More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1152 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1152  D-alanyl-alanine synthetase A  100 
 
 		 347 aa  696    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  decreased coverage  0.00719746  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0634  D-alanyl-alanine synthetase A  61.45 
 
 		 346 aa  432  1e-120  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  0.233428  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0808  D-alanyl-alanine synthetase A  64.53 
 
 		 345 aa  428  1e-119  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.441448  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0572  D-alanyl-alanine synthetase A  58.02 
 
 		 342 aa  423  1e-117  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.140397  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0889  D-alanyl-alanine synthetase A  58.26 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1212  D-alanyl-alanine synthetase A  58.26 
 
 		 346 aa  406  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0819  D-alanyl-alanine synthetase A  58.26 
 
 		 346 aa  407  1.0000000000000001e-112  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.966668  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1050  D-alanine/D-alanine ligase  54.2 
 
 		 344 aa  375  1e-103  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1208  D-alanyl-alanine synthetase A  56.07 
 
 		 345 aa  370  1e-101  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1090  D-alanine/D-alanine ligase  29.25 
 
 		 353 aa  126  7e-28  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0486  D-alanine--D-alanine ligase  32.84 
 
 		 361 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00328  D-alanylalanine synthetase  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3227  D-alanine/D-alanine ligase  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0410  D-alanyl-alanine synthetase A  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0447  D-alanyl-alanine synthetase A  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3251  D-alanyl-alanine synthetase A  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.10036 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0453  D-alanyl-alanine synthetase A  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0406  D-alanyl-alanine synthetase A  28.26 
 
 		 364 aa  124  2e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1938  D-alanyl-alanine synthetase A  31.55 
 
 		 376 aa  125  2e-27  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00320777  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4918  D-alanine--D-alanine ligase  31.48 
 
 		 439 aa  123  5e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.592634  normal  0.181215 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1246  D-alanine--D-alanine ligase  30.62 
 
 		 408 aa  122  7e-27  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000908646 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0599  D-alanine--D-alanine ligase  28.32 
 
 		 369 aa  122  8e-27  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1480  D-alanyl-alanine synthetase A  30.65 
 
 		 360 aa  122  9e-27  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.351068 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0298  D-alanyl-alanine synthetase A  27.95 
 
 		 364 aa  121  9.999999999999999e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0036  D-alanine--D-alanine ligase  28.44 
 
 		 380 aa  120  3.9999999999999996e-26  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.069564  decreased coverage  0.00131086 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3243  D-alanine/D-alanine ligase  27.95 
 
 		 366 aa  120  4.9999999999999996e-26  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4217  D-alanyl-alanine synthetase A  28.41 
 
 		 366 aa  119  9e-26  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.494789 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4182  D-alanine--D-alanine ligase  30.82 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.512251  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3345  D-alanine/D-alanine ligase  26.71 
 
 		 366 aa  118  9.999999999999999e-26  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1662  D-alanyl-alanine synthetase A  31.03 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0422  D-alanyl-alanine synthetase A  27.02 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.947692  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0416  D-alanyl-alanine synthetase A  27.02 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.532787  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0434  D-alanyl-alanine synthetase A  27.02 
 
 		 364 aa  117  1.9999999999999998e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0552987  normal  0.545444 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3919  D-alanyl-alanine synthetase A  30.22 
 
 		 363 aa  117  3e-25  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.27971  normal  0.219568 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0173  D-alanyl-alanine synthetase A  27.13 
 
 		 364 aa  116  5e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5374  D-alanyl-alanine synthetase A  25.98 
 
 		 367 aa  116  6e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0896032 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0998  D-alanine/D-alanine ligase  27.37 
 
 		 414 aa  116  6.9999999999999995e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.268239  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3291  D-alanine--D-alanine ligase  28.88 
 
 		 373 aa  115  8.999999999999998e-25  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.304475  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2665  D-alanyl-alanine synthetase A  30.12 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2535  D-alanyl-alanine synthetase A  30.12 
 
 		 364 aa  114  2.0000000000000002e-24  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1367  D-alanine--D-alanine ligase  28.66 
 
 		 367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0476  D-alanyl-alanine synthetase A  26.4 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0415  D-alanyl-alanine synthetase A  26.4 
 
 		 364 aa  114  3e-24  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.335332  normal  0.0242928 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0283  D-alanyl-alanine synthetase A  27.17 
 
 		 376 aa  112  6e-24  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0108652  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0850  D-alanyl-alanine synthetase A  26.48 
 
 		 366 aa  112  9e-24  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.237365 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5356  D-alanine/D-alanine ligase  28.22 
 
 		 346 aa  112  9e-24  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0315218  normal  0.0664489 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0203  D-alanyl-alanine synthetase A  27.04 
 
 		 364 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1004  D-alanyl-alanine synthetase A  29.14 
 
 		 360 aa  112  1.0000000000000001e-23  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714352 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0523  D-alanine/D-alanine ligase  28.75 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.346273  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0232  D-alanyl-alanine synthetase A  28.21 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2143  D-alanyl-alanine synthetase A  27.46 
 
 		 367 aa  111  2.0000000000000002e-23  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.233091  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0279  D-alanyl-alanine synthetase A  28.88 
 
