122 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CCV52592_1030 on replicon NC_009715
Organism: Campylobacter curvus 525.92



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009715  CCV52592_1030  50S ribosomal protein L23  100 
 
 		 93 aa  184  4e-46  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000430849  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0353  50S ribosomal protein L23  90.32 
 
 		 93 aa  173  7e-43  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  unclonable  0.0000019966  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0036  50S ribosomal protein L23  84.95 
 
 		 93 aa  163  5.9999999999999996e-40  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  hitchhiker  0.00020756  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0061  50S ribosomal protein L23  81.72 
 
 		 93 aa  160  6e-39  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000483414  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1702  50S ribosomal protein L23  83.87 
 
 		 93 aa  159  1e-38  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000496686  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE1873  50S ribosomal protein L23  82.8 
 
 		 93 aa  158  2e-38  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.0703084  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_2079  50S ribosomal protein L23  82.8 
 
 		 93 aa  157  3e-38  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  hitchhiker  0.000000138255  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0086  50S ribosomal protein L23  80.65 
 
 		 93 aa  150  5e-36  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  hitchhiker  0.00130927  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1966  50S ribosomal protein L23  70.97 
 
 		 93 aa  140  8e-33  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.0000855171  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0288  50S ribosomal protein L23  64.44 
 
 		 93 aa  133  8e-31  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  hitchhiker  0.00767163  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1944  50S ribosomal protein L23  40.66 
 
 		 113 aa  61.2  0.000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0248  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.529844  normal  0.684158 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2164  50S ribosomal protein L23  41.98 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.561642 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2442  50S ribosomal protein L23  41.98 
 
 		 98 aa  60.5  0.000000008  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.369477  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1616  50S ribosomal protein L23  39.51 
 
 		 98 aa  60.1  0.000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.129787 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2968  50S ribosomal protein L23  38.46 
 
 		 111 aa  60.1  0.000000009  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.307651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0585  50S ribosomal protein L23  39.76 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.720688 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2125  50S ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 98 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.966187  normal  0.432558 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2220  50S ribosomal protein L23  41.98 
 
 		 98 aa  59.3  0.00000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1910  50S ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 98 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  decreased coverage  0.000483337  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0351  50S ribosomal protein L23  40.74 
 
 		 98 aa  57.8  0.00000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.368334  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1231  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.244915  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2686  50S ribosomal protein L23  38.82 
 
 		 104 aa  55.8  0.0000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0258195  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1194  50S ribosomal protein L23  39.24 
 
 		 97 aa  55.5  0.0000002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.79866  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0278  50S ribosomal protein L23  38.55 
 
 		 98 aa  55.5  0.0000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1958  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0171198  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1522  Ribosomal protein L25/L23  39.33 
 
 		 94 aa  55.1  0.0000004  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.800617  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0325  Ribosomal protein L25/L23  30.12 
 
 		 97 aa  55.1  0.0000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000179883  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1676  50S ribosomal protein L23  36.96 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62104  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2816  50S ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 102 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.947427  normal  0.439693 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2738  ribosomal protein L25/L23  37.04 
 
 		 96 aa  52.4  0.000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.217238  normal  0.259663 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0400  Ribosomal protein L25/L23  36.47 
 
 		 98 aa  52  0.000003  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1432  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.11483  normal  0.0319487 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1334  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 		 97 aa  51.6  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.212671  normal  0.17449 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1251  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 100 aa  50.4  0.000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.781143  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1865  50S ribosomal protein L23  34.78 
 
 		 95 aa  50.4  0.000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0212066  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0988  50S ribosomal protein L23  33.7 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.137365  normal  0.02544 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1793  50S ribosomal protein L23  35.8 
 
 		 98 aa  49.7  0.00001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.346044  normal  0.0641385 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0769  50S ribosomal protein L23  36.71 
 
 		 94 aa  49.3  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000223701  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0491  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000310283  hitchhiker  0.00323784 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0486  50S ribosomal protein L23  35.29 
 
 		 116 aa  49.3  0.00002  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  unclonable  0.000000945976  normal  0.0263712 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1351  50S ribosomal protein L23  36.25 
 
 		 104 aa  49.3  0.00002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.144858 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0758  50S ribosomal protein L23  34.62 
 
