More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1323 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1323  nickel transporter permease NikC  100 
 
 		 277 aa  553  1e-156  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.00536272  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7616  nickel transporter permease NikC  54.14 
 
 		 291 aa  303  3.0000000000000004e-81  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0802  nickel transporter permease NikC  54.1 
 
 		 290 aa  299  3e-80  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0752  nickel transporter permease NikC  53.36 
 
 		 290 aa  295  7e-79  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3843  nickel transporter permease NikC  55.51 
 
 		 277 aa  279  4e-74  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4818  nickel transporter permease NikC  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03327  nickel transporter subunit  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0237  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3762  nickel transporter permease NikC  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3962  nickel transporter permease NikC  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0238  nickel transporter permease NikC  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03280  hypothetical protein  55.08 
 
 		 277 aa  278  8e-74  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2400  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50.58 
 
 		 373 aa  277  1e-73  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3677  nickel transporter permease NikC  55.08 
 
 		 277 aa  275  4e-73  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2275  nickel transporter permease NikC  55.47 
 
 		 299 aa  271  1e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0126063  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1836  nickel transporter permease NikC  52.47 
 
 		 277 aa  268  8e-71  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00660391 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1030  nickel transporter permease NikC  47.95 
 
 		 270 aa  263  3e-69  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.503674  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3007  nickel transporter permease NikC  54.13 
 
 		 281 aa  259  4e-68  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0763396  normal  0.524853 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6074  nickel transporter permease NikC  50 
 
 		 283 aa  258  8e-68  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3344  nickel transporter permease NikC  53.25 
 
 		 281 aa  243  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0349  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  42.02 
 
 		 283 aa  241  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0370  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  44.36 
 
 		 284 aa  236  3e-61  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0387  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  44.63 
 
 		 309 aa  228  9e-59  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1282  oligopeptide ABC transporter, permease protein  41.8 
 
 		 300 aa  214  9.999999999999999e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.284613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0022  nickel ABC transporter, permease subunit NikC  43.36 
 
 		 273 aa  207  1e-52  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00108936  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4391  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  41.54 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4232  oligopeptide transport system, permease  41.54 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4244  oligopeptide ABC transporter, permease  41.54 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4609  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  41.54 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4731  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  41.54 
 
 		 299 aa  206  3e-52  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0275  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.06 
 
 		 283 aa  206  3e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.609618  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0539  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.28 
 
 		 330 aa  205  8e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.540099 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3674  oligopeptide ABC transporter, permease  36.94 
 
 		 279 aa  204  2e-51  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0467802 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3739  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.22 
 
 		 300 aa  202  4e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.146994  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0448  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.18 
 
 		 287 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.144364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0391  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.96 
 
 		 295 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2030  ABC transporter, permease protein  38.08 
 
 		 300 aa  199  3.9999999999999996e-50  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0884139  normal  0.749678 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0036  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.6 
 
 		 305 aa  199  3.9999999999999996e-50  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0186771  normal  0.317689 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1485  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.98 
 
 		 274 aa  199  5e-50  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0146821  normal  0.125484 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2452  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.34 
 
 		 296 aa  198  7e-50  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0368392  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0628  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.22 
 
 		 294 aa  197  1.0000000000000001e-49  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.881682  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3250  dipeptide ABC transporter, permease protein DppC, putative  40.16 
 
 		 301 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.193894  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0860  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.27 
 
 		 287 aa  196  2.0000000000000003e-49  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.000000642732  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0455  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.91 
 
 		 309 aa  196  3e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2035  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.53 
 
 		 277 aa  196  4.0000000000000005e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0470  nickel ABC transporter, permease protein  37.71 
 
 		 290 aa  195  5.000000000000001e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2422  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.8 
 
 		 311 aa  195  6e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1354  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.15 
 
 		 299 aa  194  1e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0643  oligopeptide ABC transporter, permease protein  39.75 
 
 		 292 aa  194  2e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2349  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  37.31 
 
 		 295 aa  194  2e-48  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1253  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 		 305 aa  194  2e-48  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.95778  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1592  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.06 
 
 		 280 aa  193  2e-48  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.961775 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2947  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.84 
 
 		 300 aa  192  4e-48  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  0.0430362 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01443  D-ala-D-ala transporter subunit  36.36 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.45304  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2162  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.36 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00686598  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1674  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  36.36 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01455  hypothetical protein  36.36 
 
 		 298 aa  192  5e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.47297  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0481  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.85 
 
 		 299 aa  192  5e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00209608  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2172  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  36.36 
 
 		 298 aa  192  7e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1250  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  41.08 
 
 		 301 aa  192  7e-48  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.70134 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1222  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.53 
 
 		 310 aa  192  7e-48  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  0.0299978 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5351  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.9 
 
 		 317 aa  191  8e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2370  peptide ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 292 aa  191  9e-48  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1516  peptide ABC transporter, permease protein  39.53 
 
 		 255 aa  191  1e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0599605  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2407  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.21 
 
 		 309 aa  191  1e-47  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1688  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  35.97 
 
 		 298 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.175944  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2788  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.8 
 
 		 310 aa  191  1e-47  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2642  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.78 
 
 		 280 aa  190  2e-47  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1395  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  36.7 
 
 		 288 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.064701  decreased coverage  0.00784209 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1570  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  35.97 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2097  ATP-dependent peptide transporter membrane subunit  36.36 
 
 		 298 aa  190  2e-47  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3971  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.13 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3233  ABC peptide transporter, inner membrane subunit  37.13 
 
 		 300 aa  189  2.9999999999999997e-47  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3965  hypothetical protein  36.76 
 
 		 300 aa  189  5e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.16334 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2358  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.68 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  decreased coverage  0.0041111  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0718  hypothetical protein  38.11 
 
 		 282 aa  189  5e-47  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.661918 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2704  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.55 
 
 		 301 aa  188  7e-47  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2541  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000169093  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3991  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.59 
 
 		 300 aa  188  8e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.368526  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2492  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.26 
 
 		 289 aa  188  8e-47  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.696968  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3090  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.43 
 
 		 310 aa  188  9e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2324  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.8 
 
 		 319 aa  187  1e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.98941 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5440  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.93 
 
 		 310 aa  187  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00362913 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1435  peptide ABC transporter, permease protein  38.59 
 
 		 282 aa  187  2e-46  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.557175  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1236  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  39.59 
 
 		 284 aa  187  2e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.143707  normal  0.209567 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0144  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 298 aa  187  2e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0407535  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2716  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.58 
 
 		 301 aa  187  2e-46  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2530  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.83 
 
 		 286 aa  186  3e-46  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0801  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  41.73 
 
 		 296 aa  186  4e-46  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.232197  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3831  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.82 
 
 		 308 aa  186  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.810845 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7518  ABC transporter membrane spanning protein (dipeptide)  36.26 
 
 		 295 aa  186  5e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.0791708  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0137  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 300 aa  185  6e-46  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1443  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.56 
 
 		 277 aa  185  7e-46  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.486684  normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0510  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.77 
 
 		 270 aa  185  8e-46  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1382  transmembrane ABC transporter protein  39.22 
 
 		 299 aa  184  1.0000000000000001e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.131281  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0215  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.02 
 
 		 298 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0103943  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2759  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.92 
 
 		 285 aa  183  2.0000000000000003e-45  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.49636  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2914  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.29 
 
 		 289 aa  183  2.0000000000000003e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3128  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40 
 
 		 301 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.265268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2052  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.61 
 
 		 280 aa  183  2.0000000000000003e-45  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>