More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1187 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1187  shikimate kinase  100 
 
 		 174 aa  344  3e-94  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0776  shikimate kinase  82.04 
 
 		 173 aa  278  3e-74  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1340  shikimate kinase  67.66 
 
 		 177 aa  216  2e-55  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1754  Shikimate kinase  57.74 
 
 		 184 aa  194  6e-49  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0052  shikimate kinase  58.02 
 
 		 170 aa  188  2.9999999999999997e-47  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0535  shikimate kinase  47.06 
 
 		 165 aa  148  4e-35  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0495  shikimate kinase  53.09 
 
 		 171 aa  144  6e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0410  shikimate kinase  48.5 
 
 		 165 aa  144  7.0000000000000006e-34  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1571  shikimate kinase  48.45 
 
 		 165 aa  142  2e-33  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0436  shikimate kinase  47.9 
 
 		 165 aa  142  3e-33  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0528  Shikimate kinase  40.46 
 
 		 166 aa  115  3e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.276227  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2532  shikimate kinase  39.53 
 
 		 173 aa  112  3e-24  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.884272  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1819  shikimate kinase  38.51 
 
 		 169 aa  98.2  5e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5079  shikimate kinase  33.33 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4952  shikimate kinase  33.33 
 
 		 172 aa  96.7  1e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0994  shikimate kinase I  38.86 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0963  shikimate kinase I  38.86 
 
 		 175 aa  95.5  3e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1476  shikimate kinase  35.03 
 
 		 198 aa  95.9  3e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0207  shikimate kinase  36.59 
 
 		 183 aa  95.9  3e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.807253  normal  0.16478 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0528  shikimate kinase  38.73 
 
 		 168 aa  95.9  3e-19  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.361692  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5127  shikimate kinase  34.3 
 
 		 172 aa  95.1  4e-19  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0408  shikimate kinase  34.48 
 
 		 172 aa  95.5  4e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0652  shikimate kinase  33.15 
 
 		 195 aa  94.7  6e-19  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_06110  Shikimate kinase  38.1 
 
 		 171 aa  94.4  8e-19  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5776  shikimate kinase  34.29 
 
 		 172 aa  94  9e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01791  shikimate kinase  34.66 
 
 		 198 aa  94  9e-19  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0539701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1297  shikimate 5-dehydrogenase  34.32 
 
 		 458 aa  92.8  2e-18  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0053  shikimate kinase  37.36 
 
 		 172 aa  93.2  2e-18  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.541651  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0410  shikimate kinase  32.76 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0407495  normal  0.100791 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2925  shikimate kinase  32.56 
 
 		 179 aa  92.8  2e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0441  shikimate kinase  35.2 
 
 		 176 aa  92.8  2e-18  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.567872  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_66610  shikimate kinase  33.91 
 
 		 172 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2022  shikimate kinase  40 
 
 		 192 aa  92  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0354  shikimate kinase., 3-dehydroquinate synthase  36 
 
 		 593 aa  92.4  3e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1457  Shikimate kinase  36.57 
 
 		 172 aa  92.4  3e-18  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2970  shikimate kinase  32.18 
 
 		 190 aa  91.7  4e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45250  shikimate kinase  31.79 
 
 		 172 aa  92  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3534  Shikimate kinase  37.87 
 
 		 207 aa  91.7  5e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1002  shikimate kinase  34.55 
 
 		 183 aa  91.3  6e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1517  shikimate kinase  36.53 
 
 		 171 aa  91.3  7e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_407  shikimate kinase  35.2 
 
 		 176 aa  91.3  7e-18  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0678  shikimate kinase  31.79 
 
 		 182 aa  90.9  8e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.211914 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_2137  shikimate kinase  34.88 
 
 		 174 aa  90.9  9e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.628527  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1199  bifunctional shikimate kinase/3-dehydroquinate synthase  38.1 
 
 		 495 aa  90.5  1e-17  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.539853  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0613  shikimate kinase  31.79 
 
 		 180 aa  90.5  1e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0547  shikimate kinase  33.73 
 
 		 163 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1840  Shikimate kinase  32.77 
 
 		 188 aa  89.4  2e-17  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0636308  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3130  shikimate kinase  31.28 
 
 		 192 aa  89  3e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2686  shikimate kinase  34.1 
 
 		 169 aa  89  3e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.536815  normal  0.0662498 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2097  shikimate kinase  31.67 
 
