70 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1146 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1146  putative disulfide oxidoreductase  100 
 
 
210 aa  427  1e-119  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0003  putative disulfide oxidoreductase  80.49 
 
 
206 aa  356  9.999999999999999e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00637775  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0434  putative disulfide oxidoreductase  60.4 
 
 
215 aa  272  2.0000000000000002e-72  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.679681  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1381  putative disulfide oxidoreductase  56.65 
 
 
231 aa  254  5e-67  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00111662  normal  0.0714776 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1437  putative disulfide oxidoreductase  55.83 
 
 
224 aa  251  7e-66  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.260766 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3452  putative disulfide oxidoreductase  55.56 
 
 
225 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3380  putative disulfide oxidoreductase  55.56 
 
 
225 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3445  putative disulfide oxidoreductase  55.56 
 
 
225 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3547  putative disulfide oxidoreductase  55.56 
 
 
225 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.668443 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3375  putative disulfide oxidoreductase  55.56 
 
 
225 aa  238  4e-62  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3335  putative disulfide oxidoreductase  52.53 
 
 
218 aa  230  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0952  putative disulfide oxidoreductase  50.48 
 
 
261 aa  215  4e-55  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.147745  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1014  putative disulfide oxidoreductase  50 
 
 
261 aa  214  5.9999999999999996e-55  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.00012022  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0881  putative disulfide oxidoreductase  48.56 
 
 
264 aa  211  4.9999999999999996e-54  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.554065  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1623  disulfide bond formation protein B  41.06 
 
 
215 aa  179  2.9999999999999997e-44  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3870  disulfide bond formation protein  39.07 
 
 
212 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4024  disulphide bond formation protein DsbB  38 
 
 
211 aa  111  8.000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4029  disulphide bond formation protein DsbB  38 
 
 
207 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0235  disulfide bond formation protein  37.09 
 
 
211 aa  108  4.0000000000000004e-23  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4000  disulfide bond formation protein  36.11 
 
 
212 aa  105  6e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal  0.0837638 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1741  disulphide bond formation protein DsbB  34.04 
 
 
169 aa  70.9  0.00000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0624  disulfide bond formation protein B  31.85 
 
 
206 aa  70.9  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  unclonable  0.000000000750855  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1633  disulphide bond formation protein DsbB  31.43 
 
 
175 aa  69.3  0.00000000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000198857  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1492  disulfide bond formation protein B  30.25 
 
 
173 aa  65.5  0.0000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.028843  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2440  disulfide bond formation protein B  30.46 
 
 
172 aa  65.1  0.0000000007  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000318191  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2691  disulfide bond formation protein B  29.14 
 
 
169 aa  65.1  0.0000000008  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000294501  normal  0.182741 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2796  disulphide bond formation protein DsbB  29.14 
 
 
171 aa  64.7  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.462221  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1926  disulfide bond formation protein B  28 
 
 
169 aa  63.5  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00145643  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2514  disulfide bond formation protein B  27.63 
 
 
177 aa  63.9  0.000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000563351  normal  0.732861 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1776  disulfide bond formation protein B  29.93 
 
 
179 aa  62.8  0.000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000776232  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1769  disulfide bond formation protein B  29.25 
 
 
179 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00798262  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2509  disulfide bond formation protein B  29.25 
 
 
175 aa  62.4  0.000000005  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00306638  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1813  disulfide bond formation protein B  29.25 
 
 
179 aa  62  0.000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0184857  normal  0.431807 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1633  disulfide bond formation protein B  29.38 
 
 
175 aa  60.8  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.230127  normal  0.158869 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1566  disulfide bond formation protein B  28.75 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0244803  normal  0.842477 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1641  disulfide bond formation protein B  28.75 
 
 
175 aa  59.7  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.27024  hitchhiker  0.00453379 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1660  disulfide bond formation protein B  35.14 
 
 
185 aa  59.3  0.00000004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.153074  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2149  disulfide bond formation protein B  34.15 
 
 
171 aa  58.5  0.00000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.561613  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2176  disulfide bond formation protein B  30.37 
 
 
171 aa  58.5  0.00000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000107057  hitchhiker  0.0087619 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1681  disulfide bond formation protein B  28.47 
 
 
188 aa  57.8  0.0000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.058826  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2887  disulfide bond formation protein B  27.21 
 
 
175 aa  56.6  0.0000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3513  disulfide bond formation protein B  30.19 
 
 
172 aa  55.1  0.0000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.692084  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1949  disulfide bond formation protein B  27.86 
 
 
176 aa  54.3  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.291757  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2365  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00370125  normal  0.521298 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2001  disulfide bond formation protein B  28.17 
 
 
181 aa  53.9  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0912116  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_07000  disulfide bond formation protein  28.37 
 
 
169 aa  54.3  0.000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01146  disulfide bond formation protein B (Disulfide oxidoreductase)  24.51 
 
 
175 aa  53.9  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2005  disulfide bond formation protein B  27.14 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.506556  normal  0.704676 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1326  disulfide bond formation protein B  27.14 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000420018  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1511  disulfide bond formation protein B  27.14 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.301751  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1945  disulfide bond formation protein B  27.14 
 
 
176 aa  53.5  0.000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0468661  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2111  disulfide bond formation protein B  28.37 
 
 
213 aa  52.8  0.000003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0641  disulfide bond formation protein  27.07 
 
 
169 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1672  disulfide bond formation protein B  27.66 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0029365  normal  0.845186 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2367  disulfide bond formation protein B  26.71 
 
 
178 aa  51.2  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000000380886  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1330  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000164029  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2001  disulfide bond formation protein B  28.37 
 
 
176 aa  50.1  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.0000986099  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2463  Disulphide bond formation protein DsbB  27.34 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  2.15548e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01170  hypothetical protein  27.34 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21  Bacteria  unclonable  0.000000461465  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1343  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 
176 aa  50.1  0.00003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000257632  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1964  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000143241  normal  0.740746 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2440  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000139954  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1288  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  9.7249e-17  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01160  disulfide bond formation protein B  27.34 
 
 
176 aa  49.7  0.00003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  unclonable  0.000000659923  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1985  disulfide bond formation protein B  28.26 
 
 
176 aa  49.3  0.00004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0344968  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2750  disulfide bond formation protein B  27.44 
 
 
176 aa  48.1  0.00008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000000000229834  hitchhiker  0.000131447 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02931  disulfide bond formation protein B  25.49 
 
 
178 aa  45.8  0.0004  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002977  thiol:disulfide oxidoreductase DsbB required for DsbA reoxidation  24.11 
 
 
178 aa  43.9  0.002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2242  disulfide bond formation protein B  28.3 
 
 
176 aa  42.4  0.005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000160562  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1946  disulfide bond formation protein B  29.25 
 
 
176 aa  42  0.007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000445956  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>