 		 373 aa  553  1e-156  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.113002  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  61.1 
 
 		 372 aa  496  1e-139  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1259  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.62 
 
 		 379 aa  393  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.527316  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2619  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 373 aa  382  1e-105  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1457  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.44 
 
 		 375 aa  382  1e-105  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000844701  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0565  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.9 
 
 		 373 aa  380  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.005662  normal  0.744875 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0521  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.32 
 
 		 371 aa  375  1e-103  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0852  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.09 
 
 		 370 aa  373  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1716  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.31 
 
 		 371 aa  369  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.2965  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2435  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.45 
 
 		 372 aa  370  1e-101  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1782  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.06 
 
 		 372 aa  367  1e-100  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00114635 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2844  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.47 
 
 		 377 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2026  queuine tRNA-ribosyltransferase  51.07 
 
 		 407 aa  367  1e-100  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0579  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.74 
 
 		 370 aa  366  1e-100  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.350695  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1694  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 		 373 aa  363  3e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.556038 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2757  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.87 
 
 		 386 aa  363  3e-99  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.717518 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1800  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.7 
 
 		 374 aa  360  2e-98  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1894  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.84 
 
 		 355 aa  359  4e-98  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  1.3829100000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2011  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.09 
 
 		 380 aa  358  7e-98  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.638578  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0530  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 		 373 aa  358  8e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00176978  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0907  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 		 372 aa  356  2.9999999999999997e-97  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2109  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 		 379 aa  356  3.9999999999999996e-97  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2243  queuine tRNA-ribosyltransferase  50.92 
 
 		 375 aa  355  6.999999999999999e-97  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.982522 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3278  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.77 
 
 		 369 aa  353  2e-96  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.275264  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0632  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.4 
 
 		 392 aa  351  1e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5071  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 399 aa  350  2e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.906893  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12290  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.88 
 
 		 373 aa  350  3e-95  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000356741  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0958  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.27 
 
 		 374 aa  349  5e-95  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0452051  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1717  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.647195 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2059  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 		 371 aa  348  7e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0931  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.91 
 
 		 394 aa  348  8e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2808  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 		 376 aa  347  1e-94  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.634866  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2944  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.89 
 
 		 376 aa  347  1e-94  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.765199 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0218  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.31 
 
 		 376 aa  348  1e-94  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.989201  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2664  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.89 
 
 		 399 aa  347  2e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.241217 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2525  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.93 
 
 		 400 aa  347  2e-94  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0710  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 376 aa  347  3e-94  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0637  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 395 aa  346  4e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1305  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.52 
 
 		 371 aa  346  4e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0514  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.4 
 
 		 370 aa  345  8e-94  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2387  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1165  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.179436  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0303  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2573  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 397 aa  344  1e-93  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3143  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.53 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2429  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.43 
 
 		 367 aa  344  2e-93  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0320  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.61 
 
 		 387 aa  344  2e-93  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0464887 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_52  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.89 
 
 		 392 aa  343  2e-93  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000223938  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1703  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.8 
 
 		 383 aa  344  2e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.108277  normal  0.62465 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4479  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.02 
 
 		 390 aa  344  2e-93  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0710937 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3328  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 397 aa  344  2e-93  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.162119  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2182  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.79 
 
 		 374 aa  343  2.9999999999999997e-93  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3870  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.53 
 
 		 390 aa  343  2.9999999999999997e-93  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.41663  normal  0.550256 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3810  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.63 
 
 		 395 aa  342  4e-93  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1278  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 		 394 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0690  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.265074  normal  0.561084 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0238  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 447 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0722  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 395 aa  343  4e-93  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3361  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 		 472 aa  343  4e-93  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0872044  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1524  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.8 
 
 		 383 aa  342  5e-93  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.000558338  normal  0.0203734 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3371  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 		 397 aa  342  5e-93  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1359  queuine tRNA-ribosyltransferase  48.03 
 
 		 372 aa  342  5.999999999999999e-93  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.000569759  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3990  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 		 396 aa  342  5.999999999999999e-93  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.259551 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.95 
 
 		 385 aa  342  7e-93  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.38532  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0052  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.62 
 
 		 392 aa  342  9e-93  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2518  queuine tRNA-ribosyltransferase  43.49 
 
 		 380 aa  342  9e-93  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00624233  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1120  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.24 
 
 		 369 aa  341  1e-92  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0231453  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6918  queuine tRNA-ribosyltransferase  47.23 
 
 		 376 aa  341  1e-92  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.625358  normal  0.464203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0612  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.37 
 
 		 395 aa  341  1e-92  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.895388  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2068  Queuine tRNA-ribosyltransferase  46.61 
 
 		 371 aa  340  2e-92  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0049  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.47 
 
 		 392 aa  340  2e-92  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0707792  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3407  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.11 
 
 		 370 aa  340  2e-92  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.38542  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0549  queuine tRNA-ribosyltransferase  44.14 
 
 		 390 aa  341  2e-92  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2398  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.67 
 
 		 368 aa  340  2e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000165402  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1194  queuine tRNA-ribosyltransferase  46.09 
 
 		 367 aa  340  2e-92  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0699  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.85 
 
 		 404 aa  340  2.9999999999999998e-92  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2394  queuine tRNA-ribosyltransferase  49.19 
 
 		 367 aa  340  2.9999999999999998e-92  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.311868  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1666  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.38 
 
 		 370 aa  340  4e-92  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.098612  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2075  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.85 
 
 		 367 aa  339  5e-92  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.698983  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1495  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.48 
 
 		 376 aa  339  5e-92  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.474706 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1175  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.67 
 
 		 368 aa  339  5.9999999999999996e-92  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0539668  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1321  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.15 
 
 		 391 aa  339  5.9999999999999996e-92  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1729  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.03 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.37523  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1696  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.03 
 
 		 379 aa  339  5.9999999999999996e-92  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00354  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.520405  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3203  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.372376  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0325  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00358  hypothetical protein  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.575633  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0476  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0486  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3227  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000187089 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0438  queuine tRNA-ribosyltransferase  45.62 
 
 		 375 aa  338  8e-92  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>