42 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1372 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1372  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  100 
 
 
480 aa  979    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0041  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  55.83 
 
 
460 aa  542  1e-153  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.294388  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1247  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  41.29 
 
 
437 aa  323  6e-87  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0824  endonuclease/exonuclease/phosphatase, putative  35.61 
 
 
431 aa  268  2e-70  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0502024  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1506  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.97 
 
 
310 aa  132  1.0000000000000001e-29  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0135963  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0711  endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.34 
 
 
334 aa  128  2.0000000000000002e-28  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1027  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
347 aa  108  2e-22  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0904827  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04510  hypothetical protein  27.39 
 
 
324 aa  79.7  0.0000000000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1180  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.76 
 
 
347 aa  76.3  0.000000000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.494829  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1119  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  29.5 
 
 
348 aa  72.4  0.00000000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1186  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  26.3 
 
 
342 aa  71.6  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.402884  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0605  hypothetical protein  23.62 
 
 
413 aa  70.5  0.00000000007  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.662935 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1021  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.48 
 
 
342 aa  68.2  0.0000000003  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0946  hypothetical protein  26.6 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2783  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.7 
 
 
313 aa  66.6  0.0000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0990816  normal  0.632411 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2587  endonuclease/exonuclease/phosphatase family protein  24.41 
 
 
339 aa  65.1  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.140684  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1196  hypothetical protein  25.88 
 
 
348 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1431  hypothetical protein  23.32 
 
 
331 aa  65.1  0.000000003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0201  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.4 
 
 
481 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.418254  normal  0.692055 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1102  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.17 
 
 
341 aa  61.6  0.00000003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1377  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.84 
 
 
325 aa  59.3  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0006  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25 
 
 
499 aa  55.5  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.113565  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0358  endonuclease/exonuclease/phosphatase  27.24 
 
 
826 aa  54.7  0.000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6766  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.81 
 
 
326 aa  53.5  0.000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1000  hypothetical protein  23.73 
 
 
1076 aa  52.8  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2774  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.22 
 
 
1641 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0508724  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01224  extracellular ribonuclease/nuclease fusion protein  24.72 
 
 
1346 aa  50.8  0.00005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0758  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.35 
 
 
818 aa  49.3  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0350969 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1518  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.85 
 
 
307 aa  48.1  0.0004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.010093  normal  0.0422931 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01770  predicted extracellular nuclease  25.71 
 
 
863 aa  47.8  0.0005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.609758  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1361  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.95 
 
 
573 aa  47.4  0.0006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153605  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1220  hypothetical protein  23.65 
 
 
363 aa  47  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.133242  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1364  endonuclease/exonuclease/phosphatase  25.49 
 
 
345 aa  47  0.0008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4989  putative endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.03 
 
 
848 aa  46.2  0.001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.170324  normal  0.316341 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3704  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.73 
 
 
322 aa  46.2  0.001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2272  endonuclease/exonuclease/phosphatase  20.72 
 
 
942 aa  45.4  0.002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000211243  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0398  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  23.37 
 
 
1073 aa  45.8  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5836  Endonuclease/exonuclease/phosphatase  24.11 
 
 
592 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02630  hypothetical protein  21.36 
 
 
359 aa  44.3  0.004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.249483  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1911  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.88 
 
 
940 aa  44.3  0.005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000962851  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2170  endonuclease/exonuclease/phosphatase  22.43 
 
 
945 aa  44.3  0.005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.160261 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0303  endonuclease/exonuclease/phosphatase  21.34 
 
 
249 aa  43.9  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.401875  normal  0.151363 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>