147 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1287 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1287  CRISPR-associated protein Cas1  100 
 
 
332 aa  692    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0188131  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1425  CRISPR-associated protein Cas1  83.99 
 
 
332 aa  594  1e-169  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00327845  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0348  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.63 
 
 
331 aa  209  5e-53  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.203751  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2317  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.12 
 
 
330 aa  203  4e-51  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0673  CRISPR-associated protein Cas1  36.39 
 
 
326 aa  199  6e-50  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2659  CRISPR-associated protein Cas1  35.03 
 
 
330 aa  197  3e-49  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0541  CRISPR-associated Cas1 family protein  35.52 
 
 
330 aa  192  5e-48  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1230  CRISPR-associated protein Cas1  34.33 
 
 
330 aa  191  1e-47  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0257  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.82 
 
 
331 aa  189  4e-47  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2297  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.43 
 
 
330 aa  189  5e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.150876  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4286  CRISPR-associated protein Cas1  34.5 
 
 
330 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0310  CRISPR-associated protein Cas1  32.93 
 
 
333 aa  187  3e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.753182  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0668  CRISPR-associated protein Cas1  31.85 
 
 
331 aa  186  3e-46  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.504883  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1811  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.65 
 
 
331 aa  186  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0537215  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3931  CRISPR-associated protein Cas1  33.13 
 
 
331 aa  186  4e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0942  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.94 
 
 
330 aa  184  1.0000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0619  CRISPR-associated protein Cas1  33.93 
 
 
331 aa  184  1.0000000000000001e-45  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1651  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.63 
 
 
328 aa  184  2.0000000000000003e-45  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.730832  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1387  CRISPR-associated Cas1 family protein  34.64 
 
 
329 aa  184  2.0000000000000003e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0919  CRISPR-associated protein Cas1  33.14 
 
 
330 aa  183  4.0000000000000006e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000247044 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1188  CRISPR-associated protein Cas1  32.44 
 
 
333 aa  182  5.0000000000000004e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1877  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.14 
 
 
333 aa  181  2e-44  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2430  CRISPR-associated protein Cas1  32.73 
 
 
330 aa  179  8e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1727  CRISPR-associated Cas1 family protein  33.13 
 
 
321 aa  177  2e-43  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.914147 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0445  CRISPR-associated protein Cas1  34.97 
 
 
384 aa  176  5e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1082  CRISPR-associated Cas1 family protein  31.14 
 
 
327 aa  172  1e-41  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2516  hypothetical protein  33.43 
 
 
330 aa  171  2e-41  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1127  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.38 
 
 
333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.168006  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3327  CRISPR-associated protein Cas1  29.48 
 
 
331 aa  164  2.0000000000000002e-39  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1630  CRISPR-associated protein Cas1  29.72 
 
 
360 aa  164  3e-39  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.010071  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0127  CRISPR-associated protein Cas1  32.07 
 
 
326 aa  163  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1449  CRISPR-associated protein Cas1  30.77 
 
 
330 aa  160  3e-38  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2838  CRISPR-associated protein Cas1  29.22 
 
 
330 aa  156  5.0000000000000005e-37  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.150798  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2014  CRISPR-associated Cas1 family protein  30.61 
 
 
338 aa  156  6e-37  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1023  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.18 
 
 
319 aa  155  7e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1803  hypothetical protein  31.55 
 
 
333 aa  139  7.999999999999999e-32  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3506  hypothetical protein  27.73 
 
 
326 aa  136  5e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.902663  normal  0.59754 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0665  CRISPR-associated protein Cas1  30.91 
 
 
322 aa  133  5e-30  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.100069  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0303  hypothetical protein  30.42 
 
 
259 aa  125  1e-27  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00506761  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3000  CRISPR-associated protein Cas1  28.07 
 
 
335 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0143403  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0999  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.6 
 
 
326 aa  124  3e-27  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.614939  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1019  CRISPR-associated protein Cas1  26.52 
 
 
321 aa  122  7e-27  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.000325858  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1441  CRISPR-associated protein Cas1  25.98 
 
 
598 aa  119  7.999999999999999e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0376991  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0937  CRISPR-associated protein Cas1  24.7 
 
 
326 aa  119  9e-26  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0903  CRISPR-associated protein Cas1  27.57 
 
 
334 aa  116  3.9999999999999997e-25  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.019611  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2462  CRISPR-associated protein Cas1  23.97 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.634765 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1718  CRISPR-associated protein Cas1  25.17 
 
 
325 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.07332e-23 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31580  CRISPR-associated protein Cas1  26.32 
 
 
346 aa  109  7.000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02696  crispr-associated protein Cas1  25.63 
 
 
344 aa  107  3e-22  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.512018  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3524  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.74 
 
 
341 aa  103  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0521  CRISPR-associated protein Cas1  22.74 
 