 		 361 aa  110  3e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0011  D-alanine--D-alanine ligase  29.04 
 
 		 365 aa  110  3e-23  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.133339  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0265  D-alanyl-alanine synthetase A  28.21 
 
 		 361 aa  110  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1929  D-alanyl-alanine synthetase A  27.99 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1975  D-alanyl-alanine synthetase A  27.99 
 
 		 371 aa  110  4.0000000000000004e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.916646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8041  D-alanyl-alanine synthetase A  27.7 
 
 		 394 aa  110  5e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0223  D-alanyl-alanine synthetase A  28.88 
 
 		 362 aa  110  5e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0219  D-alanyl-alanine synthetase A  28.21 
 
 		 361 aa  109  6e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5988  D-alanyl-alanine synthetase A  27.39 
 
 		 355 aa  109  6e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0217  D-alanyl-alanine synthetase A  28.21 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5065  D-alanyl-alanine synthetase A  29.01 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.250957  normal  0.846892 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0257  D-alanyl-alanine synthetase A  28.21 
 
 		 361 aa  109  7.000000000000001e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0272  D-alanine/D-alanine ligase  25.37 
 
 		 351 aa  109  9.000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.472493  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1909  D-alanyl-alanine synthetase A  28.4 
 
 		 371 aa  108  1e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.667964  normal  0.68001 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2385  D-alanyl-alanine synthetase A  27.46 
 
 		 368 aa  108  2e-22  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3791  D-alanine--D-alanine ligase  27.43 
 
 		 370 aa  107  2e-22  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.100262  normal  0.807199 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1272  D-alanine--D-alanine ligase  27.3 
 
 		 368 aa  107  2e-22  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.390278  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2039  D-alanyl-alanine synthetase A  30.91 
 
 		 364 aa  107  2e-22  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000143922  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0494  D-alanine--D-alanine ligase  33.94 
 
 		 305 aa  107  2e-22  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.922593  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0260  D-alanyl-alanine synthetase A  29.19 
 
 		 361 aa  107  2e-22  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.649407  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0477  D-alanyl-alanine synthetase A  28.31 
 
 		 378 aa  107  2e-22  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.0000107455  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1232  D-alanyl-alanine synthetase A  27.5 
 
 		 366 aa  107  3e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0514331  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0661  D-alanine/D-alanine ligase  27.88 
 
 		 324 aa  107  3e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.435945  normal  0.336706 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1664  D-alanine--D-lactate ligase  29.26 
 
 		 341 aa  107  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0360  D-alanyl-alanine synthetase A  25.58 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7137  D-alanine--D-lactate ligase  27.66 
 
 		 348 aa  107  4e-22  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.137191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0084  D-alanine--D-alanine ligase  32.05 
 
 		 340 aa  107  4e-22  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0511  D-alanine/D-alanine ligase  34.74 
 
 		 305 aa  107  4e-22  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1529  D-alanyl-alanine synthetase A  33.21 
 
 		 363 aa  106  5e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4988  D-alanine/D-alanine ligase  26.77 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.467567  normal  0.084905 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1414  D-alanine/D-alanine ligase  29.06 
 
 		 346 aa  106  5e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1271  D-alanyl-alanine synthetase A  27.78 
 
 		 353 aa  106  6e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.537127  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0143  bifunctional D-alanyl-alanine synthetase A/UDP-N-acetylmuramate--L-alanine ligase  30.72 
 
 		 833 aa  105  1e-21  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.714064  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0337  D-alanine/D-alanine ligase  29.58 
 
 		 322 aa  105  2e-21  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0633  D-alanyl-alanine synthetase A  28.74 
 
 		 371 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0905  D-alanyl-alanine synthetase A  30.12 
 
 		 360 aa  105  2e-21  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0849  D-alanyl-alanine synthetase A  26.25 
 
 		 350 aa  105  2e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.37801  normal  0.165136 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3887  D-alanine--D-alanine ligase  27.22 
 
 		 308 aa  105  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0809283  normal  0.435651 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1586  D-alanine--D-alanine ligase  26.79 
 
 		 377 aa  105  2e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.0347832 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_09160  D-alanyl-alanine synthetase A  30.06 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.616014 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0104  D-alanyl-alanine synthetase A  25.94 
 
 		 352 aa  103  3e-21  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0436954 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1485  D-alanine/D-alanine ligase  26.97 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.209909  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1427  D-alanyl-alanine synthetase A  26.79 
 
 		 373 aa  103  4e-21  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4219  D-alanyl-alanine synthetase A  25.37 
 
 		 367 aa  103  4e-21  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.899986  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10770  D-alanine--D-alanine ligase  26.67 
 
 		 376 aa  103  5e-21  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.309547  normal  0.44685 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1084  D-alanyl-alanine synthetase A  27.41 
 
 		 367 aa  103  6e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3791  D-alanine--D-alanine ligase  27.68 
 
 		 353 aa  102  9e-21  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3066  D-alanine--D-alanine ligase  33.48 
 
 		 316 aa  102  1e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3971  D-alanine--D-alanine ligase  36.44 
 
 		 310 aa  102  1e-20  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>