 		 179 aa  89.4  3e-17  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1556  shikimate kinase  35.43 
 
 		 173 aa  88.6  4e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.367363 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0387  shikimate kinase  32.93 
 
 		 163 aa  88.2  5e-17  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.458969  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1030  shikimate 5-dehydrogenase  36.53 
 
 		 454 aa  88.2  6e-17  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5129  shikimate kinase  32.93 
 
 		 163 aa  87.8  7e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.206005  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0124  shikimate kinase  31.67 
 
 		 179 aa  87.4  8e-17  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.529652  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4313  shikimate kinase  35.67 
 
 		 170 aa  87.4  9e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2549  Shikimate kinase  30 
 
 		 189 aa  87.4  9e-17  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06600  shikimate kinase  29.76 
 
 		 188 aa  87  1e-16  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0215  shikimate kinase  32.76 
 
 		 172 aa  87  1e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.365544  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3029  Shikimate kinase  33.14 
 
 		 190 aa  87.4  1e-16  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.194702  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1718  shikimate kinase  32.57 
 
 		 208 aa  87  1e-16  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.825758  normal  0.851225 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4020  shikimate kinase  30.22 
 
 		 181 aa  86.7  1e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.263055  normal  0.623088 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4089  shikimate kinase  35.33 
 
 		 165 aa  86.7  2e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0882  Shikimate kinase  31.25 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.314525  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0734  shikimate kinase  31.25 
 
 		 179 aa  86.3  2e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0505  shikimate kinase  33.52 
 
 		 200 aa  85.9  2e-16  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2026  shikimate kinase  36.21 
 
 		 175 aa  85.9  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0839  shikimate kinase  31.21 
 
 		 176 aa  85.9  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.657447  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0977  shikimate kinase  32.57 
 
 		 168 aa  85.9  3e-16  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.937224  normal  0.13223 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1529  shikimate kinase  31.07 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.140024  normal  0.642585 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0786  shikimate kinase  31.4 
 
 		 174 aa  85.1  4e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.549744  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0294  shikimate kinase  33.14 
 
 		 204 aa  85.5  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.638845 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1804  Shikimate kinase  32.94 
 
 		 172 aa  85.1  4e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0311  shikimate kinase  32.02 
 
 		 184 aa  85.1  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0464  shikimate kinase  35.26 
 
 		 176 aa  85.1  5e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4366  shikimate kinase  33.94 
 
 		 165 aa  85.1  5e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0532  shikimate kinase  31.58 
 
 		 206 aa  85.1  5e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.398364 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2488  shikimate kinase  30.54 
 
 		 168 aa  84.7  5e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.995704 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0330  shikimate kinase  33.91 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.15338  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2901  shikimate kinase  33.73 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.12691 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3248  shikimate kinase  33.13 
 
 		 179 aa  84.7  6e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3267  shikimate kinase  31.79 
 
 		 229 aa  84.7  6e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2661  Shikimate kinase  33.33 
 
 		 170 aa  84.7  6e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000463113 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1639  shikimate kinase  31.76 
 
 		 187 aa  84.7  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.00313687  normal  0.0402231 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1020  shikimate kinase  37.71 
 
 		 177 aa  84.3  8e-16  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1942  Shikimate kinase  35.26 
 
 		 167 aa  84.3  8e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.195968  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0089  shikimate kinase  36.75 
 
 		 161 aa  84.3  9e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.506122  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3729  shikimate kinase  30.9 
 
 		 184 aa  84  9e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.427035  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3024  shikimate kinase  30.9 
 
 		 199 aa  84  9e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0359  shikimate kinase  30.34 
 
 		 183 aa  84.3  9e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0471264 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3206  shikimate kinase  30.9 
 
 		 209 aa  84  9e-16  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.289523  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0893  shikimate kinase  34.73 
 
 		 165 aa  83.6  0.000000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3758  shikimate kinase  31.79 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.485321  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2747  shikimate kinase  31.79 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4117  shikimate kinase  30.34 
 
 		 182 aa  84  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.944295  hitchhiker  0.000000685723 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1757  shikimate kinase  31.79 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1721  Shikimate kinase  33.72 
 
 		 189 aa  83.6  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.547803  normal  0.0497898 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2797  shikimate kinase  31.79 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.135069  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0153  shikimate kinase  34.32 
 
 		 166 aa  83.6  0.000000000000001  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3700  shikimate kinase  31.79 
 
 		 177 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.049823  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>