 		 99 aa  49.7  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000156644  normal  0.0173378 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0871  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 		 100 aa  48.5  0.00003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0761  50S ribosomal protein L23  32.91 
 
 		 98 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0679128  normal  0.485655 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1681  50S ribosomal protein L23  34.12 
 
 		 102 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0570438  hitchhiker  0.0000115816 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0288  Ribosomal protein L25/L23  36.71 
 
 		 94 aa  47.8  0.00005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0208072  normal  0.0234601 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3446  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 		 99 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.947767  normal  0.59426 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0721  50S ribosomal protein L23  36.36 
 
 		 97 aa  47  0.00008  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.0000131875  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2855  50S ribosomal protein L23  35.71 
 
 		 94 aa  46.6  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0878449  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4542  50S ribosomal protein L23  32.43 
 
 		 100 aa  46.2  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00000000172317  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1842  50S ribosomal protein L23  32.61 
 
 		 97 aa  46.6  0.0001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00948056  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2370  ribosomal protein L23  32.94 
 
 		 97 aa  45.8  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.408487  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0668  50S ribosomal protein L23  36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000142276  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0700  50S ribosomal protein L23  36 
 
 		 97 aa  46.2  0.0002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000143862  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0428  50S ribosomal protein L23  33.71 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000291057  decreased coverage  0.00000564548 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0717  Ribosomal protein L25/L23  37.5 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03169  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000759178  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0395  Ribosomal protein L25/L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000225919  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03120  hypothetical protein  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000565358  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3512  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000000392959  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3801  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000749996  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0395  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.0000080861  hitchhiker  0.00030352 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3613  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00000847098  hitchhiker  0.00309782 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3703  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000225733  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4641  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0287124  normal  0.0460173 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1366  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 		 98 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.263915  normal  0.542737 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3749  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0000048697  hitchhiker  0.00429034 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1069  50S ribosomal protein L23  32.95 
 
 		 94 aa  44.7  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000947106  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3913  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  unclonable  1.78804e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0586  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000000108369  normal  0.186609 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0285  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  45.1  0.0004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.000000248684  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3707  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.000802937  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3742  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.344368  normal  0.0150111 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3634  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  hitchhiker  0.00980054  normal  0.223242 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3634  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000000793915  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3805  50S ribosomal protein L23  31.08 
 
 		 100 aa  44.7  0.0004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000686351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5068  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.509861  normal  0.304969 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0610  50S ribosomal protein L23  34.52 
 
 		 96 aa  43.9  0.0007  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0411  50S ribosomal protein L23  37.97 
 
 		 96 aa  43.5  0.0009  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.727367  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3433  Ribosomal protein L25/L23  34.72 
 
 		 103 aa  43.5  0.0009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2297  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.192968 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1547  50S ribosomal protein L23  34.57 
 
 		 98 aa  43.5  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0325  50S ribosomal protein L23  29.73 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000118373  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1125  Ribosomal protein L25/L23  36.99 
 
 		 98 aa  43.1  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0407  50S ribosomal protein L23  29.73 
 
 		 100 aa  43.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00180319  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0227  ribosomal protein L25/L23  31.65 
 
 		 95 aa  43.1  0.001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3665  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  43.5  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3705  50S ribosomal protein L23  34.09 
 
 		 110 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3756  Ribosomal protein L25/L23  32.95 
 
 		 101 aa  43.1  0.001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.267631  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0584  50S ribosomal protein L23  30.38 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.746591  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3820  50S ribosomal protein L23  29.73 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.0000460172  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3182  50S ribosomal protein L23  33.33 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3522  ribosomal protein L25/L23  31.08 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  hitchhiker  0.00000457129  hitchhiker  0.00000622944 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2172  50S ribosomal protein L23  31.65 
 
 		 100 aa  42.7  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000267938  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2167  Ribosomal protein L25/L23  32.18 
 
 		 98 aa  42.4  0.002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00207145  normal  0.264777 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3999  50S ribosomal protein L23  29.73 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.0000101961  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17140  50S ribosomal protein L23  30.67 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.538328  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0330  ribosomal protein L23  32.43 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3921  ribosomal protein L25/L23  30.11 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>