More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1049 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1049  biopolymer transport ExbD protein  100 
 
 		 133 aa  263  8e-70  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0173  biopolymer ExbD/TolR family transporter  52.38 
 
 		 136 aa  135  2e-31  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.311198  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0389  biopolymer transport protein ExbD  44.26 
 
 		 141 aa  106  1e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.627769  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0346  biopolymer transport protein ExbD  43.44 
 
 		 141 aa  104  5e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3760  TonB system transport protein ExbD  41.86 
 
 		 139 aa  103  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4210  TonB system transport protein ExbD type-1  41.8 
 
 		 142 aa  100  5e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5556  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 		 142 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0592  biopolymer transport protein ExbD  45.76 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0267  biopolymer transport protein ExbD  45.76 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.134786  normal  0.162508 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0673  biopolymer transport protein ExbD  45.76 
 
 		 143 aa  99.4  1e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.717059  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0068  TonB system transport protein ExbD  41.03 
 
 		 141 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0204  biopolymer transport protein ExbD  41.03 
 
 		 141 aa  97.1  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3597  TonB system transport protein ExbD  38.76 
 
 		 139 aa  95.9  2e-19  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1242  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.55 
 
 		 146 aa  95.1  3e-19  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0853044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5355  biopolymer transport protein ExbD  43.22 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.610359  normal  0.681563 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0166  biopolymer transport protein ExbD  43.22 
 
 		 142 aa  94.7  3e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0981914 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5307  biopolymer transport protein ExbD  43.22 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.153689 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5216  biopolymer transport protein ExbD  43.22 
 
 		 142 aa  94.7  4e-19  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.421083 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0748  biopolymer transport protein ExbD/TolR  42.37 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4274  TonB system transport protein ExbD type-1  41.03 
 
 		 164 aa  94.7  4e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0093154 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3406  biopolymer transport protein ExbD  42.86 
 
 		 141 aa  92.8  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.479649 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4003  biopolymer transport protein ExbD/TolR  44.35 
 
 		 145 aa  92.8  1e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3416  biopolymer transport protein ExbD  38.4 
 
 		 141 aa  92  2e-18  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3332  biopolymer transport protein ExbD  42.06 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3507  biopolymer transport protein ExbD  42.06 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0374  TonB system transport protein ExbD type-1  40.17 
 
 		 141 aa  92  3e-18  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3412  biopolymer transport protein ExbD  42.06 
 
 		 141 aa  91.7  3e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02879  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0693  TonB system transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3184  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4316  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02829  hypothetical protein  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0234  TonB system transport protein ExbD  40.52 
 
 		 177 aa  91.3  4e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.617554 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3433  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3474  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0690  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3290  biopolymer transport protein ExbD  40 
 
 		 141 aa  91.3  4e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3341  biopolymer transport protein ExbD  40.8 
 
 		 141 aa  90.9  5e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.620363 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2419  TonB system transport protein ExbD  39.66 
 
 		 145 aa  90.5  8e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1433  TonB system transport protein ExbD  43.7 
 
 		 145 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.584969  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0704  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.68 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.486388 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2039  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.68 
 
 		 156 aa  89  2e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.827879  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1981  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.83 
 
 		 157 aa  89  2e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0594702  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0857  biopolymer transport protein ExbD/TolR  39.84 
 
 		 139 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.345374  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2719  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.38 
 
 		 151 aa  88.2  3e-17  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.746273  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4650  TonB system transport protein ExbD  41.03 
 
 		 145 aa  88.6  3e-17  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.404384 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3514  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.72 
 
 		 151 aa  88.6  3e-17  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.262132  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1656  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.98 
 
 		 151 aa  88.2  4e-17  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4541  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.67 
 
 		 142 aa  86.7  9e-17  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2212  biopolymer transport TolR  35.66 
 
 		 140 aa  87  9e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.000000000948089  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4429  protein TolR  36.97 
 
 		 173 aa  86.3  1e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.681247 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1255  TonB system transport protein ExbD type-1  40.52 
 
 		 169 aa  86.7  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.51439  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3309  TonB system transport protein ExbD  40.17 
 
 		 141 aa  86.7  1e-16  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.537817  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0937  biopolymer transport protein ExbD/TolR  41.03 
 
 		 145 aa  86.7  1e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10620  TonB system transport protein ExbD  39.32 
 