 
325 aa  103  4e-21  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.000250956  hitchhiker  0.00000123897 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0504  CRISPR-associated protein Cas1  22.74 
 
 
325 aa  102  7e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1625  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.75 
 
 
544 aa  102  8e-21  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.575155  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1633  CRISPR-associated protein Cas1  25.63 
 
 
346 aa  99.8  6e-20  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.599733 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2974  CRISPR-associated protein Cas1  25.24 
 
 
545 aa  99  1e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0493  CRISPR-associated Cas1 family protein  27.11 
 
 
343 aa  98.2  2e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3119  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.41 
 
 
550 aa  97.4  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00000141365  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2433  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  26.78 
 
 
570 aa  97.8  3e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0199418  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1662  CRISPR-associated protein Cas1  27.01 
 
 
343 aa  96.3  7e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.250727  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0833  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.75 
 
 
344 aa  93.6  4e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0219387  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0606  CRISPR-associated Cas1 family protein  25 
 
 
338 aa  94  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.506127  normal  0.66678 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1559  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.1 
 
 
330 aa  93.2  6e-18  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.461244  n/a   
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3578  CRISPR-associated protein Cas1  27.05 
 
 
331 aa  93.2  6e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013502  Rmar_2913  CRISPR-associated protein Cas1  22.68 
 
 
553 aa  91.7  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0184071  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0852  CRISPR-associated Cas1 family protein  32.85 
 
 
344 aa  90.5  3e-17  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.749632  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1005  hypothetical protein  24.92 
 
 
343 aa  90.5  4e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0263326  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1300  hypothetical protein  24.32 
 
 
343 aa  89.4  8e-17  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.187161  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2234  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.21 
 
 
350 aa  88.2  2e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.982085  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1858  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.88 
 
 
347 aa  87.4  3e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.235229  normal  0.181235 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1431  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.32 
 
 
343 aa  87.8  3e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0863156  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2973  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.51 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1154  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.67 
 
 
343 aa  87.4  3e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0234  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.83 
 
 
342 aa  86.7  6e-16  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1936  hypothetical protein  33.09 
 
 
344 aa  85.5  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1974  CRISPR-associated protein Cas1  26.34 
 
 
343 aa  85.5  0.000000000000001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.522968  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1477  CRISPR-associated protein Cas1  24.26 
 
 
339 aa  85.5  0.000000000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.544523 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3371  hypothetical protein  22.79 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0480  hypothetical protein  29.46 
 
 
342 aa  84.3  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.843474  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4330  CRISPR-associated Cas1 family protein  29.37 
 
 
343 aa  85.1  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.000958951  normal  0.174892 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1984  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.56 
 
 
339 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.424178 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0057  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  25.95 
 
 
559 aa  84  0.000000000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1355  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.6 
 
 
350 aa  84  0.000000000000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.403808  normal 
 
 
-
 
NC_011738  PCC7424_5841  CRISPR-associated protein Cas1  23.86 
 
 
334 aa  83.6  0.000000000000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2054  CRISPR-associated Cas1 family protein  24.04 
 
 
731 aa  83.2  0.000000000000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0651  CRISPR-associated Cas1 family protein  26.15 
 
 
344 aa  83.2  0.000000000000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.280265  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1072  hypothetical protein  24.43 
 
 
344 aa  82.4  0.000000000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0131411 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2188  CRISPR-associated protein Cas1  23.15 
 
 
343 aa  82  0.00000000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0573  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.89 
 
 
398 aa  80.5  0.00000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00904377  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4852  CRISPR-associated protein Cas1  22.06 
 
 
594 aa  80.9  0.00000000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.464981  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3646  CRISPR-associated protein Cas1  23.15 
 
 
343 aa  80.1  0.00000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0179  CRISPR-associated Cas1/Cas4 family protein  24.51 
 
 
580 aa  79.3  0.00000000000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0819  CRISPR-associated protein Cas1  33.86 
 
 
344 aa  79  0.0000000000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.606535  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4176  hypothetical protein  24.53 
 
 
333 aa  77.8  0.0000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000217029 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2651  CRISPR-associated protein Cas1  31.88 
 
 
346 aa  78.2  0.0000000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  hitchhiker  0.000206162  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3907  CRISPR-associated Cas1 family protein  28.28 
 
 
342 aa  77  0.0000000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.63849  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0560  CRISPR-associated Cas1 family protein  23.65 
 
 
402 aa  75.1  0.000000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00182957  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2386  CRISPR-associated Cas1 family protein  22.65 
 
 
333 aa  75.9  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2483  CRISPR-associated Cas1 family protein  25.31 
 
 
339 aa  75.1  0.000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0190242  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1482  CRISPR-associated protein Cas1  28.11 
 
 
343 aa  75.1  0.000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5340  CRISPR-associated protein Cas1  23.51 
 
 
329 aa  74.7  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.52671 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>