45 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1289 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1289  CRISPR-associated protein Cas4  100 
 
 		 165 aa  344  4e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1423  CRISPR-associated protein Cas4  80 
 
 		 166 aa  280  6.000000000000001e-75  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.283584  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0941  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.25 
 
 		 163 aa  102  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.654919  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2298  CRISPR-associated Cas4 family protein  36.26 
 
 		 170 aa  98.6  4e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2660  CRISPR-associated protein Cas4  36.25 
 
 		 185 aa  95.1  4e-19  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4287  CRISPR-associated protein Cas4  35.15 
 
 		 169 aa  94  7e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3001  CRISPR-associated protein Cas4  33.33 
 
 		 162 aa  89.7  1e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0454064  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0309  CRISPR-associated protein Cas4  32.32 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2318  CRISPR-associated Cas4 family protein  33.74 
 
 		 165 aa  90.1  1e-17  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0664  CRISPR-associated protein Cas4  37.95 
 
 		 161 aa  89.7  2e-17  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.0807388  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1187  CRISPR-associated protein Cas4  34.15 
 
 		 169 aa  88.2  4e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0540  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.92 
 
 		 168 aa  88.6  4e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2517  hypothetical protein  33.74 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0349  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.82 
 
 		 158 aa  87.8  7e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.177576  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2429  CRISPR-associated protein Cas4  26.22 
 
 		 165 aa  87  1e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0902  CRISPR-associated protein Cas4  33.53 
 
 		 163 aa  84.7  5e-16  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.057649  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3932  CRISPR-associated protein Cas4  33.73 
 
 		 169 aa  81.6  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2023  CRISPR-associated Cas4 family protein  32.72 
 
 		 165 aa  80.9  0.000000000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.84369  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0266  CRISPR-associated exonuclease Cas4 family protein  27.78 
 
 		 162 aa  80.5  0.000000000000009  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1020  CRISPR-associated protein Cas4  33.74 
 
 		 161 aa  80.1  0.00000000000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0000334057  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1804  RecB family exonuclease  33.33 
 
 		 162 aa  78.2  0.00000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0914  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.07 
 
 		 173 aa  72.4  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0131013  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0302  hypothetical protein  31.87 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000006  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00784243  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0620  CRISPR-associated protein Cas4  36.2 
 
 		 168 aa  70.5  0.000000000009  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0126  CRISPR-associated protein Cas4  31.25 
 
 		 171 aa  69.3  0.00000000002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1812  CRISPR-associated Cas4 family protein  26.04 
 
 		 178 aa  68.9  0.00000000003  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.233304  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1638  CRISPR-associated protein Cas4  28 
 
 		 180 aa  68.2  0.00000000005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.270939  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1083  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.9 
 
 		 172 aa  67.8  0.00000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0976  CRISPR-associated protein Cas4  25.44 
 
 		 177 aa  67.8  0.00000000006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2004  CRISPR-associated protein Cas4  29.19 
 
 		 165 aa  66.2  0.0000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2837  CRISPR-associated protein Cas4  25.29 
 
 		 186 aa  65.5  0.0000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.679978  normal  1 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3328  CRISPR-associated protein Cas4  28.4 
 
 		 189 aa  65.1  0.0000000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1728  CRISPR-associated Cas4 family protein  30.67 
 
 		 177 aa  65.1  0.0000000005  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.855022 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0672  CRISPR-associated protein Cas4  28.99 
 
 		 169 aa  64.7  0.0000000006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0395  CRISPR-associated protein Cas4  35.88 
 
 		 127 aa  64.7  0.0000000006  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0424779  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0936  CRISPR-associated protein Cas4  26.06 
 
 		 169 aa  60.8  0.000000008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1126  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.66 
 
 		 199 aa  59.3  0.00000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00956788  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0918  CRISPR-associated protein Cas4  28.83 
 
 		 162 aa  58.2  0.00000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000176613 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1022  CRISPR-associated Cas4 family protein  29.01 
 
 		 159 aa  58.2  0.00000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1000  hypothetical protein  23.93 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000006  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0447  CRISPR-associated protein Cas4  31.14 
 
 		 166 aa  51.2  0.000007  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1229  CRISPR-associated protein Cas4  29.09 
 
 		 167 aa  50.4  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1450  CRISPR-associated protein Cas4  27.44 
 
 		 192 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1878  CRISPR-associated Cas4 family protein  24.85 
 
 		 170 aa  48.5  0.00004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2015  CRISPR-associated Cas4 family protein  28.74 
 
 		 170 aa  42.4  0.003  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>