 		 141 aa  85.5  2e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.160821  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.07 
 
 		 144 aa  85.9  2e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0347505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0748  protein TolR  36.22 
 
 		 155 aa  85.5  2e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.031429  normal  0.177174 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2163  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 131 aa  85.1  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0401461  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1147  TonB system transport protein ExbD type-1  40.17 
 
 		 141 aa  84.7  3e-16  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.103894  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1132  TonB system transport protein ExbD  41.18 
 
 		 157 aa  85.1  3e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1851  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.85 
 
 		 145 aa  84.7  3e-16  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3640  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.14 
 
 		 150 aa  84.7  3e-16  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2370  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000201992  normal  0.146866 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2533  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 		 144 aa  85.1  3e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000432796  normal  0.100758 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2995  biopolymer transport protein ExbD/TolR  40.32 
 
 		 142 aa  84.3  5e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.310145  normal  0.213252 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1460  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.16 
 
 		 158 aa  84  6e-16  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1092  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.07 
 
 		 166 aa  84  7e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0197  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.1 
 
 		 145 aa  83.6  9e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.058797  normal  0.711097 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0825  TonB system transport protein ExbD  37.93 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.027584 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2229  inner membrane protein  36.21 
 
 		 141 aa  82.8  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.243191  normal  0.205918 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2580  biopolymer transport protein ExbD/TolR  38.79 
 
 		 141 aa  83.2  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.25042  normal  0.920318 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2418  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.15 
 
 		 144 aa  83.2  0.000000000000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0027  TolR protein  30.4 
 
 		 139 aa  82.4  0.000000000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.200658  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4753  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.92 
 
 		 149 aa  82  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2358  biopolymer transport protein ExbD/TolR  43.09 
 
 		 145 aa  82.8  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.309044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0745  protein TolR  36 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000786072  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3538  biopolymer transport protein ExbD/TolR  29.6 
 
 		 139 aa  81.3  0.000000000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000000031299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3058  biopolymer transport TolR  34.88 
 
 		 152 aa  81.3  0.000000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0312035  normal  0.159163 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0861  protein TolR  32.31 
 
 		 152 aa  80.9  0.000000000000005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.0000417761  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0671  ExbD/TolR family protein  35.48 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045773  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5529  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.8 
 
 		 140 aa  80.5  0.000000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2324  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 156 aa  80.9  0.000000000000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0663066  normal  0.292388 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1587  protein TolR  35.2 
 
 		 138 aa  80.5  0.000000000000007  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.437138  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2120  biopolymer transport TolR  31.71 
 
 		 152 aa  80.5  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0523748  normal  0.245656 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0560  biopolymer transport protein ExbD/TolR  35.48 
 
 		 156 aa  80.5  0.000000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3053  biopolymer transport protein ExbD/TolR  34.13 
 
 		 136 aa  79.7  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5983  TonB system transport protein ExbD  39.66 
 
 		 155 aa  79.7  0.00000000000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.241351  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1783  protein TolR  33.83 
 
 		 144 aa  79.7  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000043737  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1147  Biopolymer transport protein ExbD/TolR  37.19 
 
 		 140 aa  79.3  0.00000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2442  biopolymer transport protein ExbD/TolR  36.09 
 
 		 144 aa  80.1  0.00000000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00000689995  normal  0.227653 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0684  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32.03 
 
 		 154 aa  78.6  0.00000000000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.508331  normal  0.11063 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0105  TonB system transport protein ExbD, putative  35.25 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.664696  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2135  biopolymer transport, TolR  34.43 
 
 		 167 aa  78.6  0.00000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2026  biopolymer ExbD/TolR family transporter  32.81 
 
 		 142 aa  79.3  0.00000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.597145  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0145  TonB system transport protein ExbD, putative  35.25 
 
 		 129 aa  79  0.00000000000002  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000057869  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1605  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 		 144 aa  79.3  0.00000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000781876  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3544  biopolymer transport protein ExbD  38.79 
 
 		 156 aa  78.6  0.00000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2225  biopolymer transport protein ExbD/TolR  32 
 
 		 142 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.361252  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2239  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.33 
 
 		 140 aa  78.2  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1744  biopolymer transport protein ExbD/TolR  33.83 
 
 		 144 aa  78.6  0.00000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000276409